• Santé - Régions, Séquence, Protéine

[Biochimie] Expression protéique

sinon, avoir un messager de donne pas toujours de protéine. Il faut des régions régulatrices et pas uniquement la séquence codante.  [...] La séquence est correcte puisqu'elle a été séquencé et est à 100% identique à l'originale. La protéine vient de Rhodococcus equi et a été cloné dans M. marinum. Ses deux organismes appartiennent au groupe des Nocardia et ont un GC% plus ou moins semblable (65% environ).  [...]

De l'intérêt d'être chaperonnée... pour une protéine!

coli) a montre que les sites de liaison de cette proteine sur une sequence proteique semblent etre constitues d'une region centrale hydrophobe de 4 ou 5 aa entouree de deux regions riches en residus basiques. Dans une proteine de conformation normale, ces sites seraient inaccessibles mais en cas de denaturation une partie pourrait alors etre reconnue par la chaperonne.[/url].  [...] Je reviens juste la-dessus... Si la séquence protéique située après le codon stop, n'est pas une partie essentielle de la protéine, alors les mutations silencieuses peuvent s'y accumuler, sans pour autant que cette partie de la séquence soit inexprimée... non.  [...]

[Biologie Moléculaire] le mystère des séquences non codantes

Si on enlève à un gène ces deux régions, cela deviendra une séquence non-codante, mais possédant quand même l'information génétique de ta protéine. Celle-ci, si le gène est unique dans ta cellule, ne sera jamais exprimée.  [...] Il ne faut pas interpréter les choses ainsi. une séquence codante code pour une protéine et est donc utile pour la cellule alors qu'une séquence non-codante ne code rien et est inutile. Loin de là. Une séquence codante donne une protéine alors que l'autre permet à ta cellule de contrôler quand, comment et dans quelle circonstances une séquence codante doit être transcrite et/ou traduite.  [...]

Surexpression d'un gène

Un gène qui connait une surEXPRESSION et donc une quantité de protéines plus importantes, peut avoir de conséquences d'engendrer des pathologies graves. Est-ce que l'origine de ce gène est dû à une mutation La génothérapie peut donc y remédier.  [...] la mutation peut se trouver dans la sequence codante, un intron, ou le promoteur, ou meme des régions régulatrices. Cela peut aussi être du a une mutation sur une autre protéine qui contrôle l'expression de la premiere.  [...]

[Biochimie] Profil d'hydropathie

Bonjour. Je voudrais savoir comme on peut deduire, a partir d'une profil d'hydropathie, quels sont les acides amines basiques (chargé +) et acides (chargé -).   [...] Un profil d'hydropathie ne permet pas de savoir quel acide aminé (AA) est basique ou acide. Il est utilisé pour déterminer les régions hydrophobes (notamment celles qui peuvent être potentiellement transmembranaires) de ta protéine à partir de sa séquence en AA que tu connais.  [...]

[Génétique] Gène plus court?

Les deux protéines ont la même fonction chez les deux organismes et la région manquante n'est pas la région importante puisque ce sont les régions N et C terminales qui doivent être conservées pour avoir une protéine active. Si je regarde la séquence nucléotidique, il ne manque pas 39 nucléotides.  [...] Merci infiniment du coup de main... Je peux vous dire ce que j'ai trouvé. j'ai donc découvert dans la séquence nucléotidique l'apparition de deux jonctions d'épissage au dessus et en dessous de la délétion... Se pourrait-il que ma protéine plus courte vienne de cela.  [...]

[Biologie Moléculaire] terminateur rrnb vecteur pMAL

Je viens de cloner mon gène dans un vecteur pMAL pour produire la protéine en système bactérien. Le gène est sous promoteur tac qui permet l'induction par l'iptg, mais du côté C-terminal après la séquence il y a deux régions terminatrices rrnB, que je n'avait jamais vu sur les vecteurs de type pET par exemple.  [...] Quel est l'interêt de ces séquences, pourquoi avoir choisi rrnB et pourquoi 2 régions terminatrices et non une seule.  [...]

[Biologie Moléculaire] structure de Na+ ATPAse porcine

ma 2eme question en pièce jointe je vous ai mis 2 séquences l'une pour la NA+/K+ ATPase porcine ( en haut) et l'autre pour la Ca+ ATPase du lapin (en bas ) et de cela j'ai besoin de savoir c'est quoi les régions importantes pour la Na+/K+ ATPase et si de cette séquence je peux voir les sites de liaison à l'ATP.  [...] Un simple alignement de séquence n'est pas suffisant pour déterminer comment se fait l'interaction. Ca se passera très probablement dans les régions les plus conservées comme les hélices 2 et 4 mais tu as besoin de plus d'infos pour aller plus loin. Un alignement avec une autre protéine dont la structure 3D en présence d'ADP/ATP peut indiquer quelles aa se lient à l'ATP et comment, il y a également la possibilité de muter les résidus conservés et de regarder ce qui se passe (moyennant toutes les précautions habituelles en terme de repliement notamment).  [...]

Le gène SRY

Les régions promotrices en revanche sont en général considérées comme faisant partie intégrante du gène car gène ne signifie pas seulement séqauence codante mais ce terme comprend normalement toute la séquence nécessaire à la synthèse d'une protéine. Il y a parfois des ambiguités sur ce qu'on entend par gène.  [...] Mais pour que la transcription ait lieu, il faut un site de fixation de l'ARN polymérase situé un peu en amont du gène (deux courtes séquences qui se ressemblent beaucoup d'un gène à l'autre et situées générallement à la même distance du début de la séquence trancrite d'un gène à l'autre).  [...]

[Biochimie] Empreinte à la DNase+ TAMOXIFENE

Tout d'abord je ne suis pas totalement sure d'avoir compri comment on detecte une sequence ENHANCER ou SILENCER par la DNASE footing prints. Dapres mes notes les regions ENhancers ont beaucoup de Proteines regulatrices donc sont peu accessible a la DNASE, qui donc ne coupe pas cette sequence.  [...] Cette méthode permet de démontrer qu'une protéine X se fixe à une séquence approximative Y de l'ADN, mais ne permet pas de dire si Y est enhancer, silencer ou quoi que ce soit d'autre.  [...]