• Santé - Régulation, Séquences, ADN

Un second code caché dans l'ADN !

Dans le cadre du projet Encode ( Encyclopedia of DNA elements ), qui vise à répertorier l'ensemble des séquences d'ADN du génome humain, des chercheurs de l'université de Washington (États-Unis) ont fait une découverte surprenante. Ils ont montré que le code génétique tel qu'on le connaissait jusqu'ici en cachait un autre, destiné quant à lui à la régulation de l'expression des gènes.  [...] Le génome contient des séquences codantes et des séquences qui permettent aux facteurs de régulation de se fixer sur l'ADN pour contrôler l' expression des gènes. Grâce à des techniques de biologie moléculaire, les chercheurs ont analysé la répartition de ces deux types de séquences.  [...]

[Biochimie] Southern blot et technique de jeffreys

Je ne connais pas la technique de Jeffreys mais si il s'agit de la détection des séquences minisatellites ( ou VNTR. variable number of tandem repeats), alors on utilise en effet la technique Southern Blot entre autre car les séquences à détecter font plusieurs dizaines de paires de bases et que la PCR est plus adaptée à la détection des séquences microsatellites.  [...] Les séquences non codantes de l'ADN servent à beaucoup de choses. Elles ont un grand rôle dans la régulation de la transcription, de l'épissage et de la traduction (séquences promotrices, enhancers...).  [...]

ADN non codant

D'autres séquences non codantes font elles la jonction entre les différents gènes et leur rôle n'est pas clairement défini en effet (elles servent en quelques sortes à combler les trous ). Quoi qu'il en soit elles varient d'un individu à l'autre et participe à notre identité génétique.  [...] Ce sont des séquences appelées promotrices qui par action (fixation) de protéines spécifiques (facteurs de transcription) vont permettre de moduler l'expression d'un gène.  [...]

[Génétique] promoteur de la transcription

On parle de TATAAT parce que c'est la séquence qui est dans le sens de l'information, à savoir de la séquence codante. Nous, ce qui nous intéresse, c'est de lire dans le sens qui nous place en amont de la séquence codante. Dans les publis, les séquences écrites en simple brin sont, par convention, dans le sens des séquences codantes, dans le sens codant, 5'-3'. Ainsi, on s'y retrouve plus facilement.  [...] De plus, les promoteurs dit à régulation positive ont des séquences promotrices particulières qui font que ces promoteurs sont faibles et ont besoin de molécules (protéine de régulation) se fixant sur l'ADN (sur des sites appelé opérateurs) pour être fonctionnels.  [...]

[Biologie Cellulaire] Séquences régulatrices de la transcription

Les séquences promotrices (au niveau du brin d'ADN transcrit) se trouvent en amont voire très en amont de la séquence codante, a priori elles ne sont pas incluses dans l'ARN transcrit (ou il faudrait à l'ARNpolymérase une faculté de bonds de kangourou). La TATA box est une séquence promotrice.  [...] Personne a dit que cette séquence correspond à la matrice de la séquence de terminaison de la transcription. Au contraire, le but est d'identifier sur le brin codant (ou sens), la séquence A 2 TA 3 que l'on retrouve également au niveau de l'ARNm avec bien évidemment les U à la place des T.  [...]

[Biologie Moléculaire] Régulation cis et trans

Les éléments de régulation en trans sont des protéines qui se fixe à l'ADN (ex. sous-unité sigma de l'ARN polymérase chez les procaryotes).  [...] Cher les eucaryotes, de nombreux facteurs généraux de transcription se fixe au promoteur (boite TATA) et fixe l'ARN polymérase à l'ADN.  [...]

[Biologie Cellulaire] ADN "poubelle" chez divers êtres vivants

Le terme d'ADN poubelle est devenu obsolète depuis qu'on a pu mettre en évidence un rôle plus ou moins important de régulation sur les séquences de gènes.  [...] L'ADN codant est de l'ADN qui contient de l'information génétique TRANSCRITE c'est à dire qui code des protéines ou des ARN (ARNt, ARNr, etc.), indépendamment de toute activité cellulaire. Donc l'ADN non codant est de l'ADN qui n'est PAS TRANSCRIT mais il n'est pas de l'ADN poubelle pour autant car la plupart des séquences régulatrices sont NON CODANTES.  [...]

[Biochimie] Génome "poubelle" codant

A part les gènes à proprement parlé qui codent pour des protéines, on sait que dans le génome, une bonne partie de ce qu'on pensait être de l'ADN poubelle (non codant en masse), se trouve des séquences de contrôle etc. A-t'on une idée actuellement de la proportion de séquences en fait codantes dans l'ADN dit non codant Et quelles sont les types de séquences codantes que l'on peu retrouver dans cet ADN poubelle Il me vient à l'esprit uniquement les ARN interférents par exemple.  [...] oui c'est pour ça que j'avais mis des guillemets un peu partout.. toujours est il que je me pose toujours cette question... Quelles peuvent être les fonctions des séquences d'ADN qui ne codent pas pour des protéines (à part les séquences de régulation de la transcription, sur lesquels les facteurs de transcription se fixent etc.).  [...]

homéodomaine et protéine

En simplifiant bcp, L'homéodomaine est une partie de la protéine qui va reconnaitre une séquence spécifique de l'ADN en amont d'un gène. Cette fixation va permettre la fixation du complexe d'initiation de la transcription et de l'ARN polymerase et le gène cible va être transcrit, puis maturé et traduit.  [...] Les homéodomaines sont des séquences très bien conservées au cours de l'évolution des différents êtres vivants et les protéines à homéodomaine jouent des rôles importants de régulation de l'activité génique en se fixant sur l'adn. C'est bien ça.  [...]

[Biologie Cellulaire] L'adn

On inclut dans le gène toutes les séquences régulatrices de la transcription. Dans tous les cas, elles sont présentes en amont du site d'initiation de la transcription donc non transcrites. ce sont les promoteurs dits extragéniques bien qu'on les inclue dans le gène.  [...] Les structures secondaires A et B sont observées in vivo. Ce ne sont pas des anomalies. la variation locale de la structure d'ADN permet de modifier l'accessibilité de certaines séquences à des protéines, ce qui permet une régulation génique.  [...]