• Santé - Peptides, Bactéries, Séquences

[Biotechnologie] Utilisation de BLAST ? Mode d'emploi ?

En effet, la kurstakine présente une structure originale. elle présente un résidu histidine, ce qui est rare dans le monde des bactéries.  [...] Donc je me suis dis pourquoi ne pas faire une comparaison de séquence peptides avec toutes les autres bactéries totalement ou partiellement séquences à l'aide de BLAST Seulement voilà, je ne comprends pas comment fonctionne cette plateforme. Je ne dispose que de la séquence peptidique de la kurstakine.  [...]

[Identification] Bacterial display !

Ok grosso modo j'ai compris. le bacterial display est utilisé pour selectionner les peptides qui se lieraient à surface des bactéries présentes dans la banque utilisée...c'est ça.  [...] Dans le cas de l'article, on a que des bactéries exprimant le ligA ou pas (comme témoin) donc c'est plus les peptides à tester qui constituent une banque à screener.  [...]

Du venin de guêpe transformé en antibiotique

Pour se défendre, de nombreux organismes - y compris les humains - produisent des peptides capables de tuer les bactéries. Pour aider à lutter contre l'apparition de bactéries résistantes aux antibiotiques, de nombreux scientifiques ont essayé d'adapter ces peptides en tant que nouveaux médicaments potentiels.  [...] L'un des peptides qu'ils ont ainsi créés tue, chez la souris, des bactéries responsables d'infections respiratoires ou urinaires.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéines [Master 2] problème structures secondaires différentes

Après de nombreuses recherches infructueuses, je me demande si ces séquences ne seraient pas les protéines prions mais je pense que c'est plutôt un exemple que le nom générique de ces séquences (et puis les protéines prions sont des protéines complètes).  [...] Pour info, je crois que j'ai trouvé la réponse, je pense que ces séquences sont appelées séquences caméléons. Ce sont des petits peptides qui peuvent prendre différentes conformations suivant le contexte.  [...]

Superbactéries mortelles : découverte de nouveaux moyens de lutte

Avec son équipe, il a découvert un nouveau traitement médical, actuellement mis à l'essai, qui pourrait permettre de contrer de graves infections bactériennes sans l'aide d' antibiotiques. Cette découverte arrive à point nommé car de nombreuses bactéries (appelées superbactéries) sont devenues résistantes à presque tous les antibiotiques connus.  [...] Le tour de force de l'équipe de M. Hancock a été de créer, grâce a une nouvelle technologie matricielle, un très grand nombre de peptides (notamment des peptides polycationiques), qui peuvent, de manière sélective, déclencher une réaction qui a la propriété de combattre les bactéries, sans les effets indésirables de l' inflammation.  [...]

[Biologie Moléculaire] identification d'un gène

Ensuite, il me faudra faire exprimer ces deux vecteurs dans deux cultures bactériennes (ou de levure, en fonction du caractère plus ou moins capricieux des protéines eucaryotes), purifier ces protéines sur billes d'agarose couplées au glutathion et analyser ce qui sort.  [...] Les peptides et les protéines dont l'extrémité N est bloquée (e.g. groupe amine avec un dérivé acétyl, formyl...) ne peuvent pas être séquencés.  [...]

[Immunologie] Activation du Cd8+

Si je ne dis pas de bêtises, les CD8 sont activés par la CPA, par double reconnaissance de la corbeille CMH et du fragment antigènique qu'elle contient. Il existe une autre classe de lymphocytes cytotoxiques appelés lymphocytes NK (Natural Killer), qui eux reconnaissent directement les cellules infectées ou cancéreuses qui contiennent sur leur membrane des fragments antigeniques, en se baladant dans la circulation sanguine.   [...] En fait la présentation du déterminant antigènique par une APC à un Lymphocytes B ou CD8 active la fabrication de récepteurs aux cytokines sécrétées par les lymphocytes T CD4, eux mêmes également activés par la reconnaissance du discriminant antigenique par la APC.   [...]

[Biologie Cellulaire] La synthèse d'une protéine: L'hémoglobine

Ces ARNm sont des séquences périodiques de nucléotides, par exemple AUAUAUAU... Le tableau est construit par analyse des peptides obtenus.  [...] A l'aide des documents 3a et 3b, montrez qu'une mutation du gène de l'hémoglobine A peut expliquer l'existence de l'hémoglobine CS.   [...]

[Biologie Cellulaire] peptide signal

Cela sert par exemple à l'interleukine-1 (cytokine pro-inflammatoire) pour la transcription de collagénase intersticielle ( MMP-1 ) via le facteur NFkappaB qui possède cette séquence NLS. NFkappaB rentre dans le noyaux et stimule la transcription de MMP1.  [...] Notons que des systèmes de peptides signaux existent chez les bactéries et que ceux-ci ne sont pas toujours excisés. Par exemple dans la voie sec-dépendante commune à toutes les bactéries, le peptide signal est excisé. Mais pas d'excision dans les voies de sécretions ( pour bactéries à gram négatif ) 1 (hémolysine de E.  [...]

[Identification] Lig A immobilisés!

Lors d'un bacterial display, on a voulu tester l'affinité entre des peptides et des Lig A (Ag de surface présents sur des bacteries)...Pour ce faire, on a utilisé des Lig A immobilisés et non immobilisés sachant que les Lig A immobilisés étaient fixés par les peptides, et ceux non immobilisés donc solubles, ne l'ont pas été.  [...] Je veux savoir pourquoi pourquoi on a utilisé les Lig A immobilisés et non immobilisés.   [...]