• Santé - Modélisation, Proie, Prédateur

Modèle proie-prédateur de Lokta Volterra

Bonjour à tous, dans le cadre d'un devoir de fac je dois effectuer à l'aide du logiciel populus une modélisation de type proie-prédateur. Cependant je n'arrive pas à trouver un comptage de populations de proies et de prédateurs sur plusieurs années qui me permettrait de suivre l'évolution démographique de deux espèces.  [...] Si quelqu'un pouvait me donner une source ou deux pour avoir quelques effectifs, ça m'aiderait beaucoup.   [...]

[Divers] Les mathématiques en biologie

J'imagine qu'il y a aussi un paquet d'equa diff dans pas mal de domaines de la bio.. genre modelisation des populations (proie/predateur/nourriture), evolution de phenomene phyisco-chimiques,  [...] Il devrait y avoir bientôt à cette adresse des cours sur la modélisation de systèmes biologiques, la prédiction d'interaction (ainsi que bien d'autres domaines bien sûr).  [...]

[Divers] Recherche de logiciel de représentation de réseaux trophique

Je posséde les listes des espéces consomées par les principaux prédateurs de la baie et j'aimerais représenter les chaines alimentaires race à un logiciel de modélisation (pour le moment je ne m'intéresce pas aux échanges de matiéres ou d'énergie).  [...] J'aimerais une fois la recherche bibliographique représenter le réseaux trophique, simplement en montrant juste quelles espèce conssome tel le autre espèce (sans représentation de flux de matière, ni d'énergie...). le probléme c'est qu'avec plus de trois cent espéces dans mon tableau, un graphique réalisé manuellement sur un traitement de texte devient vite un gros fouillit.   [...]

Réseaux de neurones

Alors, on me dit que c'est dû à la mauvaise modélisation du neurone. Pourtant, il semble assez clair qu'on peut toujours mesurer la fonction de transfert, bien qu'il est mis en évidence qu'il y a un caractère probabiliste(mais on peut quand même essayer de trouver la distribution non) dans la transmission du signal.  [...] ou estce que la modélisation ne permet juste d'avoir une prédiction des points entre les mesures sans pouvoir changer les causes.  [...]

[Divers] Bioinformatique

Si je peux me permettre, la bioinfo ne se résume pas à écrire des softs ou à en utiliser (ce que tu semble sous entendre). En modélisation par exemple, il y a des raisonnements particuliers et, c'est plutot ta vision des choses que je trouve réductrice.  [...] Pour moi, la modélisation ne fait pas partie de la bioinfo. c'est une discipline plus théorique et au croisement d'autres domaines en plus.  [...]

Le scutoïde, cette nouvelle forme géométrique identifiée dans nos cellules

Le scutoïde ressemble à un prisme tordu. Cette modélisation présente deux scutoïdes. Gómez-Gálvez et al., Nature Communications, 2018.  [...] Un groupe de chercheurs des universités de Séville (Espagne) et Lehigh (États-Unis) a voulu comprendre l'organisation géométrique des tissus grâce à une modélisation informatique.  [...]

[orientation] Avenir de la Bioinformatique

En vrac, on peut désigner les bases de données en génome, transcriptome, protéome, métabolisme, divers (lipides, surces, etc...). les outils de traitement de ces bases de données et de comparaisons (FASTA, BLAST...), la phylogénie, les modélisateurs à partir de données cristallographiques ou RMN (Pymol, Swiss Pdb Viewer), les systèmes de calculs d'énergie en modélisation moléculaire, les prévisions de structure, de domaines, voire plus.  [...] Je pense qu'une chose qui serait vraiment bien utile serait un programme de modélisation 3D de proteines, actuellement on sait dire a peu pres ce qui sera en fuillet beta, ou helice alpha, mais bon on s'arrete a ca, une prediction fine et fiable serait vraiment pratique.  [...]

[Biochimie] culture de bacterie peste

Il est formellement interdit de manipuler des souches biologiques en dehors du stade de manipulation minimal qui leur est attribué. Yersinia pestis se manipule dans des laboratoires type P3. Il existe probablement des modèles d'étude de la peste non pathogènes.   [...] Cela est fréquent en microbiologie, on prend un membre du même genre ou d'une famille apparenté pour étudier indirectement les propriétés biologiques du pathogène. Par exemple, un modèle d'étude de la membrane de mycobacterium tuberculosis est la bactérie corynebacterium glutamicum.   [...]

[Evolution] L'homme est-il sorti de la théorie de l'évolution de Darwin? - Page 6

il faut faire attention au fait que cette habitude de penser la génétique quantitative en termes de décomposition de la variance résulte d'un choix de modélisation (remontant à Fisher je pense). Ca marche bien comme ça mais il faut être conscient qu'il peut y avoir d'autres approches.  [...] Tu invoques la philosophie et ça me force à réfléchir... Effectivement c'est toujours le cas qu'on fait des inférences sur les modèles et qu'on les transpose à la nature. Mais ici, il me semble que la modélisation n'a rien de naturel.  [...]

SOS Modélisation moléculaire - Unix

J'ai un gros problème à l'interface entre la modélisation moléculaire (donc ce forum) et l'utilisation d'Unix (donc plutôt informatique), plate forme sur laquelle tourne le logiciel de modélisation que j'utilise.  [...] Je commence à bidouiller un peu les programmes de dynamique et de minimisation d'après les conseils d'un gars qui connait un peu le domaine, pour utiliser le type de méthode utilisée par les types qui publient.   [...]