• Santé - Ratio, Acides, Protéines, Méthode

[Biochimie] Dosage spectrophotométrique des protéines

Il y a le nanodrop pour doser les protéines. Dans le principe, cela reste de la spectrophotométrie puisqu'on dose l'absorbance d'une goutte d'échantillon déposée sur une lentille qui émet un faisceau de lumière à 280 nm. L'avantage est qu'il n'y a pas besoin de cuve en quartz pour le dosage (à la différence des spectrophotomètres classiques pour le dosage de protéines sans coloration), il n'y a pas besoin de coloration, et surtout très peu de matériel biologique est utilisé pour le dosage puisque le volume de la goutte déposée pour le dosage est de l'ordre de 1 à 3 µl.  [...] Vous avez aussi le dosage par Warburg et Christian. Il permet la séparation des acides nucléiques et protéines selon un ratio propre à la méthode.  [...]

[Biologie Moléculaire] extraction d'ADN

j'aime bien vous poser une question très précise en ce qui concerne l'extraction de l'ADN a partir des graines de soja. la quantité d'ADN extraite a partir de 100mg de poudre peut elle atteindre 900 ng /ul.   [...] Et tant qu'on y est sur les précisions, il est exact que le pic d'absorption des acides nucléiques, aussi bien ADN que ARN, est à la longueur d'onde 260nm, mais les protéines absorbent aussi à 260nm même si leur pic est à 280nm. C'est la raison pour laquelle on mesure les deux et que le ratio doit être proche de 2 pour indiquer une bonne pureté en protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] DNAse est elle essentielle à l'extraction d'ARN (pour qPCR)

Pour la nécessité de la DNAse, ça n'est pas nécessaire avec le trizol et encore moins si les primers sont bien designés. Un contrôle négatif de RT avec chaque couple est suffisant pour la plupart des situations.   [...] Le nanodrop est un spectro qui va distinguer les acides nucléiques (ARN + ADN) des protéines. Le fait que les rapports soient bons ne vous renseigne pas sur le ratio ARN/ADN. Ne prenez pas cela comme une référence de pureté de vos ARN.  [...]

Après les fêtes ...

Enfin, pour un individu jeune avec activité physique normale et régulière, faut-il impérativement consommer des protéines tous les jours et en quelle quantité (y a t il un ratio en g/g de poids corporel ) Que pensez-vous des protéines végétales telles que le soja (qui ne contiennent pas tous les acides aminés essentiels tels que la lysine, méthionine).  [...] Les plats traditionnels comme le couscous (semoule de blé associée à des pois chiches) ou les tortillas mexicaines (galettes de maïs accompagnées de haricots rouges) en sont de parfaits exemples. L'oeuf, ayant pour sa part des teneurs en acides aminés essentiels élevées voire très élevées, est toujours un aliment utile et efficace pour compléter aussi bien les protéines des céréales déficientes en lysine, que celles des légumineuses déficientes en acides aminés soufrés (méthionine et cystéine).  [...]

[Biochimie] Protéine hydrophile ou hydrophobe ?

Les acides aminés polaires ou chargés vont donc être mis à l'extérieur de la protéine si les conditions aux pourtours de la protéine sont hydrophiles. Même constat pour les acides aminés hydrophobes (ex des protéines membranaires. les acides aminés hydrophobes encapsulent les polaires/chargés à l'intérieur de l'enzyme, car la membrane est ultra hydrophobe).  [...] C'est justement parce que le ratio d'acides aminés hydrophobe/hydrophile ne suffit pas à prédire le statut hydrophile ou hydrophobe de la protéine que je suis perdue.  [...]

[Biotechnologie] Ogm absorption

Mais quelles que soit la nature des protéines modifiées on absorbe toujours quelques-uns des 20 aa (Glu, Gly ….) et ce qui change entre un aliment normal et ogm, c'est la proportion de chaque aa traduit, non.  [...] Je ne pense pas que le problème viennent d'un ratio d'acides aminés. Je doute que quelques protéines supplémentaires aient un quelconque eeffet (en revanche on a aucun moyen de tester la structure tridimensionnelle de la protéine issu du transgène se pose alors le problème d'un potentiel prion).  [...]

Petite énigme à vous soumettre...

Bon je détaille un peu plus mon idée de départ Je pense en effet donc à un criblage haut débit, avec par exemple un criblage in-silicio suivie d'une étude plus poussée des molécules retenues par RMN. En effet, la RMN est une très bonne méthode pour mettre en évidence des intéractions protéines-ligand, et pourrait donc permettre d'obtenir des données fort intéressantes.  [...] De plus, je me permets une remarque sur ton idée de radiomarquage, qui ne me semble assez chère aussi, et la seconde méthode, avec le second messager, qui, si testée indépendamment avec chaque molécule, sous-entend... 20.000 manipulations Avec assez de cultures cellulaires pour chaque expérience, extraction des seconds messagers, révélation des protéines... Est-ce bien réalisable.  [...]

[Biochimie] Améliorer la quantité, qualité et pureté d'une extraction d'ARN

J'ai obtenue une concentration pour la méthode de précipitation de 1240 ng/µL avec les ratios de 260/280 est de 1,66 et 260/230 la valeur est de 1,59 permettant de dire qu'il y a une très grande contamination en matière organique. Pour l'échantillon de colonne est de 440 ng/µL Pour l'échantillon de colonne, la valeur du ratio 260/280 est de 2,08 permettant de conclure qu'il n'y a pas de contamination protéique.  [...] Je me suis trompé d'image. Voici l'image de la migration des échantillons pour les 2 méthodes Mon coéquipier et moi avons fait les mêmes méthodes donc on a 2 échantillons de chaque méthode. Toutefois, dans les échantillons extrait par colonne sont plus dégradés ce que j'arrive pas à comprendre.  [...]

[Génétique] Extraction, purification et analyse d'ARN (Nanodrop et bioanalyser)

LEs ratios permettent uniquement de s'assurer de la pureté d'un acide nucléique. En effet l'absorbance a 230 concerne divers composés organiques (phénol par exemple) et celle a 280 les protéines. Un ratio de l'ordre de 2 permet de voir que ton extrait est assez propre et ne contient presque que de l'acide nucléique.  [...] Utilisé pour l'electrophorèse après la PCR. La question...est-ce utilisé pour charger l'ADN. L'ADN étant acide, dans une solution basique il aurait tendance à libérer des protons et donc se charger. (pour faire une analogie, il prendrait le rôle du SDS [quelque chose comme ça] pour l'electrophorèse des protéines ).  [...]

[Biologie Moléculaire] rapport 260/280 et 260/230

Cependant je ne sais pas quelle est le le seuil de pureté pour ces deux rapports et j'aurai aimé savoir si ils mettaient en évidence des impuretés spécifiques.   [...] Mais ton ration 260/230 est trop bas, et montre que tu as une contamination par des produits organiques (généralement des tampons) dans ton échantillons.  [...]