• Santé - Remarque, Structures, Protéines

[Biochimie] Diagramme de ramachandran

Oui effectivement, il permet donc de connaitre et prédire les structures secondaires et par extension tertiaires des protéines. On a une probabilité assez grande d'avoir une structure secondaire pour phi. de -60° à -180° et psy -70° à 180°. On remarque sur ce diagramme les angles pour.  [...] Le coude relie des structures secondaires (feuillets, hélices) et est lui même une structure secondaire qui participe à l'organisation spatiale (str. IIIaire) de la protéine et que l'on retrouve en surface des proteines majoritairement donc assez hydrophile.  [...]

[Biochimie] PDB et Cristallographie

Tout d'abord, j'ai remarqué que les structures de protéines (dans Protein Data Bank) déterminées par cristallographie n'ont pas d'atome d'hydrogène. Pourquoi Je trouve partout les hydrogènes ne sont pas visible en cristallo mais personne n'explique pourquoi.  [...] Il peut y avoir des zones dans la structure des protéines qui sont très dynamiques. Cela peut engendrer la formation d'un cristal de plusieurs conformères. La base de la résolution cristallographique étant la répétitivité de la même structure, s'il y a des variations à un endroit, la résolution sera donc impossible pour cette zone.  [...]

Généralités sur la protéine Kinase C | Dossier

Il existe d'autres domaines C1 dans d'autres enzymes (Raf-1 kinase par exemple), mais ces protéines ne sont pas capables de lier les esters de phorbol. En comparant les structures primaires des domaines, on remarque l'absence, dans le second cas, des résidus d'acides aminés nécessaires à la formation de la poche hydrophobe, et donc au site de liaison (Toker A., 1998.).  [...] Par ailleurs, cette structure étant très proche de celle des protéines capables de se lier à l' ADN, il n'est pas impossible que la [protéine kinase C ] puisse également avoir une activité de liaison sur l'ADN (Liu W.S., Heckman C.A., 1997).  [...]

[Biologie Moléculaire] Ribose ou.. Beta-D-ribofuranose

Non non pas la structure des protéines justement. Je sais qu'il y a 4 niveaux de structure et pour la 2ème on a des structures 2ndaires Alpha (hélices) ou Beta (feuillet).  [...] mieux vaut tard que jamais on parle bien toute fois de structures secondaires et tertiaires pour les acides nucléiques et autres complexité de la nature additionné à des protéines (RNPsn)... Donc on peux dire que se mélange d'information est pseudo-légitime.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

Protein Data Bank (banque de données sur les protéines) qui recense les structures secondaires des protéines et des acides nucléiques avec une résolution inférieure ou égale à 4 angströms.  [...] On voit qu'en 2012, sur un total de 18876679 de protéines distinctes connues (base de données UniProt en date du 11 novembre 2012), seulement 86172 structures protéiques ont été déterminées. Mais le nombre de structures connues augmente à un rythme annuel toujours croissant.  [...]

[Biochimie] Question rapide feuillet bêta

Bonjour à tous, je voudrais avoir confirmation que le feuillet bêta d'une protéine bien est une structure bidimentionnelle.  [...] Si on considère maintenant les deux chaines ensemble (le vrai feuillet béta donc), on aura une forme en vague avec une notion de profondeur en plus (l'espace entre les deux chaines, où les liaisons H se sont formés). On aura donc une structure tridimensionnelle.  [...]

Structure quaternaire

Chacune des protéines a pu acquérir avant cet assemblage des structures secondaires puis tertiaire propres.  [...] Regarde déjà ces liens et cherche un peu sur le net tout ce qui parle de structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire. Tu trouveras beaucoup d'infos sur ces notions. Reviens nous voir si tu as des questions. Bonne lecture.  [...]

[Biochimie] La biochimie pour les nuls?

je cherche un ouvrage ou je pourrais acquérir les bases en biochimie (plus précisément sur les structures et fonctions des protéines).  [...] Il est bien fait et rempli d'illustrations pour aider à la compréhension des structures des protéines et des différents mécanismes de bases.  [...]

structure prédictive de protéine et interaction ... tout un programme!!!

J'aimerai donc pouvoir avoir une structure prédictive de mes deux protéines et voir si, prédictivement, elles peuvent interagir ou pas et donc savoir si ma kinase n'est pas QUA kinase.  [...] La structure 3D c'est une étape qui arrive bien après, et puis il faut avoir les compétences d'un structuraliste (que tu as peut-être...) pour voir si deux structures peuvent s'associer, c'est pas facile à voir. Mais apparemment tu ne sais pas si les structures cristallo sont disponibles pour ces deux protéines, et on en est pas encore à faire des prédictions d'interactions à base de structures prédictives de protéines ( ).  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéines [Master 2] problème structures secondaires différentes

Je pensais que les structures secondaires étaient déterminées par les structures primaires et qu'elles correspondaient au niveau de conformation le plus stable (soit une séquence d'acides aminés = une seule structure secondaire possible).  [...] Après de nombreuses recherches infructueuses, je me demande si ces séquences ne seraient pas les protéines prions mais je pense que c'est plutôt un exemple que le nom générique de ces séquences (et puis les protéines prions sont des protéines complètes).  [...]