• Santé - Population, SNP, Acide aminé

[Génétique] divers

Les SNP (single nucleotide polymorphism) ou polymorphisme de simple nucléotide ne sont utilisables dans les études d'association que si les fréquences alléliques obéissent à la loi de Hardy-Weinberg dans une grande population alors que dans mon cours j'ai les études d'association tiennent compte à la fois des SNP substituant un acide aminé (15-20000 identifiés avec une fréquence allélique.  [...] Le processus de régulation NMD (Non sense Mediated mRNA Decay) est susceptible de s'activer pour une ou plusieurs des mutations suivantes. g.2_4 del TAT alors que c'est une mutation en phase et que ça ne génère pas un codon stop prématuré.   [...]

[Génétique] Génétique des populations chez les poissons d'eau douce

je me pose un question simple. Peux t'on déterminer l'effectif d'une espèce de poissons d'eau douce à partir d'analyses génétiques comme on pourrait le faire avec d'autres espèces animales.   [...] Faire un état de la variabilité des sites SNP au sein d'une population je crois. Moins il y a d'individus, moins il y a de variabilité.  [...]

[génétique] L'empreinte génétique et le test de paternité

Le message de Nikaia me rapelle quelque chose à propos de la génétique historique. Si mes souvenirs sont bons on peut étudier la diffusion d'une population dans le monde grâce aux SNP (Singlze Nucleotide Polymorphism). Ce sont des mutations ponctuelles, dont un grand nombre commence à être recencé.  [...] Elles sont souvent prédominantse dans une population données. Ainsi en l'appliquant à la généalogie, on pourrait avoir une idée de l'endroit d'origine d'une famille. utile pour les familles d'immigrés dont les racines sont perdues.  [...]

Définition | SNP - Single nucleotide polymorphism - Snip | Futura Santé

Les SNP (pour single nucleotide polymorphism ), prononcés Snips, correspondent à des variations mineures du génome au sein d'une population. Un seul nucléotide, le composant de base de l' ADN, est modifié.  [...] Si la plupart du temps ces variations sont silencieuses, ou à l'origine de nos différences morphologiques, elles peuvent aussi être à l'origine de maladies génétiques, ou de prédispositions à des maladies.   [...]

[Génétique] Génétique hommes blancs et noirs :

L'espèce humaine est homogène génétiquement. Comme chez toute espèce, la variabilité intraspécifique est élevée étant donné le nombre d'individus dans la population et les conditions de milieu très variés Je pense que Sumatriptan voulait parler des SNP en parlant de différences interindividuelles.  [...] Bref rien n'est vraiment sûr en genetique(j'espere que je ne vais pas fâcher des gens),tout est aleatoire,certaines choses plusque d'autres,qui dit que des alleles codominants aujourdhui(exemple. groupes A et B dans AB) ne developperont pas une dominance respective,due à une modulation envirronementale(ma vision evolutionniste).   [...]

Pour une poignée de gènes...

Cherchant à identifier le nombre de gènes ayant participé à cette domestication, Stephen Wright, de l'Université de Californie à Irvine, et ses collègues ont analysé la diversité des marqueurs de polymorphisme nucléotidique simple ( SNP ) de 774 fragments de gènes de 100 à 900 paires de bases chez des échantillons de maïs moderne et de téosinte.  [...] Ils ont ainsi détecté 3463 SNP chez le maïs contre 6136 pour le téosinte. Selon les scientifiques, cette baisse du polymorphisme est le signe dans l'histoire de ce végétal d'un goulot d'étranglement génétique due à une sélection artificielle qui a réduit la diversité génétique de la population originelle.  [...]

[Génétique] Banque de SNP

je recherche des banques de SNP complètes et facile à utiliser. Ceux qui en connaissent j'attends vos réponses et des explications si vous pouvez. Merci d'avance.  [...] Auncune banque de SNP n'est complète, dans le sens où nous ne disposons pas d'une information exhaustive sur l'ensemble des polymorphismes existants dans une population/espèce.  [...]

[Génétique] Localisation d'un gène

En réalité, pour déterminer les gènes associés à des maladies, on détermine non pas directement des SNP's mais des haplotypes, ce sont des régions du génome qui sont transmises en bloc et pour lesquelles on ne retrouve qu'un nombre restreint (Une de ces régions particulière = seulement 7 (par exemple) haplotypes différents dans toute la population humaine).  [...] Le séquençage a baissé mais pas à ce point et les NGS (new generation sequencing) c'est énormément de boulot. Alors oui on a la séquence de référence mais il faut trop d'individus (au moins une centaine).   [...]

[Biologie Moléculaire] pubmed

J'ai récupéré une séquence d'un gène sur le site NCBI de pubmed et je ne suis pas une spécialiste de pubmed. J'aimerais connaître la numérotation de tout les exons pour pouvoir les localiser sur ma séquence. J'aimerais également avoir en parallèles de la numérotaion des exons la numérotation des acides aminées codons.  [...] effectivement.. avec ensembl c'est super il me met de la couleur pour les SNP la numérotation des nucléotides avec en même temps la numérotation des acides aminées codons en parralléles je trouve agréable.  [...]

[Génétique] SNP et microsatellite

Les SNP (Single Nucleotide Polymorphism) et les microsatellites sont des marqueurs moléculaires. Un marqueur moléculaire correspond à un locus sur l'ADN de séquence variable au sein d'une population.  [...] On peut constater qu'au locus étudié on observe dans la population des microsatellites constitués de 14, 16 et 20 répétitions. On a donc dans ce cas un marqueur multiallélique (ici, triallélique). Mais il existe des marqueurs microsatellites ayant bien plus d'allèles.  [...]