• Santé - Reconnaissance, Séquence, ADN

[Biologie Cellulaire] Télomères et vieillissement

La télomérase permet de répliquer la portion simple brin. Donc il n'y a pas ou plus de perte de ladite séquence dans les cellules où son expression est constitutive (cellules germinales, cellules souches) ou ectopique (cellules somatiques potentiellement cancéreuses).  [...] Certaines protéines reconnaissent la séquence télomérique et participent à sa structure. Quand la séquence est devenue trop courte, elles ne peuvent plus se fixer. Cette étape déclenche plusieurs voies de signalisation impliquées dans la reconnaissance des dommages à l'ADN (rôle d'ATM ou de p21 par exemple) et conduit au blocage du cycle cellulaire.  [...]

Définition | Enzymes de restriction | Futura Santé

Ces enzymes sont des endonucléases. elles possèdent donc un site actif d' hydrolyse de l'ADN, mais aussi un site de reconnaissance de la séquence cible, aussi appelée site de restriction.  [...] Elles sont très utiles en biologie moléculaire pour extraire ou recombiner des morceaux d'ADN lors de clonages. On utilise beaucoup EcoRI, BamHI ou encore HindIII, qui reconnaissent respectivement les séquences GAATTC, GGATCC, AAGCTT.  [...]

[Génétique] Questions d'approfondissement diverses et variées

* Est-ce que quelqu'un aurait des infos sur le mode de reconnaissance de l'ADN non étranger par le transformosome de H. influenzae Je sais qu'il y a une séquence particulière de 9 nucléotides qui est reconnue, mais comment.  [...] * Comment est assurée la protection des îlots CpG au niveau du 5' d'un gène chez l'humain Je m'explique. La fréquence attendue du dinucléotide CpG dans le génome humain est de 4%. or, ce que l'on a observé (LE papier sur le génome humain séquencé de Nature), c'est que cette fréquence est de 1/5 de la valeur attendue.  [...]

[Génétique] Fermeture éclair à Leucine

Je sais que la fermeture éclair à leucine permet la dimérisation de 2 fos ou de Fos/Jun grâce à une reconnaissance d'une séquence de l'ADN. Par contre je n'ai pas bien compris. est-ce qu'il faut toujours qu'il y ai une séquence palindromique où celle ci n'est nécessaire que pour les homodimères Où est-ce que cela dépend du complexe qui se fixe.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gel de retard

Le principe d'un EMSA, c'est qu'un fragment d'ADN lié à un facteur est plus lourd donc migrera moins vite qu'un fragment d'ADN seul, ce qui permet donc (avec les contrôles adéquats) de démontrer que telle protéine se fixe sur telle séquence, ou que telle séquence est un domaine de fixation d'un facteur,  [...] Il peut s'agir d'un des nombreux types d'interactions entre facteur de transcription et l'ADN (helice boucle hélice, zinc finger, glycine zip,...), de la reconnaissance par un acide nucléique complémentaire de la séquence qui ferait part d'un complexe, etc.  [...]

[Biochimie] Synthese protéique

Ce sont les facteurs de croissance, liposolubles ou hydrosolubles, qui vont venir, soit traverser la membrane plasmique de la cellule par lipodiffusion, et trouver un récepteur cytosolique qui va lui ( facteur de transcription), entrer dans le noyau grâce à un NLS ( signal de reconnaissance) et venir transcrire la séquence spécifique d'ADN.  [...] soit donc aussi par transduction, le facteur de croissance, vient rencontrer un récepteur membranaire, et par effet TRANS, par des cascades de réactions cela va entrainer, la phosphorylations de protéines G cytosoliques puis la phosphorylations de kinases qui vont elles phosphoryler des facteurs de transcriptions qui vont donc eux aussi transcrire une séquence d'ADN.  [...]

[Immunologie] origine de la diversité des anticorps

Concernant la diversité génétique de l'origine des Ac. un premier epissage se fait au niveau de l'ADN par l'intermédiare de séquence signal de reconnaissance et un 2me épissage se fait au niveau de l'ARN m afin de ne sélectionner uniquement les séquences variable et constante qui nous intéresse.  [...] Il me semble que cela se produit (ou une partie en tout cas) pendant la maturation des lymphocytes, dans la moelle pour les B et dans le thymus pour les T avec le recombinaison somatique et compagnie.   [...]

[Biologie Moléculaire] Fonctions de ARNtracr et ARNcr dans le processus de dégradation de CRISPR/Cas9 chez bactéries

Lorsque dans la bactérie, l'ADN viral d'un bactériophage est détecté et reconnu, la séquence d'ARN complémentaire à celui-ci est transcrit.  [...] CRISPR-Cas9 est un élément qui permet à des bactéries (je ne sais pas si de nombreux genres l'ont) de se défendre des infections causées par les phages. Le système comprend trois principaux éléments. les crRNA qui sont issus d'ADN étrangers (de phages) qui se sont intégrés dans le génome bactérien, les tracrRNA qui permettent 1) la maturation des crRNA 2) la reconnaissance du crRNA lorsqu'il s'est fixé sur l'ADN du phage via une courte séquence complémentaire 3) l'activation des 2 domaines endonucléase de Cas9.  [...]

Pam

Il a récemment été démontré que la reconnaissance de la séquence d'ADN cible se fait dans un premier temps via un Protospacer Adjacent Motif (PAM). Ce motif est uniquement présent chez le pathogène, ce qui garantit que le complexe crRNA+tracrRNA+Cas9 ne dégrade pas l'ADN de l'hôte.  [...] Où se trouve le le domaine reconnaissant la séquence PAM (PAM-Interacting Domain). J'ai lu que la reconnaissance se faisait via une reconnaissance de la structure 3D ( Garside & MacMillan Cas9 in close-up Nature Biotechnology 2014) la publication contenait également un schéma laissant penser que ce domaine se trouvait sur une structure secondaire du tracrRNA.  [...]

urgent: recombinaison chez les bactéries

salut, comme je me suis dejé présenté (jeune prof) et que je doit préparer des cours dur la recombinaison génétique...ben j'ai commencé un peu à travailler sur la transformation...mais ce qui m'intrigue ce sont quelques points que j'aimerai qu'on m'aide un peu à clarifier.   [...] salut, pour les recombinaisons homologues ches les bactéries, elles sont basées sur l'homologie des séquences entre l'ADN exogène et l'ADN de la bactérie receptrice, c'est des régions d'environ 200pb similaire entre les deux ADN, c'est une sorte de reconnaissance, un prérecquis pour la recombinaison et l'introduction d'une molécule d'ADN exogène.  [...]