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cristal de protéines

une autre chose. on met le plus de protéines possible pour former un cristal mais aprés sur le pattern ou il yaura le résultat (les taches) on ne verra que les taches pour une protéine du cristal ou pour toute les protéines du cristal ou bien le rayon interagit avec toute les protéines mais sur le résultat on verra le resultat pour une.  [...] dans le cristal il y a plusieurs protéines, comment cela se fait que sur le pattern il n'y ai les points que pour une protéine ( la méme qui rempli le cristal).  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

Dans ce cas, la résolution dépend essentiellement de la qualité des cristaux de protéines obtenus. Un excellent cristal pourra diffracter à 1,5 voire 1 angstrom alors qu'un cristal de mauvaise qualité atteindra péniblement 4, voire 10 angstroms ou pire ne diffractera pas du tout.  [...] n'importe qui est capable de produire des cristaux de lysozyme (une enzyme cristallisant très efficacement) diffractant à 1,5 angströms ou mieux, par contre personne ne sait faire la même chose avec la protéine gp160 du HIV (une protéine particulièrement récalcitrante à la cristallisation).  [...]

[Biochimie] PDB et Cristallographie

Tout d'abord, j'ai remarqué que les structures de protéines (dans Protein Data Bank) déterminées par cristallographie n'ont pas d'atome d'hydrogène. Pourquoi Je trouve partout les hydrogènes ne sont pas visible en cristallo mais personne n'explique pourquoi.  [...] Il peut y avoir des zones dans la structure des protéines qui sont très dynamiques. Cela peut engendrer la formation d'un cristal de plusieurs conformères. La base de la résolution cristallographique étant la répétitivité de la même structure, s'il y a des variations à un endroit, la résolution sera donc impossible pour cette zone.  [...]

Définition spirituelle | Dossier

A ce stade du discours on découvre que la vie ne peut plus se définir à partir des mêmes principes. Il est même probable que notre recherche d'une définition précise est utopique, chaque stade de l'évolution définissant ses propres règles, la vie apparaissant en fait graduellement dans des systèmes de plus en plus évolués.   [...] Le cailloux est inerte, le cristal grandit et se définit par sa pureté, les argiles ont des capacités de mémorisation et de chaînage, les protéines assurent le travail de la cellule, les virus ont des capacités de reproduction, les protozoaires sont autonomes et les métazoaires sont organisés.  [...]

Cristallisation des proteines

Voilà je suis en première année de licence de bio, et les profs évoquent souvent la cristallisation des protéïnes, mais je ne sais pas trop ce que c'est.  [...] Si on est chanceux et doue, il va se former dans certains cas des petits cristaux de proteines (Typiquement, voila ce qui est observe sous le microscope. http.//www.google.fr/searchhl=fr&q=...w=1525&bih=754 ). Cela correspond a un arrangement regulier des proteines a l'interieur du cristal.  [...]

Le bisphénol A bientôt remplacé par des plastiques inoffensifs ?

Pour savoir comment les bisphénols se fixent au récepteur des oestrogènes, ils ont ensuite caractérisé au niveau atomique l'interaction par cristallographie aux rayons X. Cette technique, qui a recours à des instruments de pointe tels que le synchrotron ESRF de Grenoble, consiste à obtenir un cristal de protéines (ici d'1/10 e de mm) à partir des composés à analyser et de l'éclairer par un faisceau de rayons X afin d'en déterminer sa structure atomique.  [...] Contrairement aux modèles théoriques conçus à partir de l' analogie avec la structure du récepteur en présence de l'estradiol, le résultat issu de l'analyse cristallographique a permis de visualiser en 3D les structures réelles, très précises, du mode de liaison bisphénol-récepteur.  [...]

Les nanocristaux appliqués à l'étude du vivant

Outre sa petite taille, un autre avantage du nanocristal est que, dû à sa nature cristalline, il peut être visualisé par microscopie électronique. Ainsi, une même cellule peut être observée en temps réel puis, la localisation fine de la protéine observée, déterminée par microscopie électronique.  [...] Cet inconvénient peut être contourné par les nanocristaux. Leur spectre d'émission est symétrique, relativement étroit et directement dépendant de la taille du cristal. Cela permet d'envisager l'observation de multiples protéines en utilisant des nanocristaux de longueur d'onde définie et bien séparée.  [...]

[Biochimie] Phasage

Le phasage est une étape limitante car il faut créer un cristal de protéine qui contient des atomes lourds (cuivre plomb). Créer un cristal de prot peut être compliquer suivant les protéine en question alors en y intégrant des atomes volumineux la tache en est d'autant plus complexe.  [...] Remplacement isomorphe. On va jouer sur la différence de diffusion entre un cristal de notre protéine seule et un cristal de protéine contenant un atome lourd (riche en électrons car les RX interagissent avec les électrons). Cette atome lourd ne doit pas modifier le cristal (paramètres de maille, groupe espace, repliement de la protéine.  [...]

[Biochimie] Expérience sur les processus d'apparition de la vie.

Et, à ma connaissance, le processus dont résulte le développement des cristaux, ne présente pas de caractère sélectif. À paramètres environnementaux stables, chaque nouveau petit bout de cristal est structurellement identique au reste du cristal.  [...] Ce qui me semble en revanche évident en lisant superficiellement la discussion, c'est que l'on peut se demander de quoi l'on parle. J'entends par là, que quelqu'un d'un peu cultivé en biologie pourrait être tenté de répondre un peu facilement que la vie c'est les cellules et que les cellules c'est une information codée sur l'ADN qui est transcrite en protéines dont la fonction est adaptée par les processus d'évolution.  [...]

Une nouvelle protéine fluorescente 3 fois plus brillante que les autres

Cristal de CFP utilisé dans l'étude (échelle. 100 microns) et zoom sur la partie de la protéine proche du chromophore montrant l'amélioration de stabilisation dans mTurquoise2 qui explique sa meilleure efficacité de fluorescence. D. von Stetten, A. Royant & Nature Communications.  [...] Le résultat de cette conception rationnelle est une nouvelle CFP, appelée mTurquoise2. En combinant leurs efforts de biologie structurale et cellulaire, les chercheurs ont pu montrer que mTurquoise2 avait un niveau de fluorescence de 93 %, jamais atteint jusqu'ici pour ce type de protéine.  [...]