• Santé - Protéine, Eau, Molécules

[Biochimie] Précipitation des protéines

Il me semble que les protéines du blanc d'oeuf ont un zwiterrion proche du pH4 donc quand tu rajoute ton NaOH (pH13 à concentration élevé 1 M ) et bien tu vas t'éloigner de ta zone de zwiterrion et ta protéine du fait de son nombre de charge ionique à sa surface, va se solubiliser avec l'eau.-D.  [...] Au zwitterion, tu as autant de charge positive et négative, ce qui va engendrer des répulsions et attirance des molécules d'eau, ils ne vont pas pouvoir correctement se lier avec ta protéine, donc par l'absence d'eau lier par liaison hydrogène, ta protéine ne peut que précipiter puisqu'elle se retrouve insoluble dans l'eau =D.  [...]

Une protéine surprise à son réveil : c'est une première !

De nombreux médicaments ciblent des protéines. Comprendre la dynamique d'une protéine et la façon dont elle se lie à ses partenaires est donc essentiel pour développer de nouvelles molécules thérapeutiques efficaces. Or, la complexité de la vie de beaucoup de protéines, et notamment leur plasticité, avec une structure toujours changeante et dépendante des paramètres extérieurs (partenaires, température, etc.  [...] Afin de mimer l'environnement de la protéine dans le cytoplasme de la cellule, les chercheurs ont analysé la protéine entourée de molécules d'eau. Lors de la montée en température, ces dernières ont été les premières à s'animer, à -113 °C. Les chaînes latérales de la protéine sont ensuite sorties de leur léthargie, suivies par son squelette, à -53 °C, température à laquelle la protéine est devenue active.  [...]

[Biologie Moléculaire] extraction d'ARN

Bonjour, cette discussion date donc j'espère que quelqu'un lira quand même. J'utilise la méthode au trizol pour extraire mon ADN de cellules lymphocytaires, et je cherche à comprendre exactement de quel manière se déplace l'ADN, l'ARN et les prot à chaque ajout, mais surtout pourquoi (principalement concernant l'ADN et l'ARN puisque ce sont des molécules similaires).  [...] Le phénol sépare les molécules organiques (donc les protéines) des acides nucléiques. Les molécules hydrophiles se retrouverons dans la phase aqueuse (l'eau) les protéine insoluble seront à l'interphase phneol/eau et le reste dans le phénol.  [...]

Définition Aggrécane.

Quelle est la définition de Aggrécane Il me semble qu'il pourrait s'agit d'une glycoaminoglycane ce qui me semble plausible car il parrait que c'est composé de chondroïtine sulfate et de kératane sulfate.   [...] Tu n'as entièrement tort en pensant que l'aggrécane est un GAG mais ce n'est pas totalement vrai. En réalité, c'est un protéoglycane ce qui signifie qu'il est composé à la fois d'un GAG et d'une protéine. Les GAG formant ce protéoglycane sont en effet très sulfaté ce qui permet une rétention d'eau, cette dernière étant accrue lorsque les molécules d'aggrécan s'assemblent aux molécules d'acide hyaluronique formant ainsi ce que l'on appelle des aggrégat de protéoglycanes.  [...]

Question bete hydrophile hydrophobe

les acides aminés hydrophobes sont nécessaires pour que la protéine puisse être insérée dans la membrane plasmique de la cellule. Des acides aminés hydrophiles sont également nécessaires pour former le pore du canal lui même qui laissera passer l'eau et les molécules hydrophiles.  [...] Cette protéine contient donc obligatoirement à la fois des acides aminés hydrophobes, au contact de la membrane lipidique et des acides aminé hydrophile vers l'intérieur.  [...]

