• Santé - Lieu, Fixation, Protéines

cellules musculaire lisse et corps dense

Bonjour à tous j'aurais voulu une petite confirmation. C'est bien par les corps denses que sont reliés les filaments de contraction d'une cellule musculaire lisse.   [...] les corps denses ou plaque d'ancrage sont bien le lieu de fixation des faisceaux de protéines contractiles. Actine - myosine. Ces corps denses sont reliés entre eux par un réseau de filaments intermédiaires, majoritairement de la desmine.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéines et membrane plasmique

-La prof nous a dit que les protéines périphériques pouvaient se lier à la bicouche par des liaisons Hydrogène, ioniques (faibles car milieu aqueux) et qu'elles développaient des interactions hydrophiles...mais est-ce pour se lier à la bicouche étonnant puisque la bicouche est constituée de lipides.  [...] Les protéines périphériques peuvent en effet être reliées covalemment à des AG comme le palmitate (palmitoylation) ou le myristate (myristoylation), pour améliorer leur fixation à la surface de la membrane. D'autres modifications post-traductionnelles comme la géranylgéranylation, la farnésylation, ou la glypiation peuvent avoir lieu dans le même but.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène Chevauchant ça veux dire quoi ?

Dans le cas d'un ARNm polycistronique, donc qui code pour plusieurs protéines, les séquences codantes ne sont là aussi pas collées les unes les autres. Il y à entre chaque des séquences dites 5'-UTR ( 5' Untranslated R egion ) et des sites 3'-UTR. Ces sites comprennent le lieu de fixation des ribosomes (la séquence Shine-Dalgarno) et un terminateur de transcription.  [...] Ce sont à proprement parler des séquences non-codantes car leur séquence ne se retrouve pas dans la séquence de la protéine. La protéine est codée à partir du point +1 de transcription, c'est à dire à environs une dizaine de paire de bases du site Shine Dalgarno et se termine quelque part dans le terminateur.  [...]

[Divers] Erythropoietine

Ensuite on m'a dit que les récepteurs à l'EPO sont des récepteurs des cytokines composés d'un domaine extra cellulaire et d'un domaine intra cellulaire qui serait JAK2 et qu'il serait le lieu de fixation des proteines de la voie de signalisation, est ce qu'il s'agit là de la transduction du signal par exemple par des protéines G ou quelque chose dans ce genre.  [...] Voilà grosso modo le principe. A noter qu'il s'agit bien là d'une voie de transduction appelée la voie JAK/STAT (dans le même genre que la voie MAPK) mais que cette voie de transduction n'est pas activée via des protéines G. Au fait j'allai oublier mais JAK 2 est bien une protéine à elle seule et en aucun cas l'un des domaines de l'EPOR.  [...]

[Biochimie] Expression protéique

Le fait que l'ARNm soit présent n'indique pas grand chose, sauf qu'effectivement ton promoteur fonctionne correctement. Il se peut que ta séquence soit mutée conduisant a un mauvais repliement et à l'élimination de la protéine avant même sa mise en fonction. As tu séquencé ta séquence d'adn.  [...] Ce que je veux dire, c'est qu'un ARN qui ne contient que la région codante de ta protéine ne donnera pas de protéine. Il faut un site de fixation du ribosome, des éléments de régulation, etc. La régulation a lieu au moment de la transcription, de la stabilité du messager mais aussi lors de la traduction.  [...]

Déplacement des proteines , acides aminé , enzyme ect ...

Là j'avoue je ne comprends pas... en fait c'est assez compliqué, et peut-être en voulant expliquer simplement on a un peu passé sur les mécanismes. L'ouverture de l'ADN est liée à la formation d'un complexe de protéines, dont font partie les enzymes qui agissent directement sur l'ADN.  [...] .. tout commence par la fixation de premières protéines qui reconnaissent spécifiquement certains bouts d'ADN. Cette fixation provient de la rencontre au hasard de ces protéines avec le motif d'ADN reconnu (la reconnaissance elle est très spécifique). Ensuite viennent se fixer d'autres protéines complémentaires des premières, jusqu'à obtenir un complexe opérationnel.  [...]

Acylation / Farnésylation / Prénylation

Acylation = modification de protéines par fixation covalente d'un ou plusieurs acides gras via une reaction d'acylation ( = formation d'un lien ester, amide ou thioe s ter).  [...] L'acylation de certains protéines G monomériques (Ras, Rho...) est indispensable à leur activité fonctionnelle. Plusieurs d'entre elles se terminent par la séquence consensus de prénylation CaaX sur laquelle est fixée le résidu d'acide gras isoprénoïde. Les inhibiteurs de la farnésyl-transférase sont utilisés en cancérologie pour bloquer la farnésylation de Ras.  [...]

Au secours la RMN va finir par m'achever...

Je suis en pleine période de révisions, exams obligent et j'ai beaucoup de mal à trouver des renseignements sur la technique RMN STD pour l'étude de la structure des protéines, qui consiste à saturer un signal pour mettre en évidence la fixation d'un ligand et sur quel site il se fixe (transfert d'irradiation et tout le blabla.  [...] Non par contre, on ne peut pas identifier le site de fixation sur la protéines. pour celà il faut passer en cristallographie par exemple.  [...]

[Biochimie] Western blot

Un facteur qui peut également jouer est la balance éthanol/SDS. Le SDS aide tes protéines à sortir du gel mais diminue leur fixation à la membrane. à l'inverse l'éthanol aide à la fixation mais empêche les protéines de sortir du gel. Tu peux donc essayer peut être d'augmenter la quantité de SDS et de baisser un peu l'éthanol.  [...] très intéressante cette discussion. Effectivement, est-ce qu'il serait possible d'avoir la référence de la publication sur l'utilisation du tampon de transfert pour les grosses protéines.  [...]

HPLC sur des protéines déjà dénaturées

J'ai déjà réalisé un test de densité (fixation de toute les protéines à une densité connue, puis on compte les protéines fluorescentes).  [...] On sépare ainsi facilement l'excès de sonde fluorescente, de la protéine marquée mais, par contre, la séparation protéine native/protéine marquée x fois est mauvaise. On détermine approximativement le taux de greffage par analyse du spectre MS déconvolué.  [...]