• Santé - Protéine, Sillon, ADN

[Divers] [biologie du developpement] développement des membres

Mais la grosse originalité est qu'une hélice de cette protéine s'enfonce dans le petit sillon qu'elle élargit sans pour autant dénaturer l'ADN. Elle y établit des interactions hydrophobes mais surtout entre en contact avec une guanine via un carbone de sa chaine principale (le squelette peptidique de la protéine.  [...] Le mode de fixation est original en plusieurs aspects. Le premier est qu'il intéresse le grand et le petit sillon de l'ADN. Mais la grosse originalité est qu'une hélice de cette protéine s'enfonce dans le petit sillon qu'elle élargit sans pour autant dénaturer l'ADN.  [...]

[Génétique] Programme génétique et cellules

Les protéines possèdent des domaines d'action qui peuvent se lier à l'ADN par divers procédés de complémentarité, divers motifs. une protéine peut par exemple s'insérer dans un sillon de la double hélice et agir ainsi sur l'ADN.  [...] Beh là... Autrement dit. est-ce que c'est la forme en double hélice avec petit et grand sillon qui est apparue en première et les domaines DNA-Binding des protéines s'y sont adaptés ou est-ce que ces domaines sont apparus en premier et l'ADN s'y est adapté.  [...]

petit sillon

Le petit sillon, par rapport au grand sillon, a une configuration spatiale très étroite. Et dans le grand sillon, les atomes nucléophiles des bases puriques sont très bien exposées vers l'extérieur. Ceci facilite la liaison (liaisons hydrogène) à d'autres protéines, donc à des enzymes.  [...] merci. Je me demandais aussi puisque les enzymes de réparation effectuent leur travail après que tout l'ADN ait été répliqué, si elles devaient enlever un nucléotide incorrect qui se trouve dans le petit sillon. comment font elles puisque de l'extérieur elles n'ont pas accès aux plateaux de bases.  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

Au risque de paraitre insistant, mais pour qu'une protéine se replie exactement sous une forme fonctionnelle spontanément ex vivo, c'est plutôt rare. C'est la raison pour laquelle pour toutes les protéines recombinantes avec lesquelles j'ai pu travailler, nous redoublons de précaution quant à la période durant laquelle elle ne sont plus soumises au froid.  [...] Comme il le précise en théorie rien n'est définitif. Pour ce qui est de la capacité d'un facteur à lier l'ADN, nous sommes dans un cas particulier. En effet, les protéines lient l'ADN grâce à des motifs en doigt de zinc. Ce sont des régions riches en cystéine qui, par regroupement de 4 cystéine ou 2 cystéines/2 histidines stabilisées par un ion Zn2+ permettent la formation d'une structure en boucle qui peut interagir avec le sillon majeur de l'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] structure secondaire de l'adn

La forme B de l'ADN est la forme physiologique. On peut observer la formation d'un petit et d'un grand sillon dû au fait que les liaisons N-glycosiliques ne sont pas diametralement opposée au sein d'une paire de base ce qui cré un espace plus grand (grand sillon) et plus petit (petit sillon).  [...] Les protéines devant intéragir avec l'ADN se dirigent principalement vers les grands sillons (mais peuvent aussi atteindre les petits) et créent des liaisons hydrogènes à partir des groupements donneurs et receveurs de liaison H sur les bases.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les gènes Hox

Les protéines pour lesquelles ils codent appartiennent à une famille dont tous les membres ont en commun un domaine conservé, l'homéodomaine. Cet homéodomaine est formé d'environs 60 acides aminés formant 4 hélices (3 hélices alpha + une autre hélice). Ce sont les hélices 2 et 3 qui se fixent dans le grand sillon de l'ADN au niveau d'une séquence consensus spécifique à chacune des différentes sous-familles d'homéogènes.  [...] Oui mais un enhancer agit souvent en se repliant pour que la protéine s'y fixant interagisse avec les protéines au niveau du promoteur et ainsi co-active l'initiation de la transcription. Il y a sans doute d'autres mécanismes et peut-être même des enhancers recrutant des HAT, mais bon, la logique reste 5'-.  [...]

[Biologie Cellulaire] Duplication de l'ADN en phase S

* ADN-Z. son action et son rôle sont inconnus. C'est une hélice gauche. Il est caractérisé par des plateaux peu inclinés (9° à peu près), et une position alternative des sucres en radiale et tangentielle (ainsi qu'une alternance 3'endo syn/5'endo anti). L'axe passe par le petit sillon et présente 12 paires de bases par tour soit 30° entre chaque sucre.  [...] - Certaines protéines se lient à l' ADN-Z, en particulier l' ARN double brins adénosine desaminase (ADAR1), une enzyme qui convertit l' adénine en inosine dans l' ARN pré-messager. Les ribosomes interpréteront alors l' inosine en guanine, et la protéine codée à partir de cette modification épigénétique) sera différente. on.  [...]

Mort de Francis Crick, co-découvreur de la structure de l'ADN

Leurs travaux décrivent aussi comment les quatre bases constitutives de l'ADN (A, T, C, G) s'assemblent entre elles pour former les barreaux de la double hélice d'ADN. Avec l'apparition des techniques de biologie moléculaire, nous avons par la suite réalisé que cette structure en double hélice présentait aussi une caractéristique fonctionnelle essentielle pour l'activité de l'ADN, qui est la création de sillons de tailles différentes (un grand sillon, et un petit sillon).  [...] F. Crick, J. Watson et M. Wilkins reçoivent en 1962 le prix Nobel de médecine pour leurs travaux sur la structure de l'ADN. Francis Crick était depuis président émérite et professeur d'études biologiques à l'Institut Salk de San Diego.  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaison spécifique d'un protéine à l'ADN

Je me posais une simple question. Comment une protéine (facteur de transcription en général) peut-elle se fixer spécifiquement à une séquence d'ADN.  [...] C'est une histoire de configuration spatial de la proteine (structure quaternaire) et de la disposition dans l'espace de la séquence d'ADN qui est n'est pas linéaire ainsi la tata box qui est en amont est pourtant proche spacialement parlent du site d'initiation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Adn...

- J'ai rencontré les appellations ‘ sillons majeurs et sillons mineurs ' pour les brins d'ADN mais je n'ai pas compris ce qu'elles signifiaient et je ne trouve pas l'info sur internet….  [...] la double hélice d'ADN n'est pas aussi régulière dans ses spirales qu'un macaroni, elle alterne régulièrement un grand sillon et un petit sillon. Dit autrement, elle fait une torsion, tout de suite apres une autre torsion (c'est le petit sillon), un peu plus loin elle refait une torsion (c'est le grand sillon), puis elle recommance, tout de suite apres petite torsion, puis un peu plus loin, puis tout de suite apres,  [...]