• Santé - Motif, Unité, Séquence, Fonction

[Biochimie] domaine, monomère, protomère

Il y'a aussi le motif qui est la plus petite unité de séquence protéique ayant une fonction. et le module qui comporte plusieurs motifs.  [...] On parle de monomère pour une protéine seule en solution et de protomère pour l'unité protéique qui est associée dans une protéine oligomérique.  [...]

Codon initiateur et protéine

Les bactéries possède en amont du codon start AUG (donc dans le 5' UTR) une séquence RBS (Ribosome Binding Site) qui permet de recruter la sous-unités 30S du ribosome. Le RBS bactérien est appelé Séquence Shine-Dalgarno et c'est un motif riche en purine. La séquence Shine-Dalgarno permet le recrutement de la sous-unité 30S car celle-ci possède un ARNr 16S qui a une séquence Anti Shine-Dalgarno (ASD).  [...] Ce n'est pas un RBS car il ne permet pas la liaison du ribosome mais l'initiation de la traduction. Une fois cette séquence trouvé, la grosse sous-unité peut être recruté et la traduction commence.  [...]

Immunohisto

Les anticorps peuvent alors reconnaitre des epitopes conformationnels (par exemple, un motif d'acides amines regroupes spatialement mais eloignes sur la sequence, ou bien des boucles...). Cette structure spatiale n'a pas forcement la meme forme en fonction du tissu, puisque la proteine cible n'est pas forcement la meme exactement (glycosylation, phosphorylation, acylation...etc...).  [...] Cependant. 1) en western, si l'anticorps est suppose reconnaitre un site qui peut etre modifie (phosphoryle, clive, episse, acetyle, palmytoyle...), il se peut que en fonction du tissu, la proteine soit ou non modifiee a cet endroit et donc ne lie plus aussi bien l'anticorps en western-blot.  [...]

coiffe et queue polyA traduite ?

Pour le recrutement des facteurs c'est lié a l'état de phosophorylation d'un motif répété de la sous unité rbp1 de la pol. Cet état de phosphorylation est fonction de l'avancée dans le processus.  [...] 1- l'ajout de la queue polyaA se fait durant la MATURATION post-transcriptionnelle, plus précisément à l'extrémité 3' des molécules d'ARNm après reconnaissance d'une séquence AAUAA, l'enzyme poly(A) polymérase ajoute une queue poly(A) qui sera ensuite allongée jusqu'à 200 résidus d'Adénine.  [...]

[Génétique] Gène plus court?

Essaie aussi de Blaster la séquence du motif additionel caractéristique du gène humain, il s'agit peut-être d'un motif fonctionnel précis, ce qui t'avanceras dans ta réflexion.  [...] Les deux protéines ont la même fonction chez les deux organismes et la région manquante n'est pas la région importante puisque ce sont les régions N et C terminales qui doivent être conservées pour avoir une protéine active. Si je regarde la séquence nucléotidique, il ne manque pas 39 nucléotides.  [...]

[Génétique] promoteur??

Cette séquence -35 présente un motif de six bases bien conservées. TTGACA. Enfin, à environ 10 nucléotides en amont de l'origine de la transcription, on retrouve un motif TATAAT. Cette séquence dite séquence -10 est appelée également boîte de PRIBNOW.  [...] une séquence de six nucléotides riche en A et T. La séquence dite consensus (statistiquement la plus rencontrée) est TATAAA. Cette boîte fixe un facteur général de transcription appelé TFIID (TF. facteur de transcription. II pour l'ARN polymérase II). Ce facteur est absolument nécessaire pour l'initiation de la transcription.  [...]

[Biologie Cellulaire] question sur les séquences consensus

Une séquence consensus est une séquence moyenne qui résulte de la comparaison d'un grand nombre de séquence dont la fonction est identique.  [...] Xylem, la séquence dite Shine-Dalgarno est un motif ARN reconnu par l'ARN16s du ribosome chez les procaryotes. Elle participe donc à l'initiation de la TRADUCTION pour de nombreux gènes bactériens.  [...]

[Génétique] Traduction des protéines

- La séquence de Kozak et la séquence de Shine-Dalgarno ont les mêmes fonctions, la première dans les organismes eucaryotes, la première chez les procaryotes.  [...] La sequence SD interagit avec l'ARnr 16S alors que ce n'est pas du tout le role du contexte de kozac (ce n'est d'ailleur pas une sequence, mais plutot un motif consensus). Ce dernier prédit qu'un codon AUG sera plus ou moins efficace pour initier la traduction chez les eucaryotes.  [...]

Telomerase

Je ne comprend pas bien le but de la telomerase, d'après ce que j'ai compri,il s'agit d'une protéine qui contient une séquence de RNA qui va venir s'appareiller au DNA, est-ce juste Quelqu'un pourrait-il me dire en gros son mode de fonctionnement et son utilité La telomerase est-elle utilisée dans toutes nos cellules D'après mon cours non mais ca me paraît bizare.  [...] 4. La télomérase contient une molécule d'ARN qui sert de matrice pour l'élongation. Elle est donc bien une transcriptase réverse. Et c la seule polymérase portant une matrice de ce type.   [...]

[Biologie Moléculaire] Cis et trans

L'élément Cis est une séquence d'ADN, comme un motif reconnu par un facteur de transcription par exemple.  [...] En tout cas dans les publications ce sont des termes très peu utilisés. A la limite on les trouve toujours accompagné de -régulateur. trans-régulateur, cis-régulateur. Je pense que ces dénominations ont été reprises de la chimie où l'orientation spatiale des liaison adjacentes à une double liaison défini une configuration trans ou cis, mais aucun rapport logique avec la bio mol.   [...]