• Santé - Protéines, Séquences, Durée de vie, ARNm

[Biochimie] si RNA

Dans ce cas il ne faut que quelques heures pour que le siRNA pénètre dans la cellule. La transfection ne dure que 4-6 heures. En revanche, pour observer une extinction de la protéine ciblée, il faut attendre plus longtemps. Une fois le siRNA à l'intérieur de la cellule, celui-ci va activer le complexe RISC chargé de dégrader spécifiquement les ARNm porteur de la séquence ciblée par le siRNA.  [...] Le processus de dégradation des ARNm prend un certain temps, mais ce qui va déterminer réellement le temps au bout duquel l'extinction de la protéine sera la plus forte, c'est la demi-vie de la protéine. En effet, les protéines traduites juste avant la dégradation de l'ARNm ont une durée de vie plus ou moins longue qui déterminera le moment où l'on verra une bonne diminution de leur quantité.  [...]

[Biologie Moléculaire] Durée de vie d'un ARNm particulier

En ce qui concerne les ARNm, la seule chose que j'aie trouvée est dans le cher Genes (volume 100000... je ne me souviens plus lequel, tellement il y en a), où Lewin parle d'attaques d'endo- et exonucléases mais les fréquences ne sont pas connues, les séquences cibles (il y en aurait) non plus.  [...] La stabilité des ARNm procaryotes peut être affectée par la séquence 5' UTR, et en particulier la présence de structures secondaires (génant la traduction). Des études ont été menées sur la stabilité des ARNm des protéines de choc froid chez E. coli dont la demi vie passe de 12 secondes à 37°C à 20 min à 15°C.  [...]

ARN traduction protéique

Les ARNm qui ont une durée de vie courte ont une région riche en A et en U dans la région 3'. Des protéines spécifiques peuvent s'y fixer pour réguler la vitesse de dégradation de l'ARNm. Cette vitesse de dégradation changera donc pour chaque l'ARNm différent selon l'importance de ses régions riches en A,U et la présence de protéines régulatrices.  [...] Exemple. La séquence IRE (riche en A et U, sensible à la dégradation) de l'ARNm de transferrine. La protéine qui s'y fixe, IRE-BP, permet de protéger l'ARNm de transferrine de la dégradation.  [...]

Les résultats déjà obtenus | Dossier

5% d'activité ont été mesuré après traitement à la gentamicine dans les cellules possédant seulement la mutation Arg208 (17). Les auteurs expliquent que ces différences peuvent provenir de différents paramètres, tels que la stabilité de l' ARNm (les ARNm contenant un codon stop précoce sont instables), la durée de vie de la protéine etc.  [...] Il est important de noter qu'il existe une différence essentielle, qui pourrait permettre d'expliquer ces différences de résultats. La protéine CFTR possède une activité enzymatique, alors que la dystrophine est une protéine de structure des muscles. Il est facilement envisageable que très peu d'une protéine ayant une activité enzymatique permette d'attenuer les effets d'une maladie, alors qu'il faudra une quantité plus importante d'une protéine de structure.  [...]

[Biologie Cellulaire] ARN messager ..

L'ADN ne pouvant quitter le noyau et contenant toutes les informations nécéssaires au fonctionnement de la cellule (en l'occurence, production de protéines), il faut pouvoir créer une molécule qui peut sortir du noyau et qui contient une copie de ces informations.  [...] l'ARNm a une durée de vie brève, mais il permet la synthèse de nombreuses protéines. Pour que le deuxième point soit vrai, il faudrait que la durée de vie de l'ARNm ne soit pas trop trop brève...Le mot brève est imprécis en plus (quelques minutes, heures), c'est un mot relatif qui dépend trop du point de vue de chacun.  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcription ARNr/ARNm

* d'un autre, qu'en est-il des ARNm d'une durée de vie très petite Oui, je veux bien qu'un ARNm puisse servir à faire plusieurs protéines... dans la mesure où sa durée de vie le permet. De là à dire qu'un ARNr ne sert qu'un ribosome, je veux bien. sauf qu'avec la précision que, oui ou non, un ribosome est dégradé à la fin de chaque traduction.  [...] A mon avis il y a une fourchette relativement courte où le rendement de production des protéines est le meilleur. Même en prenant en compte le fait que certaines ARNm ont des durées de vie très variable ça ne doit quand même pas varier du simple au quintuple non plus.  [...]

[Biochimie] Comment faire taire les gènes avec un ARN?

Les oligonucléotides antisens sont des courtes séquences d 15 à 20 nucléotides, dont la stabilité a été renforcée de sorte que leur durée de vie soit beaucoup plus longue que celle d'un ARNm cellulaire. L'oligonucéotide antisens est capable de se lier, par complémentarité à une séquence spécifique d'un ARNm cellulaire.  [...] Il se forme ainsi une molécule hybride. l'ARNm contient une portion a deux brins, car hybridées avec l'oligonucléotide antisens. Des essais cliniques ont montré que les oligonucléotides antisens pourvaient bloquer la réplication de certains virus en inhibant la synthèse de certaines de leur protéines.  [...]

phase S histones

c'est la phase de la replication de l'ADN, mais les histones sont deja en place...c'est leur modification qui permet l acces à la chromatine.   [...] Oui. Lors de la phase S il y a production d'une grande quantité d'histones qui permet de compacter le surplus d'ADN issu de la réplication.   [...]

[Divers] "clivage" de protéines néosynthétisées

Salut, j'ai surtout vu ça dans le cas d'une cellule qui synthétise des protéines pour le compte d'un virus, elle réalise une étape de clivage des protéines. ça veut dire quoi.  [...] Tu citais les virus, prenons l'exemple du VIH. La traduction des 2 ARNm conduit à la synthèse de trois précursuers protéiques. Ces protéines là sont ensuite clivées (coupées) en plusieurs séquences pour former l'ensemble des protéines virales matures.  [...]

IRP et IRE

Lorsque la concentration de fer libre est basse, le 3'UTR va former des boucles. une protéine IRP va se fixer sur ces boucles et vont empêcher la dégradation du RNAm par des RNAses. Donc — de la durée de vie de l'ARNm. une protéine IRP va se fixer sur le 5'UTR et par conséquent le complexe de pré-initiation ne va pas se former.  [...] Seulement on parle aussi de IRE. Je me demandais si IRE était les boucles qui se formaient dans le 5'UTR ou bien si c'était de sprotéines qui se fixaient sur ces boucles et puis que IRp se fixait sur ces IRE.  [...]