[Biochimie] Definitions et propriétés

Ensuite j'aimerais que vous me confirmiez ou infirmiez une explication. Dans le cas de la propriété d'insolubilité des protéines en solution saline, j'ai marqué sur mon cours, plus on ajoute de sel moins la protéine aura d'affinité pour l'eau qui l'entoure donc si j'ai bien compris lorsque l'on ajoute du sel celui ci se lie préferentiellement à l'eau qui n'a plus de quoi faire des interactions avec les protéines qui deviennent insolubles c bien ca.  [...] En effet le phénomène que tu décris s'appelle le salting out. Toutes molécules nécessite (en solution aqueuse) des molécules d'eau pour leur solvatation. Lorsqu'on augmente fortement la concentration en sels, les ions vont s'accaparer les molécules d'eau et donc les protéines n'auront plus assez de molécules d'eau pour être sous forme soluble.  [...]

[Biochimie] Plusieurs questions sur les chromatographies échangeuses d'ions et d'affinité

En milieu aqueux (eau), les molécules de NaCl vont être dissociées et données des ions Na+ et Cl-. Donc dans le cas par exemple d'une chromatographie d'échange les ions Cl- vont rentrer en compétition avec la protéine chargée -.  [...] Je sais trop qu'est ce que tu veux dire ici... Généralement pour ce type de chromatographie (surtout les IMAC) la concentration en NaCl des différents tampons est relativement élevée ([NaCl]. 300 mmol/l). Cela permet d'augmenter la specifité, c'est a dire que seules les molécules (protéines généralement) ayant une forte affinité avec la colonne se fixeront sur cette dernière.  [...]

syndrome nephrotique

La cause. des trous qui laissent passer les protéines dans le glomérule rénal. Normalement c'est une membrane filtrante très sélective, elle ne laisse passer que ce qui est plus petit que la molécule d'albumine, donc quasiment aucune protéine, mais que l'eau et les sels minéraux, et les petites molécules organiques.  [...] - Dans le syndrome néphrotique, il y a également la fuite d'autres protéines avec des conséquences fâcheuses. immunoglobulines (donc infections), protéines C et S (d'où tendance à des thromboses veineuses), molécules porteuses d'hormones et de vitamines (donc carences).  [...]

[Biochimie] Enzyme INA dans la neige artificielle

Je suis tombé sur une étude du CEMAGREF de Grenoble sur ce produit ( http.//www.cemagref.fr/Informations/...2recherche.htm ), il y est dit que ce produit fonctionne grace à une enzyme (Ice Nucleating Activity) au pouvoir cryogène créee par une bactérie. Cette enzyme permet d'orienter les molécules d'eau afin de favoriser leur cristallisation.  [...] Son secret résiderait dans sa structure. celle-ci, en imitant la forme du cristal formé par les molécules d'eau, servirait de modèle pour initier la cristallisation. Mais pourquoi cette bactérie possède-t-elle une telle protéine et à quoi lui sert-elle exactement Est-ce une forme de protection En réalité cela demeure un mystère, car on ne voit pas bien en quoi le fait de se congeler pourrait permettre à un organisme de se protéger.  [...]

Discussion | Dossier

Dans cet objectif, notre étude est de mettre au point un modèle utilisant la flambée respiratoire chez les granulocytes neutrophiles et permettant de tester des molécules potentiellement inhibitrices de la protéine kinase C. Pour y parvenir, nous avons regardé la réponse de la PKC et son action face à une molécule, le chlorure de chélérythrine, qui est capable de l'inhiber de façon sélective.  [...] Sa CI50 pour la PKC est de 1,8 µM, pour la protéine kinase A de 1,6 µM et pour la phosphorylase kinase de 6,5 µM (Bradshaw D. et al., 1993). Ceci peut être expliqué par le mode d'action de ces différents composés. leurs sites de fixation se situent au niveau de la protéine qui sert à la reconnaissance de l'ATP nécessaire à la phosphorylation du substrat, or ce site est hautement conservé entre les différentes kinases, entraînant une grande difficulté à obtenir des molécules sélectives pour l'une ou l'autre d'entre elles en utilisant cette partie de l'enzyme comme cible (Johnson L.N. et al., 1996).  [...]