• Santé - Séquence, Acides aminés, Chaîne

Nouveaux peptides anti-infectieux : plus courts et à plus large spectre ?

Les propriétés anti-infectieuses de certains peptides sont aussi le sujet de découvertes intéressantes dans le domaine antibactérien. Dans un article de PNAS du 24 octobre 2006, un groupe a montré qu'il pouvait construire des peptides antibactériens et antifongiques de très petite taille constitués seulement de 4 acides aminés.  [...] Un des acides aminés est remplacé par son énantiomère et une chaîne d' acides gras est attachée à la séquence peptidique. Dans ce cas, comme pour le peptide précédent, la structure en trois dimensions ne semble pas critique pour l'activité anti-infectieuse du peptide.  [...]

Mutation ?

Pour identifier une mutation Ca dépend de pas mal de choses, si tu veux avoir le protocolle détaillé... Mais en général il suffit de séquencer la séquence pour savoir si elle est différente du gène sauvage.  [...] Tu sais aussi que la chaîne polypeptidique découle de la traduction de l'ARN et tu as vu le code génétique. tu as pu voir que certains acides aminés correspondent à plusieurs codons...ainsi un changement de la séquence de l'ARN peut ou pas avoir une conséquence au niveau de la séquence peptidique.  [...]

Le poil animal | Dossier

La kératine est produite par les kératinocytes, cellules de l'épiderme. On observe dans les kératines une concentration élevée de cystéine, un acide aminé soufré (14 à 16 % de la masse totale des acides aminés) et une faible teneur en hydroxyproline et lysine.  [...] La forme hélicoïdale de la chaîne polypeptidique avec une séquence moyenne de 3,6 acides aminés par enroulement. La structure hélicoïdale de la molécule de kératine contribue notablement à sa solidité. La kératinisation est un processus continu depuis les cellules souches, tout au long de la maturation cellulaire, de la profondeur vers la superficie.  [...]

Causes de la polyarthrite rhumatoïde | Dossier

Les molécules de classe II du CMH servent à présenter des peptides étrangers. elles comprennent deux polypeptides, un &alpha. et un &beta.. Les chaînes de ces polypeptides sont codées par différents gènes, dont les gènes DR. Au niveau de la région codant les gènes DR, les allèles DR4 et DR1 semblent favoriser l'apparition de la polyarthrite rhumatoïde.  [...] L'hypothèse de l'existence d'un épitope partagé a été émise. les allèles DR4, DR1, mais aussi DR10 codent pour une séquence protéique similaire au niveau des acides aminés 70 à 74 de la chaîne &beta., respectivement QRRAA, KRRAA et RRRAA. Ceci suggère que la maladie pourrait être déclenchée par la présentation d'un peptide particulier par ces molécules de CMH.  [...]

[Biologie Moléculaire] feuillet beta

je dispose d'un peptide sous forme d'une série d'acides aminés, on me demande de prédire l'éventuelle formation de feuillet B, comment procéder est-ce que le fait qu'il y est une succession d'aa chargés et hydrophobes au début suffit a prouver que c'est les 2 faces du feuillet.  [...] Je commencerais par essayer d'identifier les différents brins beta et les turns à partir de la séquence primaire. En effet tu as certains acides aminés qu'on retrouve d'avantage dans telle ou telle structure. Par exemple les régions glycine/sérine sont souvent non structurées (du fait de l'absence de chaine latérale pour l'une et du groupement hydoxyle de l'autre qui interagit très favorablement avec le solvant).  [...]

[Génétique] Exercice 1ère S : insuline

Bon je sais que l'insuline est une hormone sécrétée par les cellules bêta, et qu'elle est constituée de une chaine A et une chaine B.  [...] Je dois établir, en justifiant, la séquence des 10 derniers acides aminés de la chaine B de linsuline chez le sujet sain et chez le sujet diabétique.  [...]

Glycosylation

on n'ajoutepas un sucre mais un polymere sur des groupements aminés de chaine latérale d'acide aminés sur une séquence bien particulière.  [...] Ce polymère de sucre est le même pour toutes les protéines (GlcNac 2 Man 9 Glc 3), et reconnu par des protéines chaperonnes de la lumiere réticulaire. Les protéines chaperonnes reconnaissent une partie proteique et le sucre, si la conformation est bonne, une partie du polyose est hydrolysée, et le processus continue, sinon on essaye de réparer si cela ne fonctionne pas, on envoie en dégradation (voie ERAD pour être précis).   [...]

[Biotechnologie] spectrometrie de masse

Ah ok désolé. Bein pour déduire une séquence en acides aminés, il faut repérer les ions de type b la plupart du temps. On a des fragmentations entre le NH et le CH, entre le CH et le COOH et entre le COOH et le NH dans la chaine principale des peptides. On distingue donc des ions de type a,b,c respectivement lorsque la charge va du côté N terminal, et des ions de type x,y,z respectivement lorsque la charge va du côté C terminal.  [...] Ce qu'il faut avoir a l'esprit, c'est que la masse d'un peptide est statistiquement unique au dela de 6 ou 7 acides amines (je ne sais plus exactement). En comparant les masses des peptides obtenus aux masses theoriques que l'on peut obtenir a partir d'une base de donnees de proteine, on peut identifier ainsi la sequence a partir de la masse (algorithme Mascot).  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 4

22 acides aminés, auxquels s'ajoutent certains acides aminés exotiques qui résultent de remaniements a posteriori (après assemblage de la chaîne polypeptidique) d'acides aminés classiques. pour les bases azotées 5 fondamentales en effet plus des bases exotiques en particulier dans les ARNt.  [...] 22 acides aminés, auxquels s'ajoutent certains acides aminés exotiques qui résultent de remaniements a posteriori (après assemblage de la chaîne polypeptidique) d'acides aminés classiques.  [...]

[Biochimie] Hélice Alpha

- La structure secondaire, qui représente l'organisation de cette chaine d'acides aminés, en hélice alpha ou en feuillet bêta par exemple.  [...] Chaque acide aminé a des propriétés différentes, a cause de son groupement R. Une chaine d'acides aminés, en fonction de leur groupement, peuvent donc avoir tendance à former des domaines différents comme des hélices alpha, présentes par exemple dans l'hémoglobine.  [...]