• Santé - Méthodes, Séquence, Structure

[Biochimie] Méthode d'études AA et protéines

Est-ce que quelqu'un pourrait me confirmer ou m'infirmer les méthodes d'études utilisés pour déterminer une séquence en AA (structure I) et protéines.  [...] Et dernière question, peut-on considérer (ça me paraîtrait logique mais jprefrère demander) que les méthodes utilisés pour déterminer la séquence en aa sont les mêmes pour déterminer la structure primaire.  [...]

[Biochimie] Format pdb

il va d'abord falloir résoudre un problème trivial. Trouvez la structure de cette protéine a partir de sa séquence primaire. je vous suggère deux pistes. les methodes ab initio ou par les méthode par homologie.  [...] Les méthodes de prédiction de structure portent bien leur nom. Ce sont des prédictions, généralement aussi fiables que l'oracle de delphes en plein délire hallucinatoire (j'exagère volontairement). Si une protéine dont la structure a été résolue expérimentalement se trouve aussi avoir une forte identité de séquence (.  [...]

Structure protéines

Pour le moment les différents motifs en 3 dimensions possibles, à partir d'une séquence dans un milieu déterminé, ne sont pas tous connus. Il est donc difficile de déterminer la structure spatiale d'une protéine avec uniquement sa séquence.  [...] alors j'espere qu'il veut savoir ça car il a dit des methodes phisico chimique alors ça me fait reference a l'etude des sequences peptidique ou structure primaire.  [...]

Haute résolution

Il existe deux méthodes pour déterminer la structure des protéines, la résonance magnétique nucléaire ou RMN et la diffraction des rayons X par des cristaux de cette protéine.  [...] Lorsqu'on parle de structure à haute résolution, c'est la seconde méthode qui est utilisée. Selon la qualité du cristal formé par la protéine en question, sa capacité à réfracter les rayons X sera différente. Plus le cristal est bon, plus la résolution sera haute (1 à 2 angströms), ce qui permet de placer exactement les chaines latérales des acides aminés dans l'espace.  [...]

[Divers] Compte rendu de travaux pratiques

Pour la structure, ca va aussi dépendre de ton niveau, toujours de mémoire, j'ai du passer à la structure article scientifique (intro, matériel et méthodes, résultats, discussion) pendant la maîtrise (M1).  [...] Pour la structure, le plus simple c'est de demander au responsable du TP.  [...]

[Biochimie] acides aminés et structures

Peut-on deduire la structure II(hélice alpha, feuillet beta..) ou III (repliement ) d'une protéine à partir d'une séquence d'acides aminés (structure I).  [...] On arrive à peu près correctement à prédire les structures IIaires des protéines, mais pour les structures IIIaires, c'est beaucoup plus difficile. Et en fait, on ne prédit pas vraiment la structure, on essait de trouver parmi les structures que l'on connait déjà, lesquelles pourraient correspondre à la séquence donnée.  [...]

La sensation de « bouche sèche » décryptée sous UV

En dégustant une groseille pas vraiment mûre, une tasse de thé ou un verre de vin, la sensation est la même. Comme si, soudain, l'intérieur de la bouche s'asséchait. c'est l'astringence. Pour la première fois, les mécanismes d'interactions moléculaires responsables de cette sensation ont été identifiés par des chercheurs de l'Inra, de l'université ParisSud et du CNRS, en collaboration avec des équipes du synchrotron Soleil, grâce à une méthode utilisant le rayonnement ultraviolet.  [...] En effet, ces protéines sont dites intrinsèquement désordonnées, c'estàdire qu'elles ne possèdent pas de structure tridimensionnelle bien définie, ce qui rend difficile - voire impossible - l'utilisation des méthodes d'analyse classiquement utilisées pour déterminer cette structure (biocristallographie, RMN ).  [...]

L'expérience mystère..

Tu peux faire un Blast sur NCBI, ça peut peut-être trouver des analogies avec d'autres espèces ou trouver des régions spécifiques à certaines fonctions. Bien sûr, il faut connaître la séquence de ton gène avant. A première vue, ce serait la méthode la plus simple et la plus rapide pour obtenir quelquechose.  [...] Vu que personne répond quand même, je dis quel était le premier gros point auquel je pensais. Vu que c'est des annotations de séquence génomique, je pensais tout simplement à toutes les techniques permettant de déterminer la structure d'un gène, et pour ça ya une grosse partie qui peut se faire sans passer par l'expression de la protéine codé par le gène.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquence validée pour sonde GAPDH

Après de nombreuses recherches dans la littérature scientifique, je n'arrive pas à trouver une séquence de sonde publiée. J'ai de superbes images de Northern GAPDH, mais bien sûr, la séquence n'est jamais donnée dans le matériel et méthodes.  [...] Quelqu'un aurait-il dans ses tiroirs une pub avec une séquence Parrallèlement, je vais continuer à voir les fournisseurs du commerce, mais c'est pas évident non plus (Sigma avait un ADNc contrôle mais qu'il ne produise plus...).  [...]

apoptose

oui biensure houda,vous pouvez me rendre un service svp.j'aimerai bien savoir quel est la differance entre la pcr et le clonage je pense que c le meme principe non.bon vous demandez a vos prof si c possible.   [...] je ne peux pas contacter mes prof car nous sommes en vacances, mais je vais vous répendre d'apres mes connaissances, le clonage necessite un vecteur donc culture et prend du temps, la PCR est plus rapide (se réalise dans un tube à essai) et le taux d'amplification est très élevé.   [...]