• Santé - Protéine, Compartiment, Activité, Biologique

[Biologie Moléculaire] Peptide signal

Je souhaite cloner dans pGEMTeasy puis dans pET21 un gène qui renferme 7 exons le premier exon code pour le peptide signal, j'ai commander deux types d'amorces sens le premier s'hybride avec l'exon 1 (peptide signal) et le deuxième avec l'exon 2. j'ai commencer mes PCR avec le second type mais je ne sais pas exactement quels sont les conséquences et et ce que ça va influencer sur la conformation protéique ou l'activité biologique.  [...] Oui le peptide signal permet l'adressage de la protéine vers un compartiment cellulaire bien défini mais le fait qu'elle ne soit pas orienter vers un tel compartiment elle peut perdre dans un autre sa conformation ou son activité biologique bon c'est ce que je pense.  [...]

Trafic cellulaire

Pour faire simple et vite, le trafic vesiculaire est sous le controle de petite GTPase de la famille Rab. Ce sont des proteines qui aissent comme des commutateurs moleculaires, inactifs quand ils sont lies au GDP et actifs (capable de lier leurs effecteurs) quand ils sont lies au GTP.  [...] Les GEF permettent l'echange du GDP en GTP et les GAP accelerent l'activite GTPase de la proteine Rab. Les v-Snare et t-Snare sont des molecules qui permettent la fusion des vesicules emanant d'un compartiment donneur et se dirigeant vers un compartiment accepteur.  [...]

[Biochimie] Isolement des protéines du périplasme de Bactéries + Test d'activité spé d'une protéine en SDS-PAGE

Alors ce que je ne comprend pas c'est comment à partir d'une choc hypo-osmotique on peut isoler uniquement le périplasme dans les sphéroplaste qui sont sensés se former. Car il montrent par la suite que dans leur préparation de périplasme il n'y a aucune contamination du cytoplasme En gros comment ce choc hypo-osmotique ou le traitement au lysozymes peuvent t ils permettre d'isoler ce tout petit espace intermembranaire sans contamination du milieu de culture ou du cytoplasme.   [...] Ce que je comprend pas c'est le lien entre activité spécifique et électrophorèse. L'électrophorèse en sds-page permet de séparer les protéines selon leur taille et donc d'identifier des protéines dans des extrait donnés, mais quel rapport avec l'activité spécifique de la protéine serait-ce simplement le fait que comme ils on des préparation périplasmique pure de contamination et qu'il test la présence de la protéine SodA dans ce compartiment qu'ils appellent ça activité spécifique du périplasme.  [...]

Des greffes d'organes plus efficaces

Afin d'améliorer la tolérance des traitements et l'efficacité des greffes, des chercheurs américains ont criblé une banque de composés chimiques avec l'idée de trouver un inhibiteur efficace d'une protéine, JAK-3, dont la fonction est centrale à la biologie des lymphocytes (cellules responsables de la réponse immunitaire) et limitée à ce compartiment cellulaire.  [...] Ils ont identifié un composé, au nom de CP690,550 qui inhibe à très faible dose JAK-3. La spécificité de ce composé a été testée au travers d'une trentaine d'autres protéines ayant des fonctions physiologiques centrales et seules les protéines de la même famille sont inhibées efficacement (JAK-1, 2 et 3).  [...]

[Biologie Cellulaire] Synthèse des protéines

Pour que ces proteines puissent ensuite rejoindre leur compartiment, un peptide signal est generalement synthetise en amont (partie N-terminale de la proteine) afin d'identifier le compartiment de destination de la proteine. Il existe ainsi un peptide signal specifique pour l'adressage vers la mitochondrie, le peroxysome, le noyau, le reticulum, etc.  [...] J'ai compris, merci beaucoup. Donc toutes les protéines qui ne sont pas cytosoliques possèdent un peptide signal, différent selon le compartiment d'adressage. Est ce qu'ainsi, toutes les protéines qui seront adressées vers un organite sont en partie traduite dans le cytosol, et en partie sur la membrane et dans la lumière de leur organite Ou sont elles totalement traduite dans le cytosol, et ensuite adressées aux organites.  [...]

[débat] Point de vue des biologistes : la vie, une structure dissipative ?

Le temps l'établissement d'un régime stationnaire (en fait périodique de par la rotation et la révolution de la Terre) est assez apparent pour le système climatologique principal. Mais on peut penser qu'il est infini pour le compartiment biologique. En tout cas, on constate que le compartiment biologique a profondément changé au cours des millions d'années.  [...] (Et l'humanité, qu'on doit inclure avec ses éléments artificiels si ce n'est dans la vie mais au moins dans un système incluant aussi le biologique, ne fait que compliquer le sujet.).  [...]

[Biologie Cellulaire] Protocole expérimental

Vous avez donc trois extraits qui constituent chacun un compartiment de distribution des protéines. Votre question est, dans quel compartiment se trouve ma protéine d'intérêt Pour cela vous faites un western.  [...] Perdu parce que les détergents vont vous embêter ensuite. Sauf si vous voulez les protéines membranaires c'est inutile. Il y a une méthode plus simple, que l'on voit en première année de biologie. Un truc tout bête qui fait exploser les cellules.  [...]

[Biologie Cellulaire] Peptide signal

Mais ensuite au cours de sa vie, une protéine peut changer de localisation, typiquement les facteurs de transcription et ceci indépendamment de ce peptide signal de départ qui, si je ne me trompe pas, est souvent clivé lors de la maturation des protéines.  [...] Mais dans le cas d'une protéine résidente du REG par exemple, si le peptide signal est clivé lors de la maturation, comment peut-elle arrivée au compartiment adressé Ce que tu dis la n'est pas, seulement, valable pour les protéines de types hormones telles que l'insuline Car dans le cas de cette hormone, il y a bien clivage des peptides signal lors de la maturation mais dans le cas que j'ai cité ce n'est pas possible, si.  [...]

[Biologie Cellulaire] Endosomes de recyclage

La dynamique des membranes, et de ce fait des vésicules, et toujours un peu abstrait à comprendre au départ. Les compartiments sont en constante évolution, au gré des courants membranaires et pourtant conservent leur identité. C'est un peu comme si le train (vésicule +protéine motrice) arrivant en gare (compartiment accepteur) grâce aux rails, devenait lui même une partie de la gare.  [...] Quant au signal...si c'est une protéine membranaire constitutive, le flux entre membrane plasmique et compartiment intracellulaire est continu et en équilibre. Si c'est une protéine d'une voie régulée, alors la vésicule contenant les récepteurs recyclés sont en attentes d'un signal.  [...]

[Biologie Cellulaire] ultracentrifugation et cellules!

je voudrais réaliser des ultracentrifugations différentielles afin de déterminer la localisation d'une protéine spécifique qui m'intéresse. mais au lieu de le faire sur tissu, j'aimerais le faire à partir de culture de HEK. Auriez vous une idée du nombre de cellules dont j'ai besoin pour avoir au final une quantité de proteine suffisante pour faire des western.  [...] Tout dépend du compartiment cellulaire que tu veux isoler, de la représentation de ta protéine dans ce compartiment...Donc c'est par l'expérience que tu sauras quelle quantité de cellule te permet d'avoir une bande convenable en western. Pour commencer tu peux essayer plusieurs conditions où tu auras mis un nombre croissant de cellules.  [...]