• Santé - Protéine, Forme, Stable

[Biochimie] Etat natif d'une protéine?

Dans mon cours de biochimie, l'état natif d'une protéine est défini comme la conformation d'une protéine correspondant au minimum énergétique possible pour cette conformation.  [...] Plus une molécule a un niveau énergétique faible, plus elle est stable. On considère en effet que la meilleure conformation d'une protéine, donc sa conformation native, est la forme la plus stable. Je ne sais pas si c'est une règle applicable à toutes les protéines mais on raisonne souvent ainsi.  [...]

Prion : contamination des sols limitée lors de l'enfouissement des carcasses

La forme pathogène de la protéine du prion (forme bêta), considérée comme responsable des encéphalopathies spongiformes transmissibles, n'est pas aussi stable qu'on le pensait. Elle peut être dégradée par des enzymes microbiennes du sol dont la production est stimulée par l'enfouissement des carcasses animales dans le sol.  [...] Lorsque l'on enfouit des carcasses d'animaux malades dans le sol, contamine-t-on l'environnement avec la forme pathogène du prion Celui-ci persiste-t-il, se transmet-il et se dégrade-t-il dans l'environnement Jusqu'à présent, cette forme bêta était considérée comme difficilement dégradable, car les chercheurs n'avaient découvert que très peu d' espèces microbiennes capables de synthétiser des protéases actives contre cette protéine in vitro.  [...]

[Biochimie] Malachite Green Phosphate Assay kit, avez vous déjà utilisé ce kit?

Je travaille sur une protéine qui hydrolyse le phosphate, il s'agit d'une actine like... je dois trouver une méthode pour doser le phosphate au cours du temps... mon plus gros souci c'est que ma protéine polymérise en un cart de tour est pour arriver à la purifier sous forme stable (mais pas longtemps.  [...] donc au final je me retrouve avec une protéine qui contient déjà du phosphate, ce qui veut dire le test de dosage de phosphate va etre fausser à cause de la présence de l'ADP.  [...]

Parkinson : un composé du safran bloque la maladie in vitro

On ne connaît pas encore très bien la fonction de l'alpha-synucléine (représentée ici dans une forme tridimensionnelle) chez un individu sain. En revanche, une mutation sur le gène qui la produit risque de favoriser un repliement plus rapide et d'augmenter sa tendance à s'agglutiner avec d'autres protéines. www.pdb.org Wikipédia, DP.  [...] S'il est assez facile de connaître la suite d' acides aminés qui composent une protéine, comprendre la façon dont ils s'agencent entre eux pour donner une forme globale et tridimensionnelle à la molécule est une autre performance. D'autant plus que l'on a cru durant longtemps que l'alpha-synucléine était une protéine intrinsèquement désordonnée, c'est-à-dire sans structure 3D stable.  [...]

ADN ARNm

Chez l'homme le gène codant pour cette PrP est situé sur le chromosome 20. Ce gène possède deux exon mais seul le second est codant ce qui explique que l'apparition de la forme pathogène ne soit pas due à un epissage alternatif. La masse de la protéine est de l'ordre de la 30ène de Kd et tout le problème vient du fait qu'elle peut adopter deux conformations.  [...] La conformation normale qui possède un turnover rapide et la forme pathologique qui elle est extrêmement stable (même des traitements drastiques, incompatibles avec la vie, en viennent difficilement à bout, ceci explique que cette protéine ne soit pas dégradée dans l'estomac puis les intestins).  [...]

[Biochimie] Amylase et amidon

L'amylase est une protéine, une chaine d'acide aminés repliés les uns sur les autres dans une conformation très particulière. En chauffant la protéine on va l'amener à se déplier (pour une question d'entropie, d'énergie tout ça, c'est un peu long à décrire) et hors de sa configuration habituelle, elle n'est plus capable d'exercer sa fonction.  [...] Voilà, donc comme je l'ai expliqué, la chaleur déplie la protéine, le froid la condense encore plus. Sous forme condensée, elle est inactive mais beaucoup plus stable. Une fois revenue à une température normale elle se décondense et retrouve son activité sans problème.  [...]

[Biologie Cellulaire] Duplication / transcription

Dans le noyau, on a bien un nucléole forme de l'heterochromatine qui est dynamique mais non transcriptible, et autour du nucleole. de l'eurochromatine qui est activement transcriptible. Maintenant, j'ai lu, qu'en ce qui concerne les ARNr, seul le 5S était transcrit hors du nucleole.  [...] L'ARN existe aussi pour protéger l'ADN. Les transcriptions arrivent fréquemment, ce qui obligerait à laisser l'ADN sous forme sb la majorité du temps. Grâce à l'ARN, l'ADN est moins longtemps sous sa forme non stable. Car il y a aussi de l'ARN chez les Procaryotes sans noyau.  [...]

[Génétique] Toxines bactériennes

Ce système est très intéressant, en fait. Le phage P1 peut infecter les E. coli sous forme de plasmide. il porte deux gènes produisant les protéines PhD et Doc (j'aime bien les noms ). Ces deux gènes s'appellent addiction modules. PhD est l'antidote (de très courte durée de vie) de Doc (la toxine stable).  [...] Idem pour les E. coli vs. d'autres entérobactéries avec le complexe colicine/Imm (la première est la toxine, la seconde est la protéine Imm qui assure l'immunité d' E. coli vers sa propre toxine). Imm est larguée quand la colicine s'attache aux récepteurs de la cellule cible.  [...]

Conditions nécessaires a l'apparition de la vie ? - Page 2

Les êtres vivants requièrent probablement un solvant sous forme liquide, ceci parce que les macromolécules doivent être non seulement stables, mais cependant capable d'une flexibilité dans leur structure ainsi que de présenté une réactivité chimique. Toutes ces caractéristiques sont favorisée par un solvant en phase liquide.  [...] Dans le détail, il s'agirait d'une forme de vie équipée d'une coque en cyclo-S8 (une variété allotropique très stable du soufre et qui ne réagit pas avec l'acide sulfurique) pour se protéger à la fois de l'acide mais aussi du rayonnement UV intense. En outre, elle pourrait soit être phototrophique, soit se nourrir de soufre moléculaire.  [...]

des renseignements sur la vache folle?

Le prion a une conformation très stable, qui l'empeche de jouer son role de proteine normale, et en plus va ( je ne sais plus par quel mécanisme...) conduire à la mort du neurone.  [...] Juste pour compléter. quand la protéine est sous forme prion, elle va former des aggrégats avec ses semblables. Ces aggrégats vont à leur tour former des fibres amyloïdes.  [...]