• Santé - Protéines, Peptides, Extrait, Bande, Procédé, Analyse, Extraction

digestion enzmatique suivie de HPLC phase inverse

voila je voudrais savoir qd on fait une digestion enzymatique d'une protéines par la trypsine par exemple est ce que après on fait une électrophorèse des différents peptides est ce qu'on extrait la bande correspondant à un peptide donné du gel et ensuite on procède à son analyse par HPLC si oui comment se fait cette extraction.  [...] et une dernière question est ce que l'analyse en HPLC se fait peptides par peptides extrait du gel ou bien c'est tout le mélange issu de la digestion enzymatique qui passe à l'analyse en HPLC.  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

qd on fait une digestion enzymatique d'une protéines par la trypsine par exemple est ce que après on fait une électrophorèse des différents peptides est ce qu'on extrait la bande correspondant à un peptide donné du gel et ensuite on procède à la HPLC si oui comment se fait cette extraction.  [...] En fait, d'un point de vue général, on veut analyser des peptides les plus pures possible à la MS. Car plus l'échantillon est complexe, plus le signal (spectre) est compliqué et difficile à analyser. Lors de l'analyse de solution complexe (par exemple, une protéome entier), il est indispensable de séparer les protéines le plus possible avant de procéder à l'analyse.  [...]

[Biochimie] Trypsine ou Pronase

J'ai un TP de biochimie à faire où on doit purifier de l'ADN et à une certaine étape, on ajoute de la pronase à l'ADN pour briser les peptides en solution. Par la suite, on fait une extraction au phénol/chloroforme pour enlever les protéines et lipides de la solution contenant l'ADN. Alors, j'aimerais savoir.  [...] 1. Si on utilise de la trypsine au lieu de le pronase, cela fait en sorte que les protéines sont hydrolysées en de moins petits fragments. Ma question est. quel impact le fait d'avoir des fragments de protéine plus gros a sur le reste de la purification Est-ce que l'extraction au phénol/chloroforme sera moins efficace Si oui pourquoi.  [...]

Digestion avant MS

après il y a aussi des contraintes techniques. est ce que la protéine s'ionise bien en ESI, est ce qu'on dépasse pas la gamme de masse accessible.  [...] typiquement, on va faire un préséparation, une digestion, une séparation, l'injection en MS, puis analyse MS/MS pour avoir la séquence, la position modification post trad et sa séquence (s'il y en a une).  [...]

[Biochimie] Etude des protéines par spectrométrie de masse

En fait, suivant l'étude que l'on veut faire, on va devoir utiliser tel ou tel analyseur et c'est surtout ça qui va nous indiquer quelle source d'ionisation utiliser. Si on veut étudier un mélange complexe pour faire une étude d'interactôme par exemple, il sera préférable d'utiliser un analyseur orbitrap (un analyseur très résolutif) qui est toujours couplé à une source d'ionisation ESI.  [...] De plus, la source ESI est facilement couplée à une chromatographie liquide qui va entrainer la séparation des peptides avant l'entrée dans le spectro. Il est bien sur possible de le faire avec un appareil MALDI-TOF mais ca prendra beaucoup plus de temps puisqu'il faudra faire des gels à 2 dimensions par exemple pour séparer au maximum nos protéines puis faire l'extraction de chaque spot, reduction alkylation et digestion qu'on dépose sur la plaque MALDI (aujourd'hui la robotisation fait qu'il est possible de coupler une chromatographie liquide au MALDI).  [...]

Une protection anti-radiations apportée par une super-bactérie

Pour parvenir à ces conclusions publiées dans le journal Plos One, les chercheurs ont effectué une série d'expériences. Tout a commencé par l' ultrafiltration des bactéries. Ce procédé permet d'éliminer les grands éléments de la cellule, en particulier les protéines dont la taille est supérieure à 1 kilodalton (c'est-à-dire les peptides qui contiennent plus d'une dizaine d' acides aminés ).  [...] De plus, l'ultrafiltrat pourrait également être utilisé dans le cadre de la fabrication d'un vaccin très efficace pour détruire l'ADN du virus par irradiation sans dégrader les protéines dont le rôle est d'activer le système immunitaire. En revanche, la fabrication d'hommes ou d'animaux OGM résistants aux bombes atomiques n'est pas encore envisagée.  [...]

Origine de la vie et première cellule

C'était juste pour partager avec vous l'extrait d'un blogger américain qui cite les travaux de Doug Axe et d'Anne Gauger (Université de Cambridge, directeur du Biologic Institute), qui ont calculé une approximation de la probabilité de la formation d'une protéine à partir d'éléments simples (attention Anglais).  [...] En 1995, un procédé de synthèse des peptides (autrement dit, de courtes protéines), dans des conditions prébiotiques a été imaginé et testé par Auguste Commeyras, alors directeur du laboratoire de chimie organique de l'Université Montpellier II, et ses collaborateurs.  [...]

[Génétique] transfection

Voilà dans le cadre d'un projet en apprentissage je dois rendre un rapport sur les differentes méthode de transfection. Le probleme c'est que je ne sais pas par quoi commencer donc si pouviez me donner un petit coup de main en me donnant des adresses internet ou en me disant ce que vous savez sur la transfection leurs avantages, leurs inconveniant etc.   [...] - Les peptides. Il a été observé que quelques protéines peuvent entrer dans les cellules. L'analyse du.  [...]

Bactériocines

Les bactériocines sont difficilement extractable car il s'agit de petits peptides... Il faut donc généralement passer par plusieurs colonnes qui permettrons de les séparer des protéines et des acides aminés... ou des technologies de membranes avec un cut off adapté.  [...] D'un point de vue industriel on se dirige justement vers l'utilisation du microorganisme lui même et non seulement du composé produits, le résultats est incomparable au niveau du prix. Une extraction de protéine face à une lyophilisation ça ne fait pas le poids Sinon regarde les informations présentes sur la nisine qui elle, est produite à plus grande échelle et dont les techniques sont bien maitrisées.  [...]

Quelle était la probabilité de l'apparition de l'être humain ?

De plus, À l'époque où les processus auraient pu être hasardeux les protéines formés étaient de petits peptides de 3 à 10 acides aminés de long, et de tels peptides possèdent déjà des propriétés catalytiques intéressantes pour certaines réactions qui avaient peut-être une importance dans le processus qui aurait pu mener à la première cellule.  [...] Si on peut imaginer un processus évolutif qui va de ces peptides avec leur maigres (mais bien réelles) capacités catalytiques, jusqu'aux protéines modernes, alors on a raison, à mon sens, d'imaginer une vie à l'origine beaucoup, beaucoup plus simples que les bactéries actuelles, fruit d'environ 4 milliards d'années d'évolution.  [...]