• Santé - Quantité, Protéines, échantillons

[Biochimie] travail sur le lait

Nous aimerions mesurer la quantité de protéines présentes dans chacun des échantillons, par spectrophotométrie.  [...] Ensuite, Nous voudrions en faire du yaourt pour observer et si possible quantifier les différences de précipitation des caséines.  [...]

[Biologie Moléculaire] gel 1D

pourtant après dosage la quantité de protéines semble suffisante j'ai par exemple 1.6µg/µl je ramène tout les échantillons à cette concentration, j'ai engagé une plus grande quantité de protéine 65µg. j'ai vérifié les pH des tampon tris pour les deux gels (concentration et séparation) je travaille avec la même source.  [...] je voudrai savoir aussi si le fait de d'augmenter la tension un peu peut provoqué ça je fais ça parfois quand je viens le matin pour activer la migration, mais j'ai toujours eu l'habitude d'avoir de beau gels.   [...]

[Microbiologie] Quantité de protéines/biomasse

Après des manipulations sur une souche de Pseudomonas nous avons pu établir des courbes nous donnant la quantité de protéines présente dans différents échantillons.  [...] Merci pour ta réponse. Donc si lors de la croissance de la souche il y a accroissement de la biomasse couplé à l'accroissement de la quantité de protéines cela signifie que la souche grandit dans des conditions favorables.  [...]

Calcule d'activité spécifique à partir absorbance

Voila j'aimerais savoir comment calculer une activité spécifique de mon enzyme (trypsine) à partir d'une absorbance à 280 nm (fixé pour savoir quantité de protéines dans échantillons) et à 410 nm (la pente del a mesure de l'hydrolyse de mon subtrat par mon échantillon de trypsine en fonction du temps).  [...] La personne qui m'encadre m'a dit que je pouvais soit poser A280 1mg/ml= 1 ou partir du coeff molaire= 40000 (c'est pour faire une approximation car mon échantillon n'est pas totalement pure).  [...]

[Biochimie] Aggrégation des échantillons de SDS-PAGE

Je souhaite mettre en évidence la présence de protéines dans des échantillons de récifs carbonatées. Ce sont des protéines de biominéralisation (processus par lequel les organismes vivants produisent des minéraux pour renforcer leur tissus, ex. coquille). J'ai entre autre réalisé un test BCA qui m'a prouvé la présence de ces protéines (en faible quantité mais présentes).  [...] Je souhaite mettre en évidence la présence de protéines dans des échantillons de récifs carbonatées. Ce sont des protéines de biominéralisation (processus par lequel les organismes vivants produisent des minéraux pour renforcer leur tissus, ex. coquille).  [...]

[Biotechnologie] Culture bactérienne et protéines recombinantes en plaque 96 puits

Je souhaite réaliser des tests d'expressions de protéines recombinantes (système bactérien) en format plaque 96 puits (différents vecteurs, TAG, condition de culture, souche bactérienne etc). Je suis à la recherche d'un système permettant, après la lyse du culot bactérien, de séparer rapidement les fractions solubles et insolubles des protéines, directement en système 96 puits.  [...] Je réalise déjà des tests d'expression de protéines recombinantes (sreening des meilleures conditions) mais en format tube...et ça prends beaucoup de place pour gérer la quantité d'échantillons. Habituellement, je réalise une étape de centrifugation à 15000g 30min 4°C en tubes, après la lyse bactérienne via un tampon de lyse commercial, pour séparer les fractions solubles/insolubles et analyser dans quelles fractions se trouvent la protéine produite (par SDS PAGE/WB/ELISA).  [...]

[Biologie Moléculaire] western blot "semi-quantitatif", pourquoi??

Elle serait quantitative si vous déposiez une gamme de concentration de la protéine que vous souhaitez quantifier. En général ce que l'on fait c'est que l'on utilise une protéine standard (l'actine) et on dilue les échantillons pour avoir la même quantité dans tous les puits.  [...] Il est possible en western blot d'observer des variations de quantité de protéines, mais il faut être prudent pour éviter les biais méthodologiques. par exemple quand j'en faisais, j'utilisais comme référence la quantification d'un de mes échantillons, le même tout au long de la manip, je déposais chaque échantillon en double avec 2 concentrations différentes (ce qui me permettait de vérifier la proportionnalité entre mes 2 dépôts.  [...]

[Biologie Moléculaire] les ARNs et extraction

Les échantillons sont déposés 2 fois mais à des quantité différente (les puits d'en haut contiennent moins de quantité d'ARN que les puits d'en bas). Je ne vois qu' un smear et dans tous les autres cas on ne distingue rien. Ceci est lié à une dégradation de l'ARN Peut-on dire qu'il y a contamination avec de l'ADN ou des protéines comment expliquer que dans un cas il y a un smear et que lorsque que l'on en dépose plus il n'y a rien merci de vos réponses.  [...] En fait dans les premiers puits en haut on a mis 1ug d'ARN après dilution (on le calcule a partir de la DO) et dans les puits d'en bas sont les mêmes échantillons avec 1µL de solution d'ARN (ça doit faire à peu près 10 µg). Il y a plusieurs puits car plusieurs dépôts on été fait à partir de plusieurs extraction (test de la répétabilité de la méthode).  [...]

Premiers résultats de génomique fonctionnelle appliquée au muscle et à la qualité de la viande chez le bovin | Dossier

Les protéines sont ensuite colorées et quantifiées par un système d'analyse d'images. Les protéines dont les teneurs varient entre échantillons musculaires sont découpées, extraites du gel et identifiées par spectrométrie de masse puis à l'aide d'outils de bio-informatique.  [...] , 2004). Cette carte, qui sera complétée progressivement, servira de support pour l'étude du protéome du muscle de bovin dans le cadre de différentes problématiques (développement musculaire, qualité de la viande). L'analyse des gels indique que les variations quantitatives et qualitatives des protéines du muscle ne concernent qu'une très faible proportion d'entre elles (inférieure à 10%).  [...]

[Biologie Moléculaire] Biochimie: méthode de Western Blot

En fait, doser les protéines avant un Western blot permet de déposer la même quantité de protéines dans chaque et pour chaque échantillon.  [...] Ainsi, si tu as deux échantillons identiques, mais que tu déposes deux quantités différentes de protéines, les deux bandes auront une intensité différente. Ce qui peut fausser les conclusions (genre. mon echantillon 1 a plus de protéines que le 2, donc le 2 produit plus efficacement).  [...]