• Santé - Répétitions, Tandem, Génome

[Génétique] Transposons

On dit des transposons qu'il s'agit de séquences répétées dans le génome. D'accord, par définition. Mais entend t'on bien par là que ce sont des séquences répétées mais dispersées Je veux dire, les transposons ne sont pas des répétitions en tandem qui se suivent mais des répétitions dispersées dans le génome.  [...] Il me semble qu'il s'agit de séquences qui ont été répliquées, puis déplacées dans le génôme. Donc on retrouve dans le génôme X répétitions de la même séquence dispersées dans le génôme, mais il ne s'agit pas d'un enchaînement.  [...]

[Génétique] Génome humain: 22000, 24000, 25000 gènes ?

Francis Collins initiated a HapMap program in the same month that looks at all human genetic variation, both inside and outside ancestral populations. In much the same vein, the Venter Institute embarked on a human genome re-sequencing project aimed to expand the Celera coverage by sequencing the genomes from other donors in order to generate more SNPs.  [...] en fait ce nombre est différent d'un individu à l'autre. Il y a énormément de séquences répétées dans notre génome et le nombre de répétitions est variable (cherche par exemple short tandem repeat ). Et puis dans toutes les séquences il y a des insertions et délétions.  [...]

Empreinte génétique : l'ADN | Dossier

Des modifications ponctuelles de la séquence (un nucléotide remplacé par un autre) sont courantes. Ce sont les SNP, single nucleotide polymorphism. D'autres séquences varient également, au niveau de séquences très courtes d'ADN qui sont retrouvées répétées.   [...] Or chez chaque individu, le nombre de ces répétitions est variable. c'est cela qui constitue notre profil génétique. Ces séquences sont ce que l'on appelle des minisatellites (ou VNTR pour Variable Number Tandem Repeats ) qui sont des répétitions de séquences de dizaines de nucléotides, ou des microsatellites (ou STR pour short tandem repeat ) dont les séquences répétées sont plus courtes (quelques nucléotides seulement).  [...]

[Génétique] SNP et microsatellite

Exemple. à un locus donné sur l'ADN un individu 1 possède 14 répétitions de CAG, un individu 2 possède 17 répétitions de CAG et un individu 3 possède 20 répétitions de CAG.  [...] On peut constater qu'au locus étudié on observe dans la population des microsatellites constitués de 14, 16 et 20 répétitions. On a donc dans ce cas un marqueur multiallélique (ici, triallélique). Mais il existe des marqueurs microsatellites ayant bien plus d'allèles.  [...]

[Evolution] Création de nouveaux gènes

La duplication de gènes intervient suite à des processus divers (on ne sait pas trop précisément, en fait). Tu peux avoir une duplication suite à des transpositions réplicatives, à des problèmes de réplication, à des translocations terminales non réciproques,   [...] .. Quand tu as deux répétitions directes en tandem qui recombinent, j'appelle pas ça aléatoire Idem pour les interactions avec les pseudogènes ou la transpositions dans le cadre de laquelle tu as des hotspots.  [...]

Gènes ribosomaux et séquences en tendem

En fait, au début de ce chapitre, il nous dit que les gènes ribosomaux (ADNr) sont constitués de répétitions et tandem de gènes de 8 à 13 kpb. Ce que je voudrais savoir, c'est.  [...] -Est-ce que c'est juste de dire que plus une séquence d'ADN (supposée codante) est répétée en tendem plus son expression est importante.(ce que je veux dire c'est que si la séquence d'ADN qui fournit l'ARN 45S est présente en plusieurs répétitions, est-ce que ça veut obligatoirement dire qu'on trouvera quantitativement dans la cellule plus d'ARN 45S, que si cette séquence était unique, non répétéé plusieurs fois dans l'ADN).  [...]

[Génétique] Vntr Insuline

je viens de lire que le gène de l'insuline contenait une séquence en son amont répété en tandem (vntr) et que selon le nombre de répétitions on classe l'allele en I ou classe III,  [...] est ce que quelqu'un aurait des informations sur le sujet et la liaison avec le diabète de type 1 et néonatal.   [...]

Définition | Empreinte génétique - Profil génétique | Futura Santé

Malgré une homologie de leur ADN très forte entre tous les êtres humains, des séquences hypervariables peuvent être mises à profit pour distinguer deux profils génétiques. Ce sont des séquences répétées en tandem, dont le nombre de répétitions est variable suivant les individus.  [...] L'analyse du nombre de répétitions de plusieurs régions chromosomiques distinctes permet de déterminer avec certitude, que deux profils génétiques sont identiques (le risque d'erreur est de 1 sur 100 milliards).  [...]

[Biologie Moléculaire] Problèmes PCR amplifications minisatellites

J'aimerais connaitre les principaux problèmes que vous avez rencontré en amplifiant des minisatellites par PCR. Je sais que du fait des répétitions en tandem, la Taq peut glisser et amplifier un fragment plus court de quelques répétitions. Cependant, j'observe généralement deux bandes.  [...] De manière générale, sur quels paramètres (propres au programme PCR ou au MIX PCR) jouez vous afin d'optimiser l'amplification de ces séquences répétées en tandem.  [...]

[Biologie Moléculaire] Question teste de paternité pour exposé universitaire

Je suis à la recherche de petite information sur les testes de paternité, car sur le net il n'y a que les questions familiale mais peut de réponse théorique.   [...] Maintenant on teste le nombre de répétition en tandem par PCR. Les sites polymorphes d'intérêt sont déjà connus (puisque l'ADN humain est séquencé), donc il suffit de designer des primers en amont et en aval de ces répétitions et de regarder la taille du fragment amplifié.  [...]