• Santé - Protéines, Interactions, Anticorps

[Biologie Cellulaire] cadherines

Je souhaiterai savoir pourquoi la présence d'anticorps anti cadherines rompt le tissu embryonnaireSelon moi les cellules sont censées adhérer entre elles, donc je vois mal comment l'anticorps peut réussir a se fixer sur les cadherines.  [...] parce que certains types d'anticorps peuvent se fixer sur des sites d'intéraction de protéines et ainsi perturber leur fonction. Il faut comprendre que les interactions entre protéines sont souvent assez labiles, et qu'une fois l'anticorps fixé il a le dessus sur d'autres types d'intéractions.  [...]

[Biologie Moléculaire] Immunoprécipitation

Alors ma question c'est, pourquoi on fait l'immunoprécipitation qui est une méthode beaucoup plus longue et où on peut avoir des interférences avec des chaînes légères (peut être parce que seule protéines est présente sur la membrane) et peut être aussi parce que avec une électrophorèse sur les protéines totales il peut y avoir des interactions aspécifiques protéine-anticorps.  [...] Ensuite, une fois que vous avez immunoprécipité vous pouvez surtout mettre sur vos billes avec vos protéines un extrait protéique pour essayer d'identifier les interactants. Dans cette optique, le but n'est pas d'identifier la protéine fixée. Donc la manip' apporte bien un plus par rapport au WB.  [...]

[Biologie Moléculaire] Co-immunoprecipitation

Comme le titre l'indique je souhaiterai réaliser une c-immunoprécipitation afin de montrer l'interaction de deux protéines in-vitro. N'ayant absolument jamais réaliser ce type d'expérience, je souhaiterai savoir si cela est compliqué Ensuite, j'ai une question technique.  [...] lors de la précipitation de notre protéine cible avec un anticorps, faut il auparavant fixer notre protéine avec les autres protéines qui interagissent avec (je me dis que sans cela les interactions sont peut être trop faible pour permettre de visualiser sur western blot).  [...]

[Biochimie] dot plot et overlay

Dans le but d'étudier les interactions entre 2 protéines, je voudrais faire un dot plot pour immobiliser ma première protéine sur la membrane de nitrocellulose, par la suite je voudrais faire un overlay ou j'incube ma membrane de nitrocellulose dans la solution de la deuxième protéine et je révèle les interactions par l'anticorps de la deuxième protéine.  [...] En faite, comme j'en ai que peu des deux protéines je suis obligée de commencer par le dot plot et l'overlay pour voir les interactions possibles et par la suite je passerai a l'IP. J'ignore la quantité exacte de protéines que je dois déposer.  [...]

biotine et PCR

Tu marques donc tes amorces avec la biotine, et tu peux les révéler avec un anticorps (marqué antibiotine, ou tu peux les isoler, (passage sur colone avec anticorps antibiotine fixé.  [...] La biotinilation de tes amorces permets ensuite de reveler tes amplifications en les detectant grace a des anticorps anti-biotine. La biotine peut etre aussi utilisée pour purifier le produit (ou les proteines) sur des colones de streptavidine (la biotine et la streptavidine forment des interactions non covalentes qui ont pourtant une force equivalente.  [...]

[Biochimie] Etude des partenaires protéiques : Co-Immunoprécipitation, Tap-Tag et double hybride

Et je me posais la question de savoir quel type d'anticorps fallait-il utiliser pour la Co-Ip Un anticorps poly ou monoclonal Si j'utilise un anticorps polyclonal, il risque de se fixer un peu partout sur ma protéine et je risque d'empêcher les interactions.  [...] tap-tag. c'est de l'in vivo aussi, y a pas le problème des anticorps comme l'IP, et c'est bien pur grâce à l'utilisation de deux colonnes justement, mais après c'est fait avec une protéine de fusion donc ça peut aussi changer l'interaction.  [...]

[Biochimie] Qu'est ce qu'un pull down?

Voilà je voudrais savoir ce qu'est un pull down en biochimie quand on parle d'interaction Proteines/Liagand.  [...] c'es une méthode qui permet d'étudier les intéractions protéine/protéine (éventuellement protéine/ligand). Le but est d' attrapper les molécules qui intéragissent avec ta protéine que tu immobilise en utilisant un anticorps ou un tag.  [...]

[Biochimie] Compréhension cours - Interactions Protéines-Ligands

[Biochimie] Compréhension cours - Interactions Protéines-Ligands.  [...] Concernant Hill, il me semble que c'est une régression linéaire. On l'utilise pour la coopérativité des ligations (par exemple en fonction des gaz se liant à l'hémoglobine).   [...]

[Biochimie] L'agitation thermique au coeur de la cellule

D'après moi ça favorise donc les interactions entre les protéines. Il y aura donc plus d'interactions entre les protéines au cours du temps, et leur déplacement se verra lui aussi augmenté. En plus l'agitation thermique n'a rien à voir avec la diffusion.  [...] Néanmoins, certes en augmentant la concentration des protéines, tu augmentes bien évidemment les probabilités de rencontres enzyme-substrat... mais tu favorises aussi les interactions non désirées, favorisant agrégation et mauvais repliement.  [...]

Définition | Protéine chaperon - Chaperon moléculaire | Futura Santé

Les protéines chaperons, ou chaperons moléculaires, aident au repliement moléculaire correct d'autres protéines, ce qui permet d'éviter la formation d' agrégats protéiques. Ces agrégats, dus à des interactions hydrophobes, peuvent être accentués par le stress.  [...] Les protéines chaperons sont aussi les protéines de choc thermique qui protègent les cellules de l'effet d'un stress, d'où le nom de Hsp qui leur est donné en anglais ( heat shock protein ). De manière générale, ces protéines sont produites dans des conditions stressantes, comme en cas de chaleur, et elles évitent des interactions indésirables entre protéines.  [...]