• Santé - Mesure, Concentration, ADN

NanoDrop vs Qubit : quelles valeurs utiliser?

Dans le cadre de mon stage, je suis amené à réaliser une purification de l'ADN extrait de tissus FFPE. Suite à ma purification, j'ai réalisé une mesure de la concentration en ADN et de la teneur en contaminants au NanoDrop, ainsi qu'une mesure au Qubit afin de déterminer la concentration en ADNdb.  [...] Je ne suis pas sur de comprendre ce qu'ils entendent par DNA yield, ni l'intérêt de donner les valeurs de concentrations fournies par le NanoDrop, alors qu'ils ont réalisé une mesure au Qubit...Je pourrais comprendre que l'on fasse le rapport Qubit/NanoDrop, pour déterminer la proportion d'ADN de bonne qualité, mais ça ne semble pas être le cas.  [...]

[Biologie Moléculaire] Dilution d'ADN "contaminante"?

Sinon, au labo, pour avoir une meilleure estimation de la concentration d'ADN, on mesure l'absorbance également à 320 nm. A cette longueur d'onde l'ADN n'absorbe pas donc la valeur devrait être nulle. On fait donc la soustraction A 260 -A 320 pour obtenir la vraie absorbance à 260 nm.  [...] C'est vrai, mais les rapports 260/280 sont très peu affectés (variation de 0.01 entre mes 2 rapports A 260 /A 280 ) alors que les concentrations bougent de 408ng/µl à 550 ng/µl entre mes 2 mesures pour un même ADN.  [...]

[Biochimie] Absorbance de la molécule d'ADN

Expérimentalement, on montre qu'une solution d'ADN simple brin a une absorbance plus élevé qu'une solution de même concentration d'ADN double brin, lequel a une absorbance plus faible qu'une solution de dNTP.  [...] Ta réponse est meilleure que l'histoire du solvant. En fait, c'est juste une question de géométrie. Dans de l'ADN double-brin, les bases sont empilées et ce sont bien elles qui absorbent les UV. Si un photon recontre une base et est absorbé, cet empilement fait que la base qui est juste derrière celle qui a absorbé le photon est dans l'ombre et ne pourra donc pas être détectée, ce qui conduit à sous-estimer la concentration réelle.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mesure de pureté d'une préparation d'ADN aberrante?

J'avais pensé à une contamination par autre chose que des protéines, mais je vois mal ce qui a pu contaminer en absorbant à 260 pile, et ni à 280 ni à 320. Et surtout qu'est-ce qui peut contaminer mon ADN, à part des protéines Des restes de la lyse des hépatocytes Un truc de la solution tampon.  [...] Et enfin, encore une petite question. la mesure à 320nm ne se trouve pas dans mon cours (on y parle que de la 260 et 280). J'ai lu en cherchant sur internet que c'était pour voir s'il y avait des contaminants autres que les protéines, car ni les prots ni l'adn n'absorbent à cette longueur d'onde.  [...]

adn (titre a préciser)

Sûrement celui de la variation de la quantité d'ADN au cours du cycle cellulaire (qui n'est pas un histogramme). Est-ce celui-ci.  [...] Svp j sais pas comment envoyer une nouvelle question. j'ai une question a propos du biostatistiques en ce qui concerne le type de diagramme à faire selon le type de variance. J ss en medecine et c urgent pcq les exams approchent.   [...]

[Biologie Cellulaire] Potentiel de membrane : diffusion et électro-diffusion

Si la membrane dispose d'un canal qui laisse le libre passage à une espèce ionique, oui, à mesure que les espèces se déplacent en fonction de leur potentiel électrochimique (qui est fonction du gradient de concentration et du potentiel transmembranaire), ce dernier tend à s'atténuer, à mesure que le gradient de concentration se dissipe ou que le voltage transmembranaire tend de plus en plus vers la valeur du potentiel de l'espèce en question.  [...] A mesure que le K+ sort de la cellule, son gradient de concentration s'amoindrit, diminuant graduellement le flux net de K+ jusqu'à arriver à terme d'un équilibre. COmme je l'ai dit, dans une situation réelle, le potentiel de repos n'est absolument pas un état d'équilibre pour l'ensemble des espèces et requiert une dépense énergétique afin de préserver les gradients de concentration respectifs.  [...]

Perméabilité membranaire

On mesure l'évolution du flux initial d'ions K+ radioactifs pénétrant dans le cytoplasme des hématies en fontion du gradient de ces ions de part et d'autre de la membrane cellulaire (dans l'expérience la concentration externe est toujours supérieure à la concentration interne).  [...] je dirais que l'on mesure le flus d'ions en fonction de la différence de concentration intérieur/extérieur. Faible différence=faible gradient.  [...]

petite question

Oui on a mesuré la grandeur avant et après l'injection, en fait on la mesure en continue pendant la durée de l'expérience. Dans le cas présent on mesure la concentration de dioxygène, on utilise donc un oxymètre.  [...] Je pense qe ton prof axait la question sur que se passe-t-il quand on change de sucre Donc là, il fallait comparer les 3 courbes entre elles. Quelle est la seule chose qui varie entre les 3 courbes La nature du sucre, car on mesure toujours une concentration de dioxygène, avant et après injection d'une même enzyme au même moment.  [...]

[Biologie Cellulaire] Chromosomes homologues

Dans chaque paire l'un provient du père l'autre de la mère mais on dit que ces chromosomes sont identiques en tout point (moléculaire) or si l'un est du père et l'autre de la mère les gènes sont identique sur chacun des deux chromosomes d'une même paire mais les allèles sont différents.   [...] -Pour ce qui est de la réplication dans le cycle cellulaire elle se déroule pendant la phase S ensuite on a soit une méiose soit une mitose mais quand est-ce qu'il y a transcription et traduction.   [...]

[Microbiologie] CMI et CMB d'un antibiotique

Je crois que je fais une petite confusion au sujet de la CMB (concentration minimale bactéricide) Je n'arrive pas à savoir si c'est la concentration minimale en antibiotique qui tue 99,9% des bactéries de l'inoculat initial ou bien des survivants de l'inoculat initial après mesure de la CMI.  [...] Je ne sais pas si c'est clair, mais en gros, pour mesurer la CMB, est-ce qu'on compare à la concentration de bactéries initiales (avant toute culture et avant mesure de la CMI) ou bien après sélection du tube qui correspond à la CMI.  [...]