• Santé - Liaisons, ADN, Concentration

[Biochimie] Rupture des liaisons non spécifiques de l'ADN par une forte concentration en NaCl

Rupture des liaisons non spécifiques de l'ADN par une forte concentration en NaCl.  [...] quelqu'un pourrait-il m'expliquer pourquoi (et surtout comment...) une forte concentration en NaCl va détacher tout ce qui est non spécifique de la chromatine.  [...]

[Biologie Moléculaire] extractiobn d'ADN plasmidique

15M (ajout de 2V d'une solution SDS1%, NaOH 0.2M). Le SDS est un détergeant ionique servant à lyser les membranes et à dénaturer les protéines et les acides nucléiques (rupture des liaisons hydrogènes et des liaisons hydrophobes). NaOH, base forte, induit une augmentation du pH et dénature aussi les protéines et les acides nucléiques.  [...] La soude est ensuite neutralisée par de l'acétate de potassium (KAc) 1M en concentration finale (ajout de 1.5V d'une solution de KAc 3M.). Ceci induit la renaturation des macromolécules. L'ADN génomique et la plupart des protéines sont des molécules trop grosses pour retrouver leur conformation native et toutes ces molécules établissent des liaisons les unes avec les autres, formant un précipité blanchâtre Le plasmide étant petit il retrouve sa conformation native, est exclu du précipité et reste en solution.  [...]

Propriétés des ADN et ARN

Dans le cours des propriétés physicochimiques des acides nucléiques (ADN et ARN), on nous a dit que la basicité dénaturait l'ADN (affecte les liaisons H) bicatenaire (sans affecter les liaisons phospho diester), alors que cette même basicité hydrolysait (affecte les liaisons phosphodiester) l'ARN monocatenaire.  [...] L'ADN ne possedant pas de ribose mais un desoxyribose (présence d'un H en 2') il ne peut pas y avoir formation du composé 2'-3' cyclique par conséquent il n'y aura pas