• Santé - Peptides, Extrait, Mélange, Digestion

digestion enzmatique suivie de HPLC phase inverse

voila je voudrais savoir qd on fait une digestion enzymatique d'une protéines par la trypsine par exemple est ce que après on fait une électrophorèse des différents peptides est ce qu'on extrait la bande correspondant à un peptide donné du gel et ensuite on procède à son analyse par HPLC si oui comment se fait cette extraction.  [...] et une dernière question est ce que l'analyse en HPLC se fait peptides par peptides extrait du gel ou bien c'est tout le mélange issu de la digestion enzymatique qui passe à l'analyse en HPLC.  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

Une dernière question. au niveau de la HPLC la séparation des peptides se fait comment Je c que c'est en fonction de l'hydrophilie mais je comprends pas comment ça se passe quand il s'agit de peptides est ce que lors de l'élution ya séparation des AA par rupture de leur liaisons peptidiques pour qu'ils puissent apparaitre un par un La séparation se fait peptide par peptides.  [...] qd on fait une digestion enzymatique d'une protéines par la trypsine par exemple est ce que après on fait une électrophorèse des différents peptides est ce qu'on extrait la bande correspondant à un peptide donné du gel et ensuite on procède à la HPLC si oui comment se fait cette extraction.  [...]

[Biochimie] Etude des protéines par spectrométrie de masse

En fait, suivant l'étude que l'on veut faire, on va devoir utiliser tel ou tel analyseur et c'est surtout ça qui va nous indiquer quelle source d'ionisation utiliser. Si on veut étudier un mélange complexe pour faire une étude d'interactôme par exemple, il sera préférable d'utiliser un analyseur orbitrap (un analyseur très résolutif) qui est toujours couplé à une source d'ionisation ESI.  [...] De plus, la source ESI est facilement couplée à une chromatographie liquide qui va entrainer la séparation des peptides avant l'entrée dans le spectro. Il est bien sur possible de le faire avec un appareil MALDI-TOF mais ca prendra beaucoup plus de temps puisqu'il faudra faire des gels à 2 dimensions par exemple pour séparer au maximum nos protéines puis faire l'extraction de chaque spot, reduction alkylation et digestion qu'on dépose sur la plaque MALDI (aujourd'hui la robotisation fait qu'il est possible de coupler une chromatographie liquide au MALDI).  [...]

[Biochimie] Action d'une enzyme sur des acides aminés

Le peptide traité par un mélange de 2 enzymes protéolytiques qui hydrolysent les liaison peptides sur le côté carboxylique des résidus Leu, Ile, et Val d'une part, et de Tyr, Trp, et Phe d'autre part, ont fourni quatres peptides Pa, Pb, Pc et Pd  [...] Voilà, je sais qu'elles sont toutes les deux des endoprotéinases, et je sais que la seconde (agissant sur Tyr, Trp, et Phe) est la chymortrypsine parce qu'elle coupe au niveau du côté C des acides aminés aromatiques, mais je n'arrive pas à connaitre la première qui agit sur Leu, Ile, et Val.   [...]

[Génétique] Extraction d'ADN plasmidique de bactéries

Bonjour, alors voila j'ai fait un TP sur l'extraction d'ADN et pour faire mon compte rendu j'ai un petit soucis, le spectrophotomètre indique que ma solution a.  [...] J'ai la présence de composés aromatiques et de très peu d'éthanol dans ma solution, mais je me demande comment j'ai pu contaminer ma solution, est ce du au tampon que j'ai utilisé pour solubiliser et dénaturer les protéines.   [...]

[Biochimie] acide aminée absorbtion

On ne parle plus vraiment de protéine au niveau intestinal mais de peptides (protéine fragmenté pour faciliter la digestion).  [...] Dans le fond moi je poser cette question car j'ai entendu dire qu'il ne fallait pas remanger tant que le chyme a pas quitter l'estomac,sinon il i a possibilité que celui ci (repas no 2 ) se mélange au chyme alors le chyme passe 2x plus de temps que prévus dans l'estomac (le chyme subit un deuxième procécus de digestion et sa peut causer fermentation et mauvaise aleine ) donc les gens qui mange au 2 heure seraient dans le tor car ils empêcheraient le contenu de l'estomac de se rendre au intestin donc d'être absorbé.  [...]

Biochimie : Protéines

2) Quel sera le comportement des trois peptides A, B, C lorsque le mélange les contenant sera chromatographié sur une résine échangeuse de.  [...] Il faut que tu considères les groupements ionisables de chacun de tes peptides. Peux-tu dessiner chacun de ces peptides, et noter pour chaque groupement les différentes formes qu'il peut prendre.  [...]

Immunité adaptative : les cellules dendritiques et l'amplification clonale | Dossier

Ces dernières, associés aux peptides antigéniques provenant de la digestion des pathogènes, seront alors reconnues par le récepteur T (TCR) des lymphocytes T (LT) dans les ganglions lymphatiques.  [...] - La seconde notion est au moins aussi fondamentale. Elle stipule qu'un LT ne peut en principe reconnaître qu'un seul peptide antigénique (on parle de clone T pour faire référence à cette sélectivité). Notons ici que ceci n'est pas tout à fait vrai dans l'absolu car il existe ce que l'on appelle une dégénérescence de cette reconnaissance qui fait qu'un LT peut s'adapter à des antigènes légèrement différents.  [...]

[Biochimie] Enzyme

Un polypetdide possède deux lysines, deux arginines et deux méthionies internes, combien de peptides prévoit-on d'obtenir après la digestion par la trypsine.  [...] Je sais qu'un peptide est formé au minimum de 2 acides aminés et que la trypsine clive le côté C-terminal des acides aminés basiques (soir la lysine et l'arginine).  [...]

[Biochimie] Identifier un gène à partir d'une protéine pure

ii/ ton génome est inconnu, alors là il faut réaliser une digestion trypsique, séparer les peptides, les transferer sur membrane et réaliser sur ceux-ci des séquençages N-terminaux.  [...] Grace aux différentes séquences peptidiques séquencées, tu pourra dessiner des oligonucléotides dégénérés et amplifier par PCR des portions de ton gène d'interet. Le reste de la séquence sera complétée par PCR inverse.  [...]