• Santé - Résidus, Protéines, Séquence

[Biologie Moléculaire] Epissage et épissage altérnatif

3-On peut trouver des séquences polyA (séquence de résidus adénine qui protège l'ARNm des exonucléases) à l'intérieur de l'ARNm en plus de la séquence polyA que l'on trouve à l'extrémité 3' de l'ARNm. Selon la séquence polyA qui sera coupé avant traduction, on aura donc des protéines traduites différentes. '''''.  [...] Après c'est beaucoup plus complexe que ça la cellule va mettre en place différents mécanismes pour synthétiser la protéine qui lui convient, donc activation de certains promoteurs, et donc transcription d'une certaine séquence du gène.  [...]

[Biologie Cellulaire] RER et AG !

- c'est l'attachement des oligosaccharides aux Résidus Asn des protéines a condition que Asn fait partie du séquence ASN-X-Ser ou ASN-X-Thr pour qu'il puisse être connue par la N-glycosyltransférase.  [...] Pour tes réponses, ça me semble correct. Pour ta question, je n'en suis pas sûr mais je crois qu'entre Golgi Cis et Golgi trans, il y a incorporation de cholestérol à la membrane. La membrane passe d'un état fluide à un état gel, les phospholipides sont mieux organisés, la chaine aliphatique est positionnée de façon plus droite, plus redressé, l'épaisseur générale de la membrane est donc accrue.   [...]

[Biologie Cellulaire] Protéines et liaisons convalentes entre 2 résidus soufrés

Il est inscrit dans un QCM, en tant que item vrai, que la forme protéine Prion est stabilisée par des liaisons covalentes qui s'établissent entre deux résidus soufrés.  [...] b. et c. Je ne connais rien au Prion mais n'importe quelle protéine peut, potentiellement, posséder des ponts disulfure du moment qu'elle possède des résidus cystéine sur sa séquence. Des protéines autres que le Prion en ont.  [...]

Généralités sur la protéine Kinase C | Dossier

La [ protéine kinase C ] est une sérine /thréonine kinase, ce qui signifie qu' elle est capable de phosphoryler d'autres protéines sur les fonctions alcools de ces résidus d' acides aminés, lorsqu'ils sont compris dans une séquence dite consensus. Elle est considérée comme un médiateur classique de nombreux agonistes extracellulaires qui produisent divers seconds messagers lipidiques (Kishimoto A.  [...] Il existe d'autres domaines C1 dans d'autres enzymes (Raf-1 kinase par exemple), mais ces protéines ne sont pas capables de lier les esters de phorbol. En comparant les structures primaires des domaines, on remarque l'absence, dans le second cas, des résidus d'acides aminés nécessaires à la formation de la poche hydrophobe, et donc au site de liaison (Toker A., 1998.).  [...]

[Biochimie] Déterminer la charge d'une protéine

A partir d'une séquence d'acides aminés d'une protéine (108 acide aminés) on me demande tout d'abord le nombre de résidus acides et basiques. J'ai donc compter le nombre d'acides aminés basiques et acides. j'en trouve 22 acides et 22 basiques.  [...] sinon tu vas la, tu colles ta séquence, et ca te donne la charge au pH que tu veux. http.//www.scripps.edu/~cdputnam/protcalc.html.  [...]

De l'intérêt d'être chaperonnée... pour une protéine!

coli) a montre que les sites de liaison de cette proteine sur une sequence proteique semblent etre constitues d'une region centrale hydrophobe de 4 ou 5 aa entouree de deux regions riches en residus basiques. Dans une proteine de conformation normale, ces sites seraient inaccessibles mais en cas de denaturation une partie pourrait alors etre reconnue par la chaperonne.[/url].  [...] Je reviens juste la-dessus... Si la séquence protéique située après le codon stop, n'est pas une partie essentielle de la protéine, alors les mutations silencieuses peuvent s'y accumuler, sans pour autant que cette partie de la séquence soit inexprimée... non.  [...]

Question : analyser une protéine

Pour ce qui est d'analyser la séquence peptidique (structure primaire) des protéines, il y a plusieurs étapes. D'une part, il faut séparer les solutions et mélanges qui contiennent plusieurs protéines, et les purifier. La séparation de ces protéines peut s'obtenir de plusieurs façons, en fonction du poids moléculaire, de la taille, de la distribution de charges, et d'autres propriétés physico-chimiques qui vont moduler la migration de ces protéines et peuvent également varier selon les paramètres de ton milieu (pH, température, tonicité, etc.  [...] Quand tu as extrait et purifié la protéine dont tu souhaites déterminer la séquence, il faut préférablement la dénaturer, notamment lyser les éventuels ponts disulfure au cas où il y en aurait. on utilise le réactif de Cleland (DTT), qui est un réducteur porteur d'un thiol (sulfurhydryl) qui va se fixer aux résidus portant les mêmes groupes thiol (la cystéine en l'occurence), ou accessoirement le 2-mercaptoéthanol.  [...]

Protéine "basique"

Il faut calculer le pI de la protéine. Si celui-ci est inférieur à 7 la protéine est acide sinon elle est basique. En l'absence de moyen de calcul, tu peux en avoir une idée assez précise en calculant le nombre c de charges de la protéine à pH 7.  [...] En premire approximation et en appelant Nb(X) le nombre de résidus X dans la séquence, c= N(Arg)+N(Lys)+0.1N(His)-N(Glu)-N(Asp). Si c. 0, la protéine est basique sinon elle est acide.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéines membranaires et membrane plasmique

À la différence des oligosaccharides N-liés, les oligosaccharides O-liés sont bâtis progressivement, ose par ose, sur la protéine, au niveau du groupement hydroxyle d'un résidu sérine ou thréonine. Ils sont en général plus petits et ne dépassent guère 5 à 6 résidus, sauf dans le cas particulier des protéoglycanes pour lesquels le nombre de résidus peut dépasser la centaine.  [...] La N-glycosylation est une étape de maturation protéique qui se passe dans le Réticulum Endoplasmique des cellules eucaryotes. La N-glycosylation se produit sur les chaines latérales des résidus Asparagines, et pas n'importe lesquelles. uniquement une Asparagine qui est incluse dans une séquence Asparagine - X (n'importe quel Acide Aminé) - Sérine, ou bien Asparagine - X - Thréonine.  [...]

[Biologie Moléculaire] structure de Na+ ATPAse porcine

bon voila j'ai la structure de l'ATP et j'ai la sequence en acides aminés de Na+ ATPAse et je voulais savoir l'interaction entre ces 2 comment ce fait liaison électrostatique ou autres.  [...] Un simple alignement de séquence n'est pas suffisant pour déterminer comment se fait l'interaction. Ca se passera très probablement dans les régions les plus conservées comme les hélices 2 et 4 mais tu as besoin de plus d'infos pour aller plus loin. Un alignement avec une autre protéine dont la structure 3D en présence d'ADP/ATP peut indiquer quelles aa se lient à l'ATP et comment, il y a également la possibilité de muter les résidus conservés et de regarder ce qui se passe (moyennant toutes les précautions habituelles en terme de repliement notamment).  [...]