• Santé - Méthodes, Séquençage, Nouvelle génération

[Génétique] CGH/Illumina/Roche 454

Je voudrais avoir quelques informations sur ces méthodes. Je connais bien le fonctionnement de la CGH, en revanche je n'ai pas trop bien compris comment fonctionnent l'Illumina (avec des didésoxyribonucléotides qui se fixent de manière réversible je crois) et la Roche 454 (pyroséquençage je crois).  [...] Illumina a développé un séquençage par synthèse avec des ddNTP réversibles (on les retransforme en dNTP une fois fixés et lus) et marqués, avec une lecture en temps réel.  [...]

Bientôt des bébés sur mesure nés d'une FIV ?

Grâce aux nouvelles technologies de séquençage, il est désormais possible de compter le nombre de chromosomes relativement rapidement.  [...] Cette technique de séquençage grâce aux méthodes de dernière génération réduirait également d'un tiers les coûts d'une telle procédure. On resterait malgré tout dans des dépenses de l'ordre de quelques milliers d'euros. Bien au-delà des 200 € proposés par des rivaux de l'Institut des technologies de la fertilité à Genk (Belgique) lors du même congrès grâce à un nouveau procédé d'incubation, qui ouvrirait alors la technique aux pays les plus pauvres.  [...]

Quand la main droite imite la gauche, la génétique est en cause

Le syndrome des mouvements en miroir congénitaux constitue une maladie rare qui se transmet de génération en génération. Les personnes atteintes ont perdu la capacité de réaliser un geste différent des deux mains. lorsqu'une main effectue un mouvement, l'autre main effectue automatiquement le même, contre la volonté du sujet.  [...] Par une approche couplant une analyse génétique conventionnelle et une analyse dite en whole exome (une technique d'analyse génétique de nouvelle génération permettant le séquençage entier de la partie signifiante du génome), les chercheurs ont démontré que le gène RAD51 était responsable de la maladie des mouvements en miroir congénitaux dans une grande famille française et confirmé ce résultat dans une famille allemande atteinte de la même maladie.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage Nouvelle Génération

Bonjour, j'ai un petit problème dans la compréhension de la méthode de séquençage SOLiD. j'ai été sur le site commercial mais je n'arrive pas à bien comprendre.  [...] Le Solid utilise l'émulsion PCR pour générer les fragments ADN, puis le séquençage par ligation (utilisation de l'ADN ligase).  [...]

[Génétique] Sequençage d'ADN

Ensuite, le fluorophore est clivé et une nouvelle base est ajoutée, etc... jusqu'à avoir synthétisé tout le brin complémentaire de chaque fragment. Pour chaque paquet, tu auras une séquence de couleur. bleu-vert-jaune-jaune-rouge..., qui sera transformée en séquence nucléotidique GCTTA.  [...] Alors, il faut bien distinguer deux phases. La première phase est l'amplification des fragments, c'est le même principe qu'une PCR (les primers sont spécifiques à des adapters, séquences qui ont été ajoutées à chaque bout des fragments d'ADN). L'amplification des fragments est nécessaire pour obtenir un signal analysable (bon signal / noise ratio).  [...]

[Biotechnologie] Phenotype MicroArray Technology

Effectivement ce genre d'outil génère énormément d'information en un temps très court. (grosso modo le temps d'une PCR). Si je prends l'exemple du pyrosequencage il a fallu presque 1 an d'analyse pour près de 140 000 séquences. Par contre personnellement je pense que le cout est tout de même un facteur important bien que d'un point vue globale cette méthode ne coute pas trop cher (exemple encore du pyrosequencage quelques centimes par séquençage, mais le prix d'une seule plaque est dans les 20 000 euros).  [...] Ce que je veux dire, ce n'est pas que le sequencage nouvelle generation est une m*rd*, mais qu'il y a encore pas mal de limitations. a commencer par le cout (je ne pense pas que tous les labos puissent se le permettre), puis par la commodite ou pas de faire certaines choses (pour faire des etudes d'expression, par exemple, ce n'est pas ce qu'il y a de mieux dans beaucoup de cas).  [...]

[Biochimie] Sequençage de l'ADN

Pour en savoir plus cherche séquençage roche 454... Sinon il existe d'autres méthodes (Solid et Solexa notament) si tu es intéressé(e).  [...] Ce sont ces clones (si l'on peut dire) qui permettent de générer un spot de fluorescence qui sera détecté à chaque étape de polymération. Cette stratégie permet de séquencer en parallèle plusieurs régions de l'ADN. Ensuite, une fois tous les fragments séquencés, on reconstitue le brin d'ADN initial par informatique.  [...]

A la recherche d'un livre de Biotechnologie

La biotechnologie concerne tous les domaines de la biologie, ce que tu demandes ca revient à pouvez vous me donner le nom d'un gros livre de biologie, difficile de t'aider dans ces conditions.   [...] Il s'agit avant tout de Biotechnologies Microbiennes/Végétales et éventuellement une ouverture sur le général, par exemple des méthodes poussées de Chromatographie/Electrophorèse/PCR/Séquençage (pas celles qu'on voit en Licence) qui s'appliqueraient un peu partout (les seuls critères de spécification seraient alors assez basiques, du style eucaryote/procaryote, ADN/ARN sb/db circulaire/linéraire etc.  [...]

Un Truman Show pour de vrai... à l'échelle microscopique

Le séquençage complet de l'ADN humain, en avril 2003, a lancé la voie vers de nouvelles méthodes de soin. Grâce à la médecine génomique personnalisée, encore balbutiante, des chercheurs espèrent prévenir l'apparition de certaines maladies et mieux comprendre les mécanismes moléculaires entrant en jeu pour apporter des réponses thérapeutiques plus ciblées. Wellcome Images, Flickr, cc by nc nd 2.0.  [...] Lors du premier prélèvement, il était atteint d'un rhume. L'occasion de regarder comment un rhinovirus modifie la réponse du corps humain. Le séquençage de son ADN révèle chez lui des prédispositions au diabète. Face à l'absence d'antécédents familiaux et sa silhouette ne laissant présager d'aucun surpoids, le chercheur ne prend pas la nouvelle avec beaucoup d'inquiétude mais décide de se focaliser sur les marqueurs du diabète, comme l' insuline et les voies métaboliques du glucose.  [...]

[Génétique] Séquençage parallèle en masse / Next generation sequencing

En gros, on prend de l'ADN d'une espèce. On le fractionne, on le séquence ensuite en parallèle et les reads sont rassemblés grâce à des méthodes de bioinformatiques. Ce qui te donne finalement ta séquence d'ADN.  [...] Ben, dans mon cours de génétique, l'intitulé de la dia est exactement le titre que j'ai précisé donc... Je voulais juste qu'on m'explique cette technique mais avec des mots plus simple que le jargon employé sur les sites spécialisés.   [...]