• Santé - Sens, Gauche, Séquence

Biochimie: quelques questions ...

Pour la question 4, rappelle-toi que les brins de DNA sont ANTI-PARALLELES. Or si la séquence GATCAA est écrite dans le sens 5'-. 3' de gauche à droite, ton brin complémentaire sera écrit dans le sens 3'-. 5' de gauche à droite. Or, ton énoncé te demande de l'écrire dans le sens 5'-.  [...] 3'. Il te suffit donc de réécrire la séquence complémentaire que tu as très justement trouvée mais en commençant par la droite, ce qui donne. TTGATC. Voilà.  [...]

[Biologie Moléculaire] brin sens / brin antisens

Le brin sens est celui qui a la même séquence nucléotidique que l'ARN messager transcrit (T / U mis a part bien sûr). Le brin antisens sert de matrice à la polymerase.  [...] Dans ce cas là, on appelle souvent amorce sens celle qui va de gauche à droite, c'est à dire l'amorce 2 (amorce de séquence identique au brin sens).  [...]

[Biologie Moléculaire] amorce PCR

Si oui, tu fait un blastn avec le morceau de séquence ton gène sur le site du ncbi, ça va te dire de quel gène il s'agit, tu télécharge sa séquence, et tu n'a plus qu'a faire une amorce anti-sens qui va s'apparier 70pb plus loin que ton amorce sens.  [...] je tenais aussi à vous remercier pour le temps que vous prenez a me repondre, ca peut paraitre rien mais je suis a quelque semaine de l'examen et je pensais ne jamais reussir a lire les amorces antisens avec une sequence mais la ca me semble(un peu) moins compliqué merci.  [...]

ADN transcription brin matrice et brin codant

donc quand tu fais le complémentaire il fallait soit garder l'ordre de la séquence et les extrémités originelles, soit changer le sens de la séquence mais aussi mettre ton 5' a gauche et ton 3' a droite.  [...] pour le brin codant, c'est le complémentaire du brin matrice (donc identique a l'ARNm à l'exception qu'on a pas d'Uracile dans l'ADN mais de la Thymine) et donc puisque c'est censé etre la meme séquence que l'ARN, pourquoi avoir gardé l'orientation 5'-3' mais changé le sens des lettres de la séquence en plus du probleme d'orientation dans ce brin, tu as un problème séquence, tu as la meme lettre aux deux extrémitées pourtant aucune de tes autres séquences(qui sont soit complémentaires soit identique) ne possède la meme base a gauche et a droite.  [...]

éléments régulateurs palyndromiques

Tous les éléments régulateurs ne sont pas palindromiques. Lorsqu'il le sont, c'est que la protéine qui s'associe à cette séquence se lie aux 2 brins de l'ADN de façon homodimérique, chaque polypeptide se liant à un brin différent en reconnaissant la même séquence.  [...] Toutes les régions de l'ADN sont constituées de deux brins antiparallèles et complémentaires. Les sèquences palindromiques présentent une caractéristique supplémentaire. la séquence est identique sur les deux brins (chacun lu dans le sens 5' - 3'). Ceci est du au fait que la séquence montre une complémentarité interne entre les deux moitiés (moitié de gauche et moitié de droite).  [...]

Enzyme de restriction: petite difficulté avec sa définition

D'après mon cour, une exonucléase détache des nucléotides terminaux, une endonucléase coupe les liaisons à l'intérieur de la chaine. Toujours d'après mon cour, une enzyme de restriction est une endonucléase... C'est ce que je ne comprends pas. cette enzyme de restriction semble couper la séquence de nucléotides aux extrémités, comme le fait une exonucléase.  [...] Ces séquences correspondent à ce qu'on appelle une séquence palindromique (qui se lit de manière identique dans les 2 sens). Cela veut dire que dans un grand flot de bases azotées allant de quelques bases à plusieurs centaines ou plusieurs milliers, dès que l'enzyme trouvera cette séquence enfouis dans le code génétique, elle la coupera de manière cohésive, c'est à dire en scindant le double brin en partant d'en haut à gauche entre le G et le A du 5'-3', fait sauter les liaisons entre les AATT complémentaires des 2 brins et finalement coupe encore entre le A et le G du 3'-5'.  [...]

[Génétique] Choix amorces amplification portion ADN

Si tu travailles avec uniquement ça, tu auras ta séquence amplifiée. Il faut ensuite ajouter les sites de clivage. A l'amorce 1, tu l'ajoutes à gauche (du coté 5') et à l'amorce 2 tu l'ajoute à droite (du coté 3') et tu te retrouve avec les séquences que j'ai proposé plus haut.  [...] Si l'amorce 1 a cette séquence. 5' - CTCGAGCTT AGG GTG CCA TTT AAC CT - 3', la polymérase démarera donc à gauche et ira vers la droite. Ta confusion vient du fait que tu te base sur le sens du brin matrice, et du coup tu as l'impression que la polymérase va de 3' vers 5'.  [...]

[Biochimie] Problème d'amorces

Moi j'en ai trouvé une pour l'extrémité 3' du gène, mais pour le 5' j'ai du mal à placer l'amorce, car en plaçant l'amorce sur l'extremité 5', on aura une synthèse débutant au 3' de l'amorce, et donc vers la gauche (la séquence synthétisée se trouvera hors du gène), je ne sais pas si vous me comprenez.  [...] On me demande de proposer des amorces qui permettent d'amplifier la séquence de l'éxon 3 (en Majuscule), les amoces (de 20 nucléotides) devront être posées sur les séquences introniques (en amont et en aval). Seulement, j'ai appri que l'ADN polymérase synthétise de l'ADN dans le sens 5'-.  [...]

[Divers] Signification de palindromes

salut en biomol une sequence palyndromique n'est pas la même chose qu'un palyndrome litteraire du genre ELU PAR CETTE CRAPULE,que tu peux lire de gauche à droite,tu as la même chose,en biomol,je crois que c'est plutot une sequence palyndromique(dans 2 sens).  [...] Voilà,j'espere que je ne me suis pas trop gouré,haha,et au fait cette séquence dite palyndromique est le type de sequences cibles des endonucleases.  [...]

genetique bacterienne bacterie Hfr

le but de l'exercice est de remettre les lettres dans l'ordre en reconstituant un cercle à partir des 4 fragments proposés. Les 4 fragments sont issus du même chromosome circulaire. Il peut y avoir des parties qui se chevauchent. Cela va t'aider à retrouver l'ordre des marqueurs sur le chromosome.   [...] Indice. comme c'est un cercle, il n'y a ni début, ni fin, ni droite, ni gauche. Seul l'ordre compte. Il se peut qu'une des 2 séquences soit écrite à l'envers (= dans le mauvais sens).  [...]