• Santé - Promoteurs, Séquence, Consensus, Intérêt

[Génétique] Comment identifier les promoteurs contenant une sequence consensus d'intéret

[Génétique] Comment identifier les promoteurs contenant une sequence consensus d'intéret.  [...] Comment identifier les promoteurs contenant une sequence consensus d'intéret.  [...]

Analyse chez Arabidopsis thaliana | Dossier

La suite de programme RSA tools aboutit à la définition d'une séquence consensus sur l'ensemble des promoteurs considérés. Classé par ordre d'occurrences significatives pour Oligo-analysis, la plus élevée, 4,1, se retrouve dans toutes les séquences et correspond à TGCAGC GCAGC TTGAC TGACG.  [...] Parmi cette famille deux protéines du système de résistance acquise forment le dimère NPR1/NIM1. Ce dernier a la propriété d' activer la transcription du gène PR1 via la séquence TGCAG (Després et al., 2000). Par conséquent le consensus déterminé pour ces promoteurs d' Arabidopsis thaliana pourrait correspondre à celui reconnu par le facteur de transcription NPR1/NIM1.  [...]

Recherche du consensus dans le génome complet d'A. thaliana | Dossier

Connaissant maintenant la séquence consensus probable des promoteurs des gènes de la RSA, DNA-pattern search peut faire la démarche inverse qui consiste à rechercher les promoteurs qui ont plus d'une occurrence de cette boîte et qui sont présents dans le génome complet d'A. thaliana.  [...] Le résultat de l'analyse montre l'existence de cette boîte consensus dans de nombreux promoteurs (fi-gure 6). Or la grande majorité correspond à des gènes codant des protéines inconnues ou des fac-teurs de transcription (tableau 6).  [...]

Mutation?!

Ce que je ne pige pas c'est la chose suivante. comment peux-tu affirmer d'un côté que c'est une séquence consensus et d'un autre dire que ça ne supporte aucun changement Cela signifierait que pour les promoteurs possédant TATAAA par exemple alors que la séquence consensus est TATAAT, on parlerait obligatoirement de mutation.  [...] Eh ben, effectivement, je croyais qu'une séquence consensus, était la même séquence partout, or ce n'est pas le cas d'après ce que m'as dit, donc il y a un polymorphisme si on veut d'un promoteur a un autre.  [...]

Recherche et analyse des promoteurs des gènes de la Réponse Systémique Acquise | Dossier

La connaissance du génome complet d'Ara-bidopsis thaliana permet de connaître les séquences promotrices exactes des gènes RSA connus dans la littérature scientifique. Les programmes RSA-tools et Motif Sampler ont déterminé par ana-lyses informatiques depuis ces séquences un consensus d'activation.  [...] Le consensus déterminé, il fut possible de rechercher cette séquence précise dans l'ensemble des promoteurs du génome d'A. thaliana et ainsi d'obtenir la liste des gènes pouvant potentiellement appartenir à la RSA notamment ceux dont la fonction est inconnue.  [...]

[Génétique] analyse génique

je suis actuellement étudiant en thèse et je travail sur un cluster génique bactérien. J'ai déjà une bonne partie de la séquence avec les ORF et les protéines putatives. Cependant j'aimerai avoir une prédiction de la localisation des terminateur, stem loop, promoteurs.  [...] - A propos des promoteurs bactériens, on peut presque le faire manuellement (tu cherches les bases les plus conservées des consensus et ils sont en général situés à moins de 200 pbs de l'ORF, sauf opéron bien sûr). Si tu m'envoies des séquences, je pourrai t'en répérer un ou deux.  [...]

débrifing sur l'ADN.

AU niveau du promotteur d'un gène je ne comprends pas grand chose j'ai cherché sur internet mais ça ne m'a pas beaucoup aidé, est ce qu'ils permettent la réplication du gène, sa traduction Est ce qu'ils peuvent subir des régulations épigénétiques ou non j'essaye de tisser des liens avec ces chapitres mais j'ai un peu de mal.  [...] Le promoteur est un élément plus ou moins délimité qui contrôle l'expression du gène (donc sa transcription). C'est avec cette séquence qu'intéragissent les facteurs de transcription. Des modifications épigénétiques dans les promoteurs peuvent avoir lieu et modifier l'expression du gène correspondant.  [...]

Génétique Moléculaire

Un épissage constitutif c'est lorsque tu as tout tes introns qui sont excisés et dégradés puis ensuite tu obtiens un ARNm mature. Un épissage alternatif tu obtiendras un ARNm mature légèrement différent de celui issus de l'épissage constitutif et donc une protéine qui aura des différences subtils vis à vis de l'autre.   [...] - épissage alternatif avec 2 promoteurs. L'exon portant le promoteur choisis on aura telle ou telle séquence transcrite. ce sont des promoteurs alternatifs et là aussi tout va dépendre des facteurs d'épissage et de leur affinité pour le choix du promoteur.  [...]

[Biologie Moléculaire] Intron (suite) et Parasite

J'aurais voulu savoir si on peut considéré les introns comme des séquences régulatrices dans le génome car on a une alternance d'exon et d'intron dans le génome eucaryote donc on pourrait se dire que les introns sont des séquences régulatrices genre Promoteur d'un gène.  [...] Oui certains introns sont des séquences régulatrices qui peuvent être fixées par des facteurs de transcription qui viennent moduler l'intensité de la transcription.  [...]

Promoteur T7 et T3

Est ce que quelqu'un aurait la séquence des promoteurs T3 et T7.  [...]