• Santé - Sens, Séquences, Tandem

Séquences répétées en tandem

Bonsoir, je dois amplifier un gène dont la région C-terminale est composée par une séquence répétée en tandem. GGTAAAGAA. Le but de mon travail consiste à séquencer ce gène afin de détecter le nombre de répétition de cette séquence.  [...] Ce que je veux comprendre est ce que l'amorce anti-sens va se lier à chacune des séquences répétées en tandem est ce que j'aurais plusieurs amplicons de taille différentes Si oui, comment pourrais-je amplifier tout le gène.  [...]

Empreinte génétique : l'ADN | Dossier

Des modifications ponctuelles de la séquence (un nucléotide remplacé par un autre) sont courantes. Ce sont les SNP, single nucleotide polymorphism. D'autres séquences varient également, au niveau de séquences très courtes d'ADN qui sont retrouvées répétées.  [...] Or chez chaque individu, le nombre de ces répétitions est variable. c'est cela qui constitue notre profil génétique. Ces séquences sont ce que l'on appelle des minisatellites (ou VNTR pour Variable Number Tandem Repeats ) qui sont des répétitions de séquences de dizaines de nucléotides, ou des microsatellites (ou STR pour short tandem repeat ) dont les séquences répétées sont plus courtes (quelques nucléotides seulement).  [...]

role des parties non codantes de l'ADN

Il contient principalement des séquences répétées en tandem (ADN satellites) et des éléments transposables (LINE et SINE), des pseudogènes, des espaceurs et toutes les séquences régulatrices, les séquences structurales. télomères et centromères.  [...] Il est peut être plus prudent de dire qu'on ne sait pas encore à quoi certaines parties servent en biologie, c'est rarement évident d'affirmer que quelque chose ne sert à rien.   [...]

[Biologie Moléculaire] Conversion génique

La conversion génique est un mécanisme de recombinaison permettant un transfert d'information génétique qui, par son résultat, évoque un double crossing-over (Jeffreys et al 1994). La conversion, au sens moléculaire, produit le remplacement d'une séquence d'ADN par une autre, apparentée mais non allélique (conversion interlocus) ou allélique (conversion interallélique).  [...] En particulier, ce remplacement peut se produire entre séquences répétées en tandem ou dispersées. De plus, il peut être asymétrique et polarisé, certaines séquences se substituant plus fréquemment à une autre que la réciproque. A l'échelle de l'individu, ce mécanisme s'oppose au polymorphisme dans la mesure où il tend à homogénéiser les séquences.  [...]

Définition | Empreinte génétique - Profil génétique | Futura Santé

Malgré une homologie de leur ADN très forte entre tous les êtres humains, des séquences hypervariables peuvent être mises à profit pour distinguer deux profils génétiques. Ce sont des séquences répétées en tandem, dont le nombre de répétitions est variable suivant les individus.  [...] L'analyse du nombre de répétitions de plusieurs régions chromosomiques distinctes permet de déterminer avec certitude, que deux profils génétiques sont identiques (le risque d'erreur est de 1 sur 100 milliards).   [...]

Définition d'un Pseudogène .

Je crois qu'il y a une deuxième catégorie de pseudogènes. Dans une séquence d'ADNg tu détecte ton gène mais en 3', il y a une longue succession de A. A ce moment là tu peux dire que t'as un pseudogène provenant d'une infection antérieure par un rétrovirus.  [...] S'il existe des ADNc correspondant à la séquence génomique (100% identique), le gène est exprimé. A priori ça ne sera pas un pseudogène.  [...]

[Biochimie] Southern blot et technique de jeffreys

Je ne connais pas la technique de Jeffreys mais si il s'agit de la détection des séquences minisatellites ( ou VNTR. variable number of tandem repeats), alors on utilise en effet la technique Southern Blot entre autre car les séquences à détecter font plusieurs dizaines de paires de bases et que la PCR est plus adaptée à la détection des séquences microsatellites.  [...] Les séquences non codantes de l'ADN servent à beaucoup de choses. Elles ont un grand rôle dans la régulation de la transcription, de l'épissage et de la traduction (séquences promotrices, enhancers...).  [...]

[Génétique] Génome humain: 22000, 24000, 25000 gènes ?

A closer look at the quality of these reference sequences suggests that the numbers may be correct but the quality or authenticity of many transcripts remains suspect. Each of these transcripts has an associated coding sequence (CDS) and a recent combined effort has been launched to include quality assessments for each.  [...] en fait ce nombre est différent d'un individu à l'autre. Il y a énormément de séquences répétées dans notre génome et le nombre de répétitions est variable (cherche par exemple short tandem repeat ). Et puis dans toutes les séquences il y a des insertions et délétions.  [...]

VNTR : Mécanismes ?

Mon hypothèse est que cela se passe lors de la réplication, mais selon quels mécanismes, je l'ignore totalement. J'ai demandé déjà autour de moi au labo, mais personne ne sait, il parait que le sujet est mal connu ^^.   [...] Par exemple dans le cas des expansions de triplets (dans le gène de la hugtinghtine notamment), la polymerase peur déraper en avant comme en arrière et changer la longueur de ces séquences répétées. Il yt a notamment des stuctures locales de l'ADN (boucles) dues à ces motifs répétées.  [...]

les télomers !

salut, je viens d'étudier avec un peu de détails sur les localisation des parties des chromosomes, donc il y une parite qui m'attire concernat les télomeres. Je sais que c'est des extrémités du chromosome et qui vont assurer la stabilité de la molécule d'ADN, mais ces télomers est font partie de la molécule d'ADN et est ce qu'ils sont constitués d'une séquence de bases identiques ( càd, comme par exemple AAA ou TTT... ) ou non.  [...] relativement bien conservé ce qui est en faveur de son importance fonctionnelle. Dans la plupart des cas l'ADN télomèrique est constitué de courtes séquences répétées en tandem.  [...]