• Santé - Recherche, SNP, Extension, Amorces

[Biologie Moléculaire] Re : Actu - Un projet pour séquencer mille génomes

Je dois réaliser une technique de recherche des SNP par la technique SnapShot - extension d'amorces. Est-ce que quelqu'un connait cette technique et pourrait me l'expliquer, s'il vous plait.  [...] J'ai sorti ce message de la discussion où il était pour le mettre en Biologie où il a plus de chances d'avoir une réponse. par contre il faudrait changer son titre (je ne peux pas le faire dans ce forum) et en avertir jamies.   [...]

Ce gène qui peut vous faire paraître plus vieux que votre âge

Pour la première fois, des chercheurs ont identifié un gène qui influence l'âge apparent de notre visage. Les personnes qui portent deux versions mutées du gène MC1R paraissent deux années de plus.   [...] Les scientifiques ont recherché des associations entre l' âge apparent des participants et des millions de variations dans leur génome. les SNP ( single nucleotide polymorphisms ). Les associations génétiques les plus fortes concernaient des SNP du gène MC1R.  [...]

Les niveaux d'expression génique sont importants dans le phénotype

En général, les chercheurs étudient un seul caractère et cela nécessite plusieurs années de recherche intensive avant qu'une explication génétique ne voie le jour. Les membres de l'équipe de Vivian Cheung de l'Université de Philadelphie ont abordé le sujet de manière plus rapide en analysant simultanément des milliers de caractères puis ont utilisé les informations glanées pour revenir sur des bases génétiques.  [...] Grâce au programme HapMap développé par le National Human Genome Research Institute des NIH, les chercheurs ont recherché des SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) situés à proximité des gènes identifiés. Les SNP sont des variations ponctuelles d'une paire de base de l' ADN.  [...]

Help please ! Design d'amorces pour l'insertion de 3 nt

Une des deux amorce correspond tout simplement à la séquence formée par les 15 premiers Nt. L'autre amorce correspond aux 15 Nt complémentaire des 15 derniers Nt de ta séquence à amplifier.  [...] C'est tout bête, il suffit d'appliquer le principe que j'ai énoncé précédemment, en fait. A savoir. Une des deux amorce correspond tout simplement à la séquence formée par les 15 premiers Nt. L'autre amorce correspond aux 15 Nt complémentaires des 15 derniers Nt de ta séquence à amplifier.  [...]

[Génétique] Banque de SNP

je recherche des banques de SNP complètes et facile à utiliser. Ceux qui en connaissent j'attends vos réponses et des explications si vous pouvez. Merci d'avance.  [...] Auncune banque de SNP n'est complète, dans le sens où nous ne disposons pas d'une information exhaustive sur l'ensemble des polymorphismes existants dans une population/espèce.  [...]

Le secret de la résistance au Sida : la protéine HLA-B

Une nouvelle découverte permet de mieux comprendre pourquoi certains patients infectés par le VIH ne développent pas le Sida. la protéine HLA-B impliquée dans le système immunitaire diffère au niveau de 5 acides aminés. Une petite différence génétique qui pourrait inspirer la recherche d'un vaccin.  [...] Presque 1.000 contrôleurs du VIH ont pris part à cette étude. Leurs génomes ont été comparés à ceux de 2.600 personnes infectées par le VIH chez qui le virus parvient à se multiplier normalement. Les équipes de recherche américaines impliquées dans le projet ont passé l' ADN des patients au crible, à la recherche de variations nucléotidiques dans la séquence ( SNP ) qui pourraient être liées au contrôle de l'infection.  [...]

Génétique Moléculaire

- épissage avec 2 sites de polyadénylation (AAUAAA). L'exon portant le site de polyadénylation signal la fin de l'épissage. La tout va dépendre des facteurs d'épissage et de leur affinité pour le choix de l'exon final.   [...] - épissage alternatif avec 2 promoteurs. L'exon portant le promoteur choisis on aura telle ou telle séquence transcrite. ce sont des promoteurs alternatifs et là aussi tout va dépendre des facteurs d'épissage et de leur affinité pour le choix du promoteur.   [...]

[Biologie Moléculaire] Genotype imputation et single-track assay SNP genotyping ?

Je ne comprends pas comment fonctionnent l'imputation et le single-track assay SNP genotyping. J'ai l'impression que c'est de la bio-informatique et mon service n'en pratique pas. Je suis une débutante dans ce domaine.  [...] Pour le SNP calling, je sais que c'est la recherche des SNP par NGS, mais je ne sais pas comment on fait pour traiter cette multitude d'informations.  [...]

[Génétique] génome humain

J'ajoute qu'en plus de ces différences ponctuelles (qu'on appelle SNP. single nucleotide polymorphism) il y a d'autres différences, notamment les mini- et microsatellites, qui sont utilisés par la police scientifique, pour la recherche de paternité, etc.  [...] Our extensive knowledge of the locations of commonly occurring SNPs and ever-advancing hybridization platform technology have allowed for the capture of over 2 million of these variants on a single assay using modern SNP-chip technology.  [...]

Système nerveux entérique

, est ce que le systeme nerveux entérique comprend une chaine sympathique et une chaine parasympathique Ou bien c'est un système different du système autonome.   [...] ben voilà après une longue recherche j'ai pu trouver que. le système nerveux est composé en 2. le SNC et le SNP, ce dernier est divisé en 3. sympathique, parasympathique et entérique, en ce qui concerne l'entérique il est spécifique au tube digestif mais est en contact avc le cerveau, il est en interaction avc le sympa et le parasympa mais fonctionnent indépendament des autres centres nerveux.  [...]