• Santé - Niveau, Structure, ARN

Expression d'un gène

Concrètement, ça veut dire que tu peux avoir, sur un gène donné, de multiples ARN polymérases qui se suivent les unes derrière les autres, pour générer en un temps réduit un grand nombre d'ARN (quel que soit le type d'ARN). A un niveau très très intense, cela peut donner lieu à une structure dite en sapin de Noël (mes excuses pour cette illustration de piètre qualité).  [...] Beaucoup de gènes ont un niveau d'expression variable, càd faible dans certaines conditions, plus fort dans d'autres conditions.  [...]

[Biochimie] problèmes avec ARN long et structuré

Je dois préciser que cet ARN est tres long et très structuré. 514 nucléotides et 14 tiges boucles.. Je le purifie sur gel acryl/bisacryl 5% après transcription. J'ai lu plusieurs fois que pour de si longs ARN, une purification sur colonne HPLC était mieux niveau rendement, par contre, il n'est pas vraiment possible de séparer les produits de transcription abortive ou les dégradations.. Qu'en pensez vous.  [...] Là vient mon second problème. une fois transcrit, je procède à une déphosphorylation avant de marquer mon ARN radioactivement. En faisant un gel controle apres déphosphorylation, j'observe que ma bande ARN est relativement propre mais une fois l'ARN marqué et les premieres manips (EMSA) effectuées, je n'obtiens aucun résultat et je me rends compte que mon ARN est tres dégradé.  [...]

[Génétique] La synthèse protéiques

premiere différence fondamentale, la transcription s'effectue chez les eucaryotes au niveau du noyau ( chromatine décondensée) / procaryotes. pas de noyau et puis il ya trois types d'ARNm polymerase chez l'eucaryote tandis que chez la procaryote il n'y en a pas.  [...] merçi weensie pour ta réponse, mais tu vois mon problème se situe au niveau de la structure de l'ARN prémessager obtenu après transcription de l'ADN. Je voudrais donc savoir quelle différence de forme y a t-il entre les prémRNA de procaryotes et ceux des eucaryotes.  [...]

Les codons stops

Il y a la terminaison directe dit aussi rho-indépendante. Elle a lieu après deux séquences riches en CG en miroir qui vont former une structure tige-boucle juste avant une séquence poly-U au niveau de laquelle l'ARN polymérase bactérienne va se bloquer et se détacher de l'ADN.  [...] - La RNA polymérase III (tRNA) a un arrêt de la transcription à un site qui correspond a celui de l'ARN mâture (2ème U de 4 U qui se suivent dans une région riche en GC).  [...]

Comment est fait un promoteur ?

Dans un second temps, plus vite l'arn polymérase libère le site d'initiation pour faire l'élongation, plus vite une autre polymérase peut venir à son tour initier la transcription. Si tu connais les structures en arbre de Noël, tu comprendras mieux ce passage de relai.  [...] Encore faut-il dire qu'il y a des différences entre promoteur eucaryote et procaryote. Mais généralement, le concept général du promoteur a été dit. Les différences entre eucaryotes et procaryotes à ce niveau là sont surtout les facteurs transcriptionnels intervenant et la structure de l'ARN pol.  [...]

Expression de gènes

Mais ce n'est pas parcque l'on connait le code génétique que l'on arrive à le comprendre. Identifier un gène et son promoteur au niveau informatique signifie qu'ensuite, il faut vérifier son expression (et comme vous le dites, ce gène peut n'être exprimé que dans certains tissus ou stade de développement, par exemple).  [...] Plus sérieusement, il m'arrive de devoir identifier des protéines suite à des analyses. Si je me contrefiche du niveau ADN et ARN, la structure de la protéine, ses interactions probables et sa fonction m'intéressent beaucoup plus. Je n'utilise donc pas tout les jours cette database. Mais vu qu'elle est toujours utile.  [...]

Transcription

Par ailleurs, des ARNs aux fonctions moins bien établies mais toutes aussi communes que ceux cités précédemment font l'objet de nombreuses études encore maintenant. C'est le cas notamment des petits ARN nucléaires qui ne semblent quant à eux pas subir de modifications post-transcriptionnelles au niveau de leur structure primaire.  [...] les ARN de transfert et ARN ribosomiques ne sont pas des ARNm puisque par definition un ARN messager est un ARN qui a un message et que ce message va etre traduit, or les ARN de transfert vont être différemment conformés et adopter une certaine structure, et ne seront pas traduits, les ARNr seront assemblés pour former des ribosomes, les ARNt seron conformés spécifiquement et vont se voir apporté un acide aminé particulier en fonction de l'ARNt, rien a voir avec les ARNm mais leurs synthèse est aussi appelée transcritpion.  [...]

Interférence ADN

Un microARN est lui un ARN simple brin endogène qui va se structuré en tige-boucle. Il est alors pris en charge par un complexe appelé le microprocesseur qui contient la RNAse de type III Drosha et son cofacteur DGCR8 (ou Pasha chez les plantes). Drosha clive se précurseur (le pri-microARN) au niveau de sa base.  [...] Il faut aussi noté une certaine différente au niveau de leurs fonction. Chez les plantes les siARN vont cibler les ARNm et entraîner leurs dégradation par clivage alors que chez les mammifères les miARN vont plutôt se lier à la 3'-UTR des ARNm et bloquer la traduction puis recruter des enzymes qui vont dégrader ces ARNm.  [...]

[Génétique] Structure chimique de l'ARNm, ARNt et ARNr

Apres quelques heures de recherche sur internet, je n'ai toujours pas trouvé quelle était (ou si il y en a une) la différence au niveau de la structure chimique des ARN messagers, de transfert et ribosomique.  [...] A proprement parler, en gros, Il n'y a pas de différence dans les structures chimiques des trois molécules. La différence est à chercher au niveau de la conformation que prend la chaine, c'est à dire au niveau des différentes interactions entre les bases. Plus dans le détail, les ARNt intègrent des bases que l'on ne trouve pas dans les autres ARN tels que des bases hypoxantines par exemple.  [...]

[Biologie Moléculaire] les régions de régulation d'un géne

Effectivement tu décris les principaux signaux qui contribuent à la transcription d'un gène. Mais attention leur structure diffère fortement entre procaryotes et eucaryotes. N'oublie pas les signaux de terminaisons de transcription. L'ajout d'une queue polyA n'est pas systématique chez les procaryotes, elle se fait pour destabiliser les transcrits par une machinerie relativement à part (dégradosome).  [...] Elles interviennent dans l'initiation de la transcription car permettent le recrutement des ARN polymérases, donc pas vraiment dans la régulation (mais de leur structure dépend le niveau de transcription).  [...]