• Santé - Position, Structure, Protéine

[Divers] Différence entre Biochimie et Biologie moléculaire

Ce qu'il y a d'intéressant avec la biologie moléculaire, c'est qu'elle s'intéresse de près, non seulement à la composition des molécules, mais également à leur conformation spatiale. Par exemple, on détermine la composition chimique d'une protéine ou d'un gène au niveau de la chaîne complète de ses acides aminés ou de ses nucléotides (sa structure primaire).  [...] On peut aussi déterminer la structure tridimensionnelle des éléments (par exemple une hélice alpha ) qui la ou le compose (structure secondaire), la position relative de ses différents éléments de structure dans l'espace (structure tertiaire), et même parfois la position dans l'espace de différentes protéines qui s'assemblent (structure quaternaire) pour former une protéine multimérique (comme l'hémoglobine par exemple).  [...]

Cristallisation des proteines

L'analyse de ces donnees s'appelle la resolution de la structure. Avec un peu de maths et de physique et d'informatique, on deduit a partir de la position relative des taches de diffraction, la position relative des atomes dans le cristal, et a partir de la, on modelise la structure tridimensionnelle de la proteine http.  [...] J'avais effectivement connaissance de l'experience de diffraction au rayon X pour découvrir la structure de l'ADN, mais je n'en avait pas compris le principe ^^.  [...]

[Biologie Cellulaire] Question Sur Le Cytosquelette.

On a retrouvé chez elles, une proteine homologue à l'actine permettant de garder la structure de la membrane procaryote. Les bactéries ont aussi le complexe Fts (filamenteux-thermo-sensible) permettant la constriction de la cellule a la position 1/2 pour la scinder en 2 (divisions cellulaires).  [...] Seulement chez les eucaryotes ce cytosquelette est tres present. Il sert a la dynamique des organites, a la partition des chromosomes lors de la division cellulaire au trafique des vésicules, la phagocytose, la migration cellulaire, flagelle, ect.   [...]

[Biochimie] conversion fasta/PDB

juste pour preciser. Vous ne pouvez pas convertir un fichier fasta en fichier pdb. Les informations ne sont pas du tout les mêmes. Le fichier fasta vous donne pour chaque identifiant une séquence linéaire de nucléotides ou d'AA. Les fichiers pdb renseignent essentiellement, pour une protéine donnée, sur la position de chaque atome dans la structure de cette protéine.  [...] Si vous avez juste la séquence et pas l'identifiant du gène/de la protéine en question, vous pouvez faire une recherche avancée sur le site de la PDB ( http.//www.rcsb.org/pdb/search/advSearch.do ) en copiant la séquence dans le champ adéquat. Un blast ira chercher les fichiers PDB qui correspondent à votre séquence.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

La structure tertiaire correspond à la position précise de chacun de ces atomes en trois dimensions. Il existe également une structure quaternaire, qui constitue une description de l'arrangement de plusieurs protéines en complexes protéiques.  [...] J'observe également que la description d'une protéine ne peut pas rentrer dans les bases de données si la résolution structurelle (structure secondaire) est supérieure à 4 angströms. Je pense notamment à la base de données UniProt. Je ne sais pas la part des labos qui possède l'instrumentation nécessaire (diffraction X, RMN, etc...) pour passer cette limite de 4 angströms.  [...]

[Génétique] Influence d'une mutation sur la synthese d'une protéine.

Une mutation est une modification anormale de l'ADN d'un gène. Une mutation ponctuelle peut être l'altération d'un nucléotide, le remplacement d'un nucléotide par un autre nucléotide, l'insertion ou la suppression d'un nucléotide.La myopathie de Duchenne est une de ces maladies génétiques due a une mutation d'un seul gene qui permet la synthese d'une protéine musculaire, la dystrophine.  [...] Si le gène possède un nucléotide T au lieu de C en position 6, alors le codon AAC originel formant de la leucine deviendra UUA qui formera la Leucine aussi. Cet mutation n'a donc pas de conséquence sur la structure de la protéine.  [...]

Feuillet Béta, composition

Je ne comprends pas bien votre question. La formation ou non de feuillet béta (structure secondaire) est due à la composition en acide aminé (structure primaire). Si vous changez cette structure primaire, vous pouvez modifier la présence de structures secondaires.  [...] En fait la composition d'un feuillet bêta dépend beaucoup de sa position dans la protéine, s'il est à la surface, la partie en contact avec l'extérieur sera principalement formée d'acides aminés hydrophiles (basiques, acides, alcools) alors que la partie dans la protéine sera majoritairement constituée d'acides aminés hydrophobes avec une préférence pour le tryptophane qui a un rôle structural important (acide aminé principal d'un coeur hydrophobe).  [...]

Lutte contre le paludisme : une nouvelle piste grâce à l'imagerie 3D

Pour cela, ils ont tenté de cristalliser l' enzyme en question pour ensuite en déduire sa structure tridimensionnelle, mais la technique est assez complexe. La cristallisation consiste en la déshydratation d'une gouttelette composée de protéines purifiées pour que ces protéines finissent petit à petit par s'agglomérer entre elles.  [...] Une fois les protéines cristallisées, les chercheurs ont utilisé la technique de cristallographie par rayons X pour visualiser la structure tridimensionnelle de l'édifice. Il s'agit de calculer la position des atomes dans l'espace par la réflexion des rayons sur les électrons.  [...]

[Biologie Cellulaire] Différences entre les gènes homéotiques et les morphogènes

Par contre les morphogènes n'est pas un gène, se n'est qu'une protéine visant a émettre un gradient de concentration (position en gros).  [...] Mais c'est vrai que leurs rôles sont tout deux d'émettre une position,structure,emplacement à certains tissus, cellules...bien que le gène hox ayant une grande importance pour le métabolisme.  [...]

Dominant négatif !!

Elle se fait par l'intermédiaire d'une liaison amide entre la fonction carboxylique de l'acide myristique et la fonction amine d'un glycocolle en position Nterminale de la protéine.  [...] Oui, mais il me semble pourtant que les protéines G (ou en tout cas certaines) voient leur sous unité gamma rattachée à la membrane plasmique par une myristoÿlation, ce qui place la protéine G entière (3sous unité à l'état inactif) en position sous membranaire.  [...]