• Santé - Protéines, Liaisons, Résidus

[Biologie Cellulaire] Protéines et liaisons convalentes entre 2 résidus soufrés

Il est inscrit dans un QCM, en tant que item vrai, que la forme protéine Prion est stabilisée par des liaisons covalentes qui s'établissent entre deux résidus soufrés.  [...] Ce QCM porte sur une partie d'un livre qui parle de la conformation des protéines et rapidement de la protéine Prion. or, il n'est inscrit nulle part dans cette partie du livre que les protéines -ou que la protéine Prion- est stabilisée par des liaisons covalentes entre résidus soufrés.  [...]

Pourquoi la Phospolipase provoque t-elle la lyse des GR?

On nous dit que le venin d'un serpent contient une protéase (qui rompt les liaisons peptidiques des protéines), une neuraminidase ( qui décroche les résidus acide sialique des gangliosides), et une phospholipase (qui clive les liaisons au sein des phospholipides).  [...] Pour la protéase et la neuraminidase il n'y a pas d'hémolyse des globules rouges par contre il y a hémolyse avec la phospholidase. L'analyse des produits d'hémolyse générés par un traitement phospholipasique révèle une énorme augmentation dans le milieu de la phosphorylcholine (choline liée à un groupement phosphate) et du diacylglycérol (glycérol lié à deux chaines d'acides gras).   [...]

[Biochimie] Formation de liaisons électrostatiques en absence de résidus chargés ?

Je n'arrive pas à trouver la réponse à cette question. La formation de liaisons électrostatiques au sein d'une protéine est-elle possible en absence de résidus chargés.  [...] Bien sûr, les liaisons électrostatiques ne sont pas dues aux charges portées par les acides aminés mais aux interactions atomiques.  [...]

[Biochimie] Coloration Bradford.

La méthode de Bradford est un dosage colorimétrique, basé sur le changement d'absorbance (la mesure se fait à 595 nm), se manifestant par le changement de la couleur du bleu de Coomassie après liaison (complexation) avec les acides aminées aromatiques (tryptophane, tyrosine et phénylalanine) et les résidus hydrophobes des acides aminés présents dans la ou les protéines.  [...] Donc tu détermines la concentration protéique de tes tubes. En connaissant le volume total d'échantillon, tu le multiplies par la concentration trouvée et tu tombes sur la masse totale de protéines présente dans chacun des tubes.  [...]

Définition | Collagène | Futura Santé

Le collagène se compose de trois chaînes de protéines, se liant entre elles pour former une triple hélice. Chez les mammifères il existe une trentaine de chaînes polypeptidiques distinctes et une quinzaine de variants de molécules de collagène dans les tissus d'un individu.  [...] La composition en acides aminés du collagène est particulière. près d'un tiers des résidus sont des acides aminés glycine et 15 à 30 % des résidus sont des acides aminés proline ou hydroxyproline. L'hydroxyproline fournit une certaine stabilité au collagène probablement grâce à des liaisons hydrogène avec des molécules d'eau.  [...]

Partiel compliqué!

Ainsi, une protéines qui aurait à sa surface de nombreux résidus hydrophobes aura un comportement différent d'une protéine qui enfouis les résidus hydrophobes au sein de sa structure.  [...] De même pour l'exposition des charges, selon que ta molécules soit chargées positivement ou négativement, cela doit influer sur son comportement en milieux aqueux, par l'établissement de liaisons hydrogènes.  [...]

[Biochimie] Questions Protéines / Enzymologie

1) Un prof de TD nous a dit que TOUTES les protéines absorbaient à 280nm cependant j'ai lu que seules protéines possédant des acides aminés aromatiques ( tryptophane, tyrosine, phénylalaline ) absorbaient à 280nm, qui a raison.  [...] Non vue que la chaîne tourne autour de l'axe. Par contre les liaisons hydrogène entre résidus sont à peu près parallèle à l'axe.  [...]

La diffusion de l'eau

Le pore qui sépare les 2 vestibules mesure 2 nm de long pour 0,28 nm de diamètre, et il forme le filtre qui contient des résidus arginine et histidine qui sont très conservés au cours de l'évolution et aussi 2 résidus asparagine dont les chaines latérales vont former des liaisons hydrogènes avec les molécules d'eau qui traversent le canal.  [...] Ces liaisons hydrogènes et le diamètre étroit du filtre empêchent le passage d'autres ions, en particulier H3O+. Au final on a environ 1 milliard de mlc d'eau par seconde qui passent par chacun de ces 4 canaux.  [...]

Liaison entre acide aminé

Pour les liaisons covalentes, elle ne concernent que le backbone, c'est a dire le lien entre les AA dans le sens de la structure primaire, ou les pont disulfure pour le structure tertiaire par réaction entre deux cystéine.  [...] Les liaisons ionique concerne les AA ionisable, dans une forme chargée. Les résidus ionisable sont ceux ayant un pKa pour leur side chain.  [...]

[biochimie] agrégation protéine à 320nm

La fluorescence intrinsèque des protéines est due aux résidus tryptophane et tyrosine. La grand majorité des études est faite avec les tryptophanes, puisque la tyrosine a un rendement quantique de fluorescence plus faible, et souvent elle transfert son énergie aux tryptophanes.  [...] Generalement, les aggrégats se forment suite à des défauts de repliement de protéines qui, au lieu d' enfouir leurs résidus hydrophobes, les exhibent à leur surface, créant l'aggrégation par interactions hydrophobes. Autant que je sache, ces agrégats sont, généralement, détruit par la cellule qui les stock dans des agrésomes.  [...]