• Santé - Séquence, ADN, Phosphate

[Génétique] Hybridation ADN-ARN !

Ensuite, on révèle la sonde (détection de sa radioactivité, activation de sa fluorescence) et l'on peut savoir quelles cellules ont synthétisé l'ARN, donc quelles cellules expriment ce gène.   [...] le but dans une hybridation in situ c'est de voir si l'arn est present. on met l'adn avec une sequence qui est complémentaire à l'arn qu'on veut suivre. cet adn qu'on a marqué soit par un phosphate radioactif soir par un un groupement qui est reconnu par un anticorps couplé à un fluorochrome.  [...]

comment fonctionne un séquençage d'ADN ?

J'ai peu de connaissances sur l'ADN, si ce n'est que son nom entier est acide désoxyribonucléique, que la séquence de nucléotide détermine un certain caractère, qu'un nucléotide est composé d'une base azotée, un groupement phosphate et un sucre, le désoxyribose et ces nucléotides sont complémentaires.  [...] Pour l'identification des gènes cela vient après le séquençage. Il est possible de repérer des séquences d'ADN spécifiques aux gènes (séquence d'initiation, séquence de terminaison...).  [...]

[L1]Formule développée et complémentarité base ADN.

Ensuite j'ai un exercice similaire ou on me dit pour chacun de ces fragments d'ADN donnez son orientation,ainsi que la séquence et l'orientation du brin complémentaire.  [...] Donc dés qu'on dit ATCG, on simplifie en ne disant que les bases. Tu dois donc écrire la formule développée en remplaçant chaque composant du nucléotide (La base, le sucre et le phosphate) par sa formule chimique. (Cherche un peu ça tu devrais trouver, et reviens si tu galères trop.).  [...]

[Biochimie] la replication

Les dNMPs sont des desoxynucléotides monophosphate. En effet, dans une séquence d'ADN les nucléotides n'ont qu'un phosphate (dNMPs) permettant de faire la liaison phosphodiester avec l'OH du nucléotide suivant.  [...] Le dN de dNTP c'est pour desoxynucléotide. Quand on parle de dNTP c'est que l'on ne souhaite pas s'intéresser à l'un ou l'autre en particulier. dNMP c'est un desoxynucléotide mono phosphate. C'est aussi simple que cela.  [...]

Enzyme de restriction

Ta réponse n'est pas bonne. L'amorce est le 3'OH crée par la coupure, l'ADN pol va pouvoir recopier les quelques nucléotides qui sortent. MAIS l'ADN pol n'est capable de synthétiser l'ADN QUE de 3'-. 5'. Autrement dit elle ne peut amorcer la réaction qu'a partir d'un 3'OH et pas d'un 5' phosphate.  [...] La seule lecture possible est 3'G-5' car j'ai bien un 3'OH lié à la coupure. La séquence 5'GATCC-3' ne peut être lue car le site de coupure correspond à un 5' phosphate.  [...]

[Biochimie] ADN: pKa du groupement phosphate, acidité etc.

Deuxième question.On dit dans mon cours de bioch que le phosphate impliqué dans un acide nucléique a deux pKa. un à 2 et un à 7 (un pour chaque fonction acide), puisque le pH physiologique est égal à 7 (J'arrondis les pH comme mon prof le fait dans mon cours), le premier groupe OH va s'ioniser en laissant partir son H+ et donc devenir une base conjuguée, le deuxième OH a un pKa= au pH, dans ce cas il devrait y avoir autant de forme basique qu'acide.  [...] Deuxième question. N'oublie pas que dans l'ADN deux fonction -OH du phosphate font une liaison ester (neutre) avec les sucres. Donc au final on a qu'une seul charge négative dans notre polynucléotide sauf au niveau des extrémités ou on a deux charges négatives.  [...]

enzymes de restriction

1) exemple avec l'enzyme BamHI qui coupe dans la séquence 5'-G*GATCC-3'. L'enzyme va couper la liaison covalente phosphodiester entre les 2 G de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' exposé et un groupe hydroxyle 3' en retrait. On parle alors d'une extrémité collante 5' (5' cohesive ends, ou 5' overhang ou surplomb 5').  [...] 2) exemple avec l'enzyme Sac I qui coupe dans la séquence 5'-GAGCT*C-3'. L'enzyme va couper la liaison phosphodiester entre le T et le C de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' en retrait et un groupe hydroxyle 3' exposé. On parle alors d'une extrémité collante 3' (3' cohesive ends, ou 3' overhang ou surplomb 3').  [...]

Définition | Désoxyribose | Futura Santé

Un nucléotide de l'ADN (ou désoxyribonucléotide) comprend trois éléments. une base azotée purique ou pyrimidique, un désoxyribose et un groupement phosphate. Dans l'ADN, le phosphate d'un nucléotide est associé au désoxyribose du nucléotide suivant. chaque phosphate relie le groupement OH (hydroxyle) du carbone 3' du désoxyribose d'un nucléotide à l'hydroxyle du carbone 5' du désoxyribose du nucléotide suivant.  [...] La molécule d'ADN comprend deux brins. le squelette composé d'une succession de désoxyriboses et de groupements phosphate forme le bord externe. au milieu, les paires de bases azotées reliées au désoxyribose retiennent les deux brins ensemble grâce à des liaisons hydrogène.  [...]

Telomere et telomerase

Il y a une grosse erreur pour commencer. Les télomères sont bien des séquences répétitives non codantes mais elles ne sont pas composées d'acides aminés. Ce sont des séquences d'ADN puisque localisées aux extrémités des chromosomes, ce sont des séquences de désoxyribonucléotides (une base azotée, un sucre le désoxyribose ici et un phosphate pour donner le nucléotide complet).  [...] du en grande partie à une longue séquence de télomères) cellule somatique jeune, cellule somatique vieille, cellule souche/cellule germinal, cellule cancéreuse.  [...]

liaison phosphodiester

je voudrais savoir a quoi correspond une liaison phosphodiester, est ce que cela correspond à (C) _O_(POO) donc juste ce qui n'est pas entre parenthése ou juste O_POO ou juste C_O.  [...] La structure primaire de l'ADN contient la liaison phosphodiester. Il s'agit de 2 groupements phosphate chaqun lié par une liaison ester au sucre.  [...]