• Santé - Séquençage, Génome, Résistance

[Microbiologie] génome-gène de résistance

j'ai travaillé sur la souche de Plesiomonas dans mon stage de mastère,j'ai cherché la localisation de gène de résistance aux betalactamines dans le gènome. Dans la partie discussion (dans la rédaction) je dois discuté un travaille qui a été fait par une équipe,qui ont réalisé un séquençage de génome entier d'une souche de Plesiomonas (serotype O1) et pourtant ils n'ont pas pu déterminer la localisation de gene.  [...] je veux savoir dans qu'elles cas on pourra pas determiner la localisation d'un gene de resistance même avec un sequençage de genome entier.  [...]

gènes de résistance à la vancomycine dans les entérocoques

Est ce que vous avez une idée ou des articles sur ce qui concerne les gènes de résistance à la vancomycine (vanA, vanB, vanC, vanD, vanE, vanL, et vanG) dans les entérocoques résistant à la vancomycine (ERV) ou même comment se déroule leur détection moléculaire.  [...] Pour le séquençage d'un gène de résistance, je suppose que les souches d'ERV sont isolées puis on épluche leur génome - peut-être par KO () couplé à une méthode de séquençage (ex. méthode de Sanger, puce à ADN...).  [...]

[Microbiologie] séquençage de génome bacterien

j'ai lu dans des articles scientifiques,que la localisation chromosomique d'un gène de résistance chez une bactérie doit être confirmé par un sequençage complet de génome de cette souche. Pourrai-je savoir pourquoi \comment je pourrais savoir sa localisation à l'aide de la séquence complété de gènome de cette souche.  [...] Ben a partir du moment ou tu as une liste de tous les gènes, il devient possible d'identifier celui qui est à l'origine de la résistance.  [...]

Le rat-taupe nu, une longévité exceptionnelle et jamais de cancer !

Décerné par les Associations de prévoyance santé (ADPS) et par l'assureur Allianz, ce prix honore les travaux d'un chercheur pionnier. Ses observations ont notamment permis de découvrir que le rat-taupe nu ne développait jamais de cancer, même à un âge avancé, soulignent les membres du jury.   [...] Plusieurs études ont notamment été initiées sur le séquençage de son génome. Et les recherches se poursuivent, pour éclairer davantage les mécanismes grâce auxquels les rats-taupes nus bénéficient de cette extrême résistance au vieillissement.  [...]

Sequencage du genome du VIH

Quelqu'un peut me dire svp quelles sont les nouvelles technologies de sequencage du genome du VIH pour faire une etude de resistance.  [...] je ne sais pas trop si vraiment le pyrosequencage est la nouvelle technologie pour une étude de resistance dans les pays a ressources limitées. quelles sont les nouvelles techniques du sequencage les plus utilisées de nos jours et par rapport a cela je dois proposer un algorithme pour un pays qui n'a pas assez de moyens.  [...]

Screening avec librairie d'ARNg + cas9

On fait ensuite un séquencage du génome des cellules cancéreuses survivantes pour voir si certains ARNg seraient plus ou moins présents que d'autres afin d'en déduire l'importance de certains gènes dans la résistance ou la sensibilité à la destruction des lymphocytes T spécifiques des tumeurs.  [...] Je ne comprends pas la manip qui consiste à transfecter une bibliothèque d'ARNg. ne risquons nous pas d'avoir un Knock-out de tout le génome Et même si seulements quelques ARNg s'intégraient, le fait d'avoir d'avoir plusieurs KO par cellule modifierait profondément son fonctionnement non (L'association de plusieurs KO particuliers pouvant avoir des conséquences que les KO pris séparemment n'auraient pas...).  [...]

Moustiques : comment combattre leur résistance aux insecticides ?

Une équipe du Centre national de la recherche scientifique (CNRS), de l'institut de Recherche pour le développement ( IRD ), de l'université Claude Bernard Lyon 1, de l'université Joseph Fourier de Grenoble et de l'institut Pasteur de la Guyane a utilisé une approche originale de séquençage massif de l' ADN pour identifier les bases génétiques de cette résistance chez le moustique Aedes aegypti, proche cousin du moustique-tigre et vecteur de la dengue et du Chikungunya dans les zones tropicales.  [...] En effet, plutôt que de séquencer le génome entier du moustique - une méthode coûteuse et laborieuse -, les chercheurs ont ciblé, par bio-informatique, plus de 760 gènes potentiellement impliqués dans la résistance aux insecticides. Après avoir analysé ces gènes par séquençage très haut débit, ils ont déterminé que l'augmentation de l'activité des enzymes de détoxification des moustiques résistants était fréquemment provoquée par l'accroissement du nombre de copies des gènes codants pour ces enzymes.  [...]

Qu'est ce que la génomique ? | Dossier

Le génome est, par définition, l'ensemble des gènes portés par les chromosomes. La génomique est donc la Science qui étudie l'ensemble des gènes. La génomique s'intéresse tout d'abord à la cartographie physique des génomes et à la structure des gènes. il s'agit de la génomique structurale anciennement appelée génétique moléculaire (localisation des gènes, nombre d' exons, d' introns, polymorphismes,...).  [...] La réalisation du séquençage du génome à haut débit a permis un essor considérable de la génomique structurale, les techniques de puces à ADN ont permis celui de la génomique expressionnelle. En effet, l'automatisation des techniques de biologie moléculaire permet d'étudier simultanément la quasi totalité des transcrits (ou ARN messager) d'un tissu d'un individu à un instant donné.  [...]

sequencage du genome humain

Le séquençage d'un génome permet de déterminer les séquences (d'ou séquençage) de nucléotides de l'ADN d'un organisme. Les fins de ce séquencage sont diverses selon la personne qui la réalise. Par exemple, il est interessant de connaître la séquence des gènes impliqués dans la division cellulaire, ou dans le développement etc.  [...] En résumé, le séquencage d'un génome peut s'avérer très utile pour l'étude et la classification d'un organisme. Les portées du séquencage vont bien plus loin que le simple plaisir de dire on a séquencé un génome en entier.  [...]

[Biologie Moléculaire] Différence entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome

Différence entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome.  [...] Je me permets de vous écrire car je souhaiterais savoir quelles sont les différences en termes de méthodes, d'étapes et d'appareils utilisés entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome s'il-vous-plaît. Je me pose cette question dans le cadre de l'accréditation selon la norme ISO 15189 des plateformes de séquençage.  [...]