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CRISPR-Cas9 : les ciseaux génétiques sont-ils dangereux ?

Mais alors que certains chercheurs commencent à tester CRISPR-Cas9 chez l'Homme, d'autres tirent la sonnette d'alarme sur les risques liés à des mutations inattendues.  [...] Dans un communiqué, l'équipe explique. Aucune de ces mutations d'ADN n'a été prédite par des algorithmes informatiques largement utilisés par les chercheurs pour rechercher des effets hors cible. Les mutations n'auraient pas été détectées précédemment par les algorithmes car ceux-ci explorent plutôt les régions du génome qui ont le plus de chances d'être touchées, explique Science Alert.  [...]

Évolution au laboratoire : un virus devient mortel en 12 jours

Or, une étude tout à fait indépendante et publiée le 26 janvier dans Science, pourrait bien remettre un peu d'huile sur le feu, malgré elle. Des chercheurs de l' université d'État du Michigan (États-Unis) ont pu montrer qu'un virus tueur de bactéries, rendu inoffensif, pouvait retrouver son pouvoir meurtrier en 12 jours grâce à l'intervention de 4 mutations dans son génome.  [...] Dans ce cas de figure, puisque le récepteur OmpF ne devenait pas une cible intéressante, les chercheurs n'ont pas relevé les 4 mutations, la pression sélective les poussant à se focaliser sur d'autres moyens d'entrée.  [...]

Normalisation RT-PCR quantitative

La PCRq (je ne mets plus temps réel, c'est trop long) indique le cycle au cours duquel la fluorescence dépasse un certain seuil (fixé arbitrairement par l'utilisateur... dans la phase exponentielle ). Ce cycle est noté Ct (threshold cycle = cycle seuil ). La valeur du Ct est proportionnelle au nombre de copies de l'ADN amplifié (=cible) présentes au départ dans l'échantillon (d'ailleurs c'est ce qu'on essaye de mesurer avec la PCRq).  [...] Personnellement, je trouve que cette méthode a des limites. les plasmides sont si petits qu'il faut utiliser les concentrations très faibles d'ADN (fg). Dans ce cas, l'ADN a tendance au bout d'un moment à se coller aux parois des tubes en plastique (charges électrostatiques) dans lesquels tu stockes ta gamme.  [...]

Vampires : une maladie du sang à l'origine du mythe ?

Pour produire l'hème, l'organisme doit d'abord fabriquer de la porphyrine. Ce processus a lieu dans le foie et la moelle osseuse. Des mutations peuvent interrompre la chaîne de production de l'hème et conduire à des cas de porphyries.  [...] Dans une recherche parue dans Pnas, des chercheurs américains et français décrivent une nouvelle mutation qui favorise l'EPP, identifiant ainsi une nouvelle cible thérapeutique. En séquençant les gènes d'une famille française touchée par cette maladie, les chercheurs ont trouvé une nouvelle mutation du gène CLPX.  [...]

Découverte du premier virophage : un virus infectant d'autres virus

Mais ce n'est pas tout. Car le séquençage du génome du virophage démontre qu'il a non seulement échangé certains gènes avec Mamavirus, mais aussi qu'il en a importé d'autres de virus étrangers. Cette analyse du génome, effectuée en collaboration avec des chercheurs français (Patrick Forterre, Institut Pasteur et Université de Paris Sud) et américains (Eugene Koonin, du National Center for Biotechnology Information, USA), montre que sur les 21 gènes de Spoutnik, 13 affichent très peu de similitudes avec tous les autres gènes connus.  [...] Déjà, d'autres chercheurs évoquent les possibilités thérapeutiques offertes par un virus capable d'en infecter un autre tout en l'affaiblissant, voire en le détruisant. Il ne serait pas déraisonnable d'imaginer mettre au point un virophage prenant pour cible une zone du HIV restant constante, c'est-à-dire non susceptible de subir une mutation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comment analyser les résultats de PCR quantitative???

jajooo et Annaick_R, j'ai utilisé la PCR en temps réel par light cycler (avec normalisation en delta de delta ct) durant ma thèse. envoyez-moi votre adresse mail par MP si cette partie de mes matériels et méthodes vous intéresse, c'est tout détaillé (et corrigé par un chercheur confirmé dans le domaine, pas comme moi qui suis physiologiste.).  [...] Mais bon... Ca ne marche pas. La courbe que j'obtiens n'a aucune forme mathématique particulière. Soit parce que je n'ai pas assez de valeurs (je vais essayer d'en collecter d'autres auprès de ma maître de stage), soit parce que j'ai inclus des valeurs d'expériences ratées, soit parce qu'il n'y a véritablement aucune relation mathématique qui lie la quantité de messager d'intérêt à ma tubuline dans les mêmes situations contrôles.   [...]

Des embryons humains de nouveau modifiés

Quand l'embryon s'est divisé et que les cellules se sont multipliées, beaucoup d'entre elles semblaient avoir intégré la copie saine du gène, venant de la mère. Environ 72 % auraient été corrigées, ce qui est plutôt élevé. D'après les chercheurs, il n'y aurait pas eu d'autres modifications hors cible.  [...] La technique employée pourrait s'appliquer à d'autres maladies. D'après le Washington Post, les chercheurs seraient intéressés pour la tester avec le gène BRCA1, dont les mutations favorisent le cancer du sein. Ces travaux sont sensibles car ils touchent des cellules de la lignée germinale, et donc des gènes qui pourront être transmis aux générations suivantes.  [...]

le suivi des résistances

De plus, la recherche est en constant développement, et des nouvelles molécules sont testées régulièrement. Les deux dernières en date qui seraient les plus prometteuses sont BI-2 et PF74 (pas mal de publications à ce sujet). La dernière, PF74, obtenu après un criblage par l'entreprise Pfizer a été montré comme très prometteuse, notamment car il faut une accumulation de 5 mutations pour une résistance totale du virus.  [...] En revanche appliquer un traitement permet de mettre en avant certaines mutations qui sans cela n'aurait pas été sélectionnées. C'est donc très variable et va surtout dépendre de la cible du traitement (étape du cycle viral) et du nombre de mutations nécessaires à l'échappement.  [...]

Dépression : la stimulation transcrânienne soulagerait les symptômes

L'idée des chercheurs était donc de cibler ces ondes pour les resynchroniser avec les oscillations alpha du cortex frontal droit, et ainsi réduire les symptômes de dépression. Pour ce faire, ils ont recruté 32 patients souffrant de dépression majeure. Leurs symptômes ont été évalués grâce à la Montgomery-Åsberg Depression Rating Scale (MADRS), qui donne une mesure de la dépression.  [...] Chaque participant a suivi ce traitement pendant 40 minutes, et durant cinq jours de suite. Les chercheurs ont réalisé des électroencéphalogrammes pour relever les modifications des oscillations alpha. Les participants ont répondu à des questions pour tester leurs symptômes dépressifs, immédiatement après l'intervention, puis deux semaines plus tard et un mois plus tard.  [...]

[Biologie Moléculaire] quantitative/real time PCR quelle différence?

La PCR compétitive est basée sur la co-amplification de la matrice d'ADN cible et d'une quantités données d'un ADN standard interne (compétiteur ) portant les mêmes sites de fixation d'amorces.  [...] On est bien d'accord que dans ces liens il n'est absolument pas question de quantification, mais juste de detection. L'avantage de la PCR temps reel, c'est que c'est rapide, sensible et tres specifique de ce que l'on recherche.  [...]