• Santé - Molécule, Fragment, ADN

[Biologie Moléculaire] Bandes d'ADN non amplifié??

J'ai effectué une PCR certaines amorces ont été révélées incompatibles chez certaines souches, cependant seul quelques souches montrent après analyse sur gel des amplifiats des bandes correspondant à l'ADN (vérifié par la taille correspondant à celle de l'ADN mis au départ), ma question est pourquoi cette bandes n'apparait pas chez les autres souches.  [...] La réponse la plus simple est que ces souches n'ont pas le fragment d'ADN que tu essaies d'amplifier. Quelle type de molécule supporte ce fragment (chromosome, plasmide) Est-ce une PCR colonie ou sur une extraction Il peut aussi s'agir de la présence d'inhibiteurs de PCR dans les extractions d'ADN des souches qui semblent négatives.  [...]

[Biologie Cellulaire] Questions diverses sur l'ADN

Les topo II apportent des supertours dans une molécule (mais elle peut aussi en enlever). L'énergie nécessaire provient de l'hydrolyse de la molécule d'ATP.Un segment d'ADN (G) sera coupé sur ses 2 brins, et formera la porte (gate) à travers laquelle passera le fragment transporté (T).  [...] L'hydrolyse de l'ATP permet à la molécule de revenir à sa conformation de départ sans lâcher le segment G, un nouveau tour ( ) peut commencer.  [...]

[Biochimie] rapport A+T/G+C dans l'ADN

Je doute que cela soit vrai en fait. Je pensais que le rapport A+T/G+C était spécifique de chaque espèce mais sur l'ensemble du génome pas sur une molécule d'ADN c'est à dire un fragment double brin.  [...] Pour la A je dirais faux car les molécules d'ADN d'une cellule sont les différents chromosomes or ces derniers ne sont pas identiques entre eux donc leur rapport de bases indiqué sera différent.  [...]

[Biologie Moléculaire] la forme B de l'ADN

dans une question d'un exercice de BM en nous dit que quand une molécule de bromure d'éthidium (BEt) s'intercale entre deux plateaux, elle augmente la distance entre deux paires de bases de 0.34 nm et diminue l'angle de 26°(le faisant passer à 10° au lieu de 36°).  [...] en fait, avant cette question on devais calculer la longueur d'une molécule pour un fragment d'ADN de 100 bp en structure B, pour cette question j ai trouvé que la longueur est de 34nm et on a 10 tours car dans la forme B de l'ADN l'hélice fait un tour complet tous les 3.  [...]

cellules souches

Je ne sais pas comment vous entendez le terme de conditions. le milieu et les moyens permettant la culture ou si vous cherchez a connaitre les raisons qui incitent à ces cultures.   [...] Un plasmide est une molécule d'ADN circulaire capable de se multiplier de manière autonome dans un organisme procaryote ou eucaryote. Il possède une origine de réplication, un gène de sélection et généralement de multiples sites de clonage pour y insérer un fragment d'intérêt. =. définition de FS.  [...]

génétique

On decouvre que de plus en plus de regions que l'on pensait ne coder pour rien, permettent en réalité d'exprimer des ARN non traduits. Il y a aussi tous les introns, enfin il y a de grand fragment d'ADN qui ne code probablement pour rien, mais qui pourraient avoir une utilité dans l'organisation de la molécule d'ADN, sa compaction, sa localisation dans le noyeau etc.  [...] il y a aussi les snoARN, miRNA etc... recherche sur le forum c'est une discipline en pleine expansion et tres a la mode. Il semble que de tres nombreuses fonctions biologiques (regulation de l'expression des genes) fassent appel a une regulation par des petits ARNs.   [...]

[Génétique] hybridation adn/adn : technique de southern blot

Mon ADN lambda à un poids moléculaire de 48 502 pb. Et le premier fragment de mon marqueur correspond à 21 226 pb. Or en regardant mon gel, je constate que mon ADN lambda( puit n°4) à migré au meme niveau que le premier fragment du marqueur. comment peut- on expliquer cela puisqu'ils n'ont pas le même poids moléculaire.  [...] Donc dans ce cas, le fragment d'ADN visible au puit 4 à déjà été digéré. puisqu'en regardant ma carte de restriction, je constate que EcoRI permet d'obtenir un fragment de 21 226 pb. Pourtant mon puit 4 ne contient pas d'enzyme, donc pas de digestion possible.  [...]

[Génétique] Plusieur question?

La question est vague. Si tu possède la séquence nucléotidique, sachant que l'association 3 par 3 des nucléotiques correspond à un acide aminé, il suffit globalement de diviser le nombre de nucléotides par 3. Si tu ne possède que la protéine, il faut alors par exemple faire migrer celle-ci sur un gel SDS-page et vérifier ainsi son poids moléculaire.  [...] Pour être plus précis, on peut dire qu'un fragment d'ADN est une séquence nucléotidique mais une séquence nucléotidique peut également être un fragment d'ARN. Donc ce n'est pas une équivalence stricte.  [...]

[Biologie Moléculaire] Enzymes de restriction VS fragment d'ADN

J'ai effectivement coupé l'autre extrémité de mon insert avec une autre enzyme pour m'affranchir de toutes les étapes de phosphorylation / déphosphorylation. Et encore, ma ligase a des propriétés de polymérase et est capable de réparer l'ADN avant la ligation, si bien qu'elle peut quand même lier deux extremités cohésives différentes.  [...] Pour ce qui est de l'explication moléculaire de la reconnaissance de la séquence par l'enzyme, cela se fait par complémentarité structurale et chimique entre les nucléotides de la séquence palindromique et les acides aminés de l'enzyme. C'est un système assimilable à une clef et une serrure.  [...]

[Biochimie] PCR & Southern Blot

PCR et Southern ne sont pas utiliser dans le même but mais ils peuvent être fait de façon complémentaire. Pour ce qui est de la révélation lors du southern effectivement la sonde doit être marqué (pas obligatoirement par radioactivité d'ailleurs). Pour la PCR les fragment amplifié sont visualiser après migration sur gel d'agarose contenant du BET (bromure d'ethidium), c'est une molecule qui s'intercale entre les base de l'ADN qui devient fluorescent sous UV.  [...] Si, si tu le fais migrer en même temps qu'un marqueur de poids moléculaire = mélange de fragments d'ADN de taille connue (cela peut être un ADN de ta collection digéré par des enzymes à ta convenance).  [...]