• Santé - Séquence, ADN, Moyenne

[Génétique] unité fonctionnelle de la chromatine

dans notre cours c'est écrit que la rosette est l'unité fonctionnelle de la chromatine (l'unité de transcription) et dans une autre partie que les gènes correspondent à l'unité fonctionnelle de la chromatine.est ce que la rosette represente un gène.   [...] Je crois que là tu as tes réponses Surtout pense aux échelles... Une séquence d'ADN de 2 kb représente la taille moyenne d'un gène. quelle est la taille de l'ADN qui se retrouve dans une rosette.  [...]

[Biochimie] séquence nucléotidique dans brin ADN

est-ce que quelqu'un sait en moyenne, combien de fois peut-on s'attendre à trouver la séquence nucléotidique CGATTG (exemple) dans un brin monocaténaire d'ADN long de 4000 nucléotides.  [...] Donc grosso modo, cette séquence est retrouvée toutes les 4096 bases environ, c'est sa probabilité de présence. Au sein d'une séquence de 4000 bases, on peut considérer qu'il y a de fortes chances de la trouver une fois.  [...]

MS 2 phage RT-PCR Temps réel

Pour cela, il faut la masse molaire de chaque nucléotide et la séquence de ton phage ou au moins leur masse moléculaire moyenne et son nombre de paires de bases.  [...] ou (si tu n'as pas la séquence détaillée). masse moléculaire moyenne d'un nucléotide x nombre de bases (attention si ADN double brin, il faut multiplier par 2).  [...]

[Biologie Moléculaire] [Déf] Exons vs transcrits

Pour moi un exon ça peut être défini de plusieurs manières, pour moi je dirais que c'est ce qui ne correspond pas aux introns dans la séquence de structure de l'ADN. Ca correspond à 230.000 exons au total, à raison de 10 par locus en moyenne (très variable).  [...] je dirais qu'un exon est une séquence d'adn qui est transcrite, codante donc, alors qu'on parle de transcrit pour parler d'arn, ce qui a été transcrit quoi.  [...]

Eve mitochondriale ??

La raison de l'utilisation du Y ou du mitochondrial est d'une part technique (il a été au début plus facile de séquencer les mitochondries, de repérer une séquence variable et la trouver rapidement), et d'autre part, comme indiqué, l'absence de recombinaison.  [...] Pour le second point, je ne pense pas que la moyenne sur tout le génome soit intéressante. Le point pertinent pour l'utilisation de séquences d'ADN nucléaires pour faire des arbres de parenté (remonter à un ancêtre unique pour une séquence par exemple) est qu'il y en ait fortement variables. Et à ce que je comprends il y en a plein.  [...]

Intégration de VIH-1 dans la chromatine: la chute d'un dogme.

Ce système fait intervenir un plasmide dans lequel on a cloné une séquence positionnant les nucléosomes afin de reproduire un polynucléosome après assemblage d'histones. Ce plasmide mime l'ADN cible cellulaire.  [...] On appuie nos résultats in vitro par une analyse in silico de plus de 40 000 sites naturels d'intégration. Cette analyse est un algorithme de prédiction de positionnement de nucléosome en fonction de la séquence d'ADN, et on trouve que la moyenne des sites se trouve dans une région faiblement dense en nucléosome.  [...]

[Biotechnologie] séquençage à haut débit

Il permet de séquencer de courts fragments d'ADN (en moyenne, 60 bp pour l'automate commercialisé par Biotage et en moyenne 106 pb sur l'automate 454 commercialisé par Roche), voire, dans certains cas, jusqu'à 200 pb  [...] Le pyroséquençage est beaucoup utilisé pour l'étude de variants alléliques, notamment les polymorphismes bialléliques (SNP).  [...] Au contraire, l'Illumina sera privilégié dans le cadre d'un gros séquençage, par exemple pour le séquençage d'un génome entier. En effet, les séquences déterminées étant bien plus longue que celles obtenues par pyroséquençage, il sera plus facile de reconstituer la séquence génomique.  [...]

[Biologie Cellulaire] question sur les séquences consensus

Une séquence consensus est une séquence moyenne qui résulte de la comparaison d'un grand nombre de séquence dont la fonction est identique.  [...] Par exemple. les sites de fixation d'une protéine. Si il est établie qu'une protéine peut se fixer sur plusieurs séquences d'ADN différentes mais proches, il est possible d'écrire une séquence type. Ainsi, si l'on veut savoir si nos séquences d'intérêt possède le site de fixation pour cette protéine, c'est une séquence consensus que l'on cherche.  [...]

Archéologie : une nouvelle technique rend l'ADN plus bavard

En moyenne, il reste moins de 1 % du génome originel et l'essentiel de l' ADN provient des unicellulaires. En théorie, il est possible de tout séquencer puis de zoomer sur la partie qui intéresse les scientifiques. Mais la démarche est onéreuse et il en résulte un gâchis important qui n'en vaut pas la peine.  [...] Les scientifiques expliquent avoir utilisé de l' ARN plutôt que de l'ADN. Leurs sondes, c'est-à-dire des séquences d' acides nucléiques marquées se liant à des séquences complémentaires, sont capables de couvrir l'ensemble du génome d'un Homme moderne. Elles ont, de plus, été équipées d'un groupe chimique qui leur permet de se fixer à des billes microscopiques.  [...]

[Génétique] Primers

J'ai donc pris sur GenBank 2 séquence du cytb entièrement séquencées, ainsi que 2 séquence du cytb, séquencé pour 385 bp. (pour cette espèces )Jusque là tout va bien. Ma question est la suivante. Afin de vérifier si ces primers sont adaptés à cette partie du cytb, que dois-je faire.  [...] Ton problème à la base, c'est quoi tu veux déterminer la séquence pour voir si elle est différente de la séquence 'normale' moyenne de l'espèce.  [...]