• Santé - Séquence, Acide aminé, Protéine

[Génétique] Plusieur question?

La question est vague. Si tu possède la séquence nucléotidique, sachant que l'association 3 par 3 des nucléotiques correspond à un acide aminé, il suffit globalement de diviser le nombre de nucléotides par 3. Si tu ne possède que la protéine, il faut alors par exemple faire migrer celle-ci sur un gel SDS-page et vérifier ainsi son poids moléculaire.  [...] je crois que je viens de comprendre voici une séquence nucléotique d'une portion du géne d'une proteine (le brin n'était pas transcrit faut-il don le transcrire pour trouver les acide aminé je sais pas mais je l'ai fait). AAA TTC GAG AGT TGT GTT GAC GTG.  [...]

[Biologie Moléculaire] Régulation de la transcription

En clair, tu as un gène qui code pour une protéine. Dans ce gène tu a la séquence codante (qui donnera par la suite la séquence d'acide aminé (protéine)) et juste avant le promoteur.  [...] Le HRE est une séquence dans le promoteur qui va fixer l'hormone (surement par l'intermédiaire d'une protéine pas directement) et va activer la transcription du gène.  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

voila dans l'article les auteurs ont procéder à une digestion enzymatique d'une protéine par la trypsine et par la Asp N. Ensuite ils ont fait une analyse des peptides par HPLC couplé à un spectromètre de masse en tandem. Ce que j'ai pas compris c'est comment en premier temps on identifie les acides aminé sur le profil d'élution de HPLC et comment on determine l'ordre de chaque acide aminé cad comment savoir que c'est une tyrosine et non une lysine ou cysteine et comment on détermine qu'il ya une tyrosine ensuite une methionine ensuite une leucine dans notre peptide.  [...] Ensuite, il est possible de séquencer ta protéine de façon séquentielle grâce à la méthode d'Edman que j'ai citée avant. Cette méthode va dégrader ta protéine acide aminé par acide aminé. Le produit de la dégradation est analysé et tu peux ainsi déterminer ta séquence d'acides aminés.  [...]

Logiciel Anagène : séquences

2 - Au cours de le traduction on forme de l'ARN qui est une copie de l'ADN ( exemple si sur la sequence de nucléotide ADN on a CTG on aura sur l'ARN. GAC par complémentarité A-T et G-C).  [...] 3- Lors de la trasduction on traduit la séquence nucléotidique de l'ARN en séquence peptidique de la protéine (exemple. ATG donnera par la traduction un acide aminé).  [...]

[Biochimie] protéine

la semaine prochaine j'ai un examen d'un module de protéine et j'ai peur que l'ont me pose la question. quelle est la différence entre les structures de la protéine.  [...] La structure secondaire ce sont les agencement réguliers et répetés des chaines polypeptiques grace à des liaisons hydrogènes entre différents acides aminées (ce qui donne naissance à 2 types de structure. hélicoïdale alpha (confère élasticitée) et feuillet plissé beta (confère rigidité).  [...]

besoin d'aide: restitution de connaissance : du phénotype et protéine

- Une protéine est une molécule constituée d'une ou de plusieurs chaînes d'acides aminés. D'une protéine à l'autre, le nombre total d'acides aminés varie.  [...] Tu dis qu'un changement dans la séquence nucléotidique (c'est à dire l'ADN) entraine un changement dans la séquence en acide aminé (dans la protéine).  [...]

[Biologie Moléculaire] Expression de protéines grâce au pGEX. DH5alpha ou BL21?

J'ai une autre question pour ceux qui ont un peu d'expérience. Jusqu'ici j'ai utilisé un clone qui s'avère produire une protéine avec un acide aminé différent par rapport à la séquence de référence MGI. Ma protéine est hyper conservée dans l'évolution et cet acide aminé modifié se trouve au milieu d'un domaine totalement conservé.  [...] Je suis en train d'analyser de nouveaux clones pour avoir la protéine parfaite. Cependant ma question est. est ce que c'est réellement grave quand on diverge d'un acide aminé dans un domaine conservé Est ce que vous utilisez toujours des clones codant pour des protéines parfaites pas Au contraire, avez vous eu des expériences malheureuses à cause d'une mutation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Marquage fluorescent d'une protéine

Je cherche a réaliser une expérience en FRET pour observer les changements conformationnels qui se produisent dans ma protéine. Pour cela j'ai besoin de la marquer spécifiquement. Je sais que je peux le faire par l'intermédiaire des résidus cystéines, j'ai donc retiré toutes les cys de ma protéine, pour n'en remettre qu'une la ou je le souhaite.  [...] Les autres méthodes d'étude de la conformation d'une protéine (anisotropie de fluorescence, dichroïsme circulaire, spectro de masse douce, digestion ménagée,...) ne sont pas satisfaisantes pour l'étude que tu veux faire En effet la mutation d'un acide aminé quelconque pour étudier une conformation tridimensionnelle me parait moins adapté que d'autres méthodes ne touchant pas à la séquence primaire (mis à part les cas où on mute pour voir l'implication de l'acide aminé dans la conformation spatiale de la protéine, bien entendu).  [...]

[Biochimie] Profil d'hydropathie

Bonjour. Je voudrais savoir comme on peut deduire, a partir d'une profil d'hydropathie, quels sont les acides amines basiques (chargé +) et acides (chargé -).  [...] Un profil d'hydropathie ne permet pas de savoir quel acide aminé (AA) est basique ou acide. Il est utilisé pour déterminer les régions hydrophobes (notamment celles qui peuvent être potentiellement transmembranaires) de ta protéine à partir de sa séquence en AA que tu connais.  [...]

question de synthèse

En cas de disfonctionnement de cette protéine, l'interruption du flux Cl- est responsable de l'augmentaion de viscosité du mucus. Le dysfonctionnement de la protéine provient d'une modificationde sa séquence, le plus souvent la supprésssion d'un acide aminé.  [...] Différents allèles mutés sont connus, codant chacun por des formes différents de la protéine avec des conséquences plus ou moins graves. protéine inactive, non synthétisée ou alors en quantité suffisante.  [...]