• Santé - Molécule, ADN, Séquençage

Séquençage de l'ADN : bien plus vite et bien moins cher

Deux études proposent des méthodes globalement assez similaires pour réaliser un séquençage de l'ADN abordable et bien plus rapide. Le principe. faire passer un simple brin de la molécule dans un trou minuscule et détecter la signature électronique au passage de chacun des nucléotides.  [...] Cela ne constitue plus vraiment un obstacle depuis les années 1970, grâce au séquençage de l'ADN, une technique qui permet de constater l'ordre des bases azotées formant la molécule clé des noyaux cellulaires. Les méthodes ont progressé au fil des décennies, avec des machines à séquencer automatisées, mais cela reste encore coûteux et demande des délais assez longs.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mais la PCR ... à quoi ça sert ?

En effet, s'il s'agit d'étudier une molécule d'ADN et d'en faire un séquençage, en quoi la polymérisation en chaîne permet-elle d'expliciter les données d'un génome.  [...] Ce que je veux dire c'est que, pour faire cette PCR, il faut bien partir d'un échantillon d'ADN, celui que l'on désire étudier en l'occurrence. En quoi le multiplier un grand nombre de fois aide à son étude Je ne saisis pas comment on se sert du nombre de copies des séquences obtenu, comment on en tire des conclusions.  [...]

définition d'une séquence en biologie

Le mot séquence peut faire référence à séquence protéique, séquence d'ADN (entendez séquence des bases d'ADN puriques ou pyrimidines), séquence d'ARN (l'uracile remplace la thymine dans le séquençage), ou alors séquence au niveau d'un fichier texte contenant la séquence d'une molécule biologique (branche de la bio-informatique).  [...] Merci pour vos réponses je voulais savoir une dernière chose. que se passe t-il pour la séquence du brin droit de l'ADN En quoi elle est différente de l'autre brin.  [...]

[Biologie Moléculaire] L'ADNc est simple ou double brin ?

ADNc designe une molecule d'ADN obtenue par reverse transcription a partir d'un ARN. Cette molécule est donc simple brin. Si on veut la rendre double brin alors il faut effectuer une etape de synthese avec une DNA pol classique (polI ou Taq par expl). Donc en fait la molecule d'ADNc originelle est simple brin, mais tres fréquemment on la rends double brin pour plus de facilité de manipulation (sequençage, clonage etc...).  [...] Mais pour un gène donné, comment on peut rendre l'ADNc (simple brin) en double brin à partir d'un seul. Normalement, pour obtenir double brins, faut-il pas partir de deux brins car, si les deux oligos se mettent sur les deux cotés d'un seul brin et chacun s'avance vers l'autre sur le mem brin, comment on peut en avoir deux.   [...]

[Biochimie] Séquençage de ddN

pour la méthode de Sanger dans un tube on ajoute l'ADN à séquencer, UNE amorce, la polymérase, des dNTP et des ddNTP, on lance la réaction de séquence (semblable à la PCR). Ici c'est l'ancienne façon de faire (l'originale). On met la même chose dans le tube mais un ddNTP différents dans chaque tube donc au final un tube avec ddNTP A, T, C, G.  [...] Lors du cycle de séquençage, la polymérase a 2 choix, un dNTP et la réaction continue ou un ddNTP et la réaction s'arrête. Heureusement, il n'y a pas qu'une molécule d'ADN dans le tube et donc les 2 possibilités vont se faire.  [...]

Premier séquençage de l'ADN dans l'espace à bord de l'ISS

MinION est un outil de séquençage développé par l'entreprise Oxford Nanopore Technologies et disponible dans le commerce. Ce séquenceur portable a permis de réaliser le premier séquençage d'ADN réalisé dans l'espace. Le principe de cet appareil consiste à envoyer un courant ionique positif à travers de minuscules pores percés dans des membranes.  [...] En même temps est envoyé un fluide contenant l' ADN. En bloquant partiellement les nanopores, ces longues molécules modifient le courant d'une façon qui dépend de la suite de bases qu'elles portent (les lettres du code génétique ), ce qui permet donc le séquençage.  [...]

Utilité de la PCR en médecine ?

Ensuite si ton échantillon n'est pas assez concentré en ADN à séquencer tu ne pourras pas le séquencer de manière fiable, d'une part parce que les séquenceurs utilisés en routine pour ce genre de manip ont un certain seuil de détection et qu'une seule molécule ne suffit pas, et d'autre part parce que tu veux que ta molécule soit séquencée plusieurs fois pour avoir une certaine profondeur de séquençage te permettant d'affirmer que la séquence que tu as est bien celle que tu avais dans ton échantillon au départ.  [...] Sinon, la PCR peut être une étape nécessaire au diagnostic et le but est bien d'obtenir un grand nombre de fragments d'ADN pour ensuite le séquencer par exemple, et là c'est le séquençage qui répond à ta question, pas la PCR elle-même qui n'a été qu'un outil d'amplification.  [...]

[Microbiologie] évaluer la diversité

La composition de l'échantillon a été analysée par culture (des dilutions étalées sur un milieu solide et cultivée en anaérobie, 96 isolat identifies par séquençage du 16S) et par la méthode moléculaire (PCR 16S sur l'ADN total, clonage, séquençage de l'insert pour 96 clones).  [...] J'ai identifié 21 espèces au total, certaines par les deux techniques, d'autres seulement par culture ou par la méthode moléculaire. Le nombre d'isolats ou de clones pour une espèce varie de 19 à 1 (moyenne=9.4).  [...]

Définition | Génétique | Futura Santé

La mise en évidence de l' ADN, qui est le support de l'information génétique, a permis le développement de la génétique moléculaire.  [...] Au laboratoire, de nombreuses techniques de biologie moléculaire permettent de manipuler et d'analyser les gènes. utilisation d' enzymes de restriction, clonage de gènes dans un plasmide, production d'ADN par PCR, séquençage de l'ADN.  [...]

Les molécules dans l'océan, des clés de la médecine et de la cosmétique

La molécule peut ressembler à un antibiotique ou à des composés ayant des effets liés à l' inflammation par exemple. Les techniques de laboratoires sont aujourd'hui très efficaces pour séquencer l'ADN des micro-organismes et les comparer avec les outils de la bio-informatique.  [...] C'est là une affaire de stratégie. Nous devons ensuite mettre au point un processus de fabrication à l'échelle industrielle. Si la molécule est petite, la synthèse chimique sera la bonne solution. Si elle est complexe, ce seront des procédés de biotechnologie, utilisant des cellules (bactériennes ou végétales) qui sauront la fabriquer.  [...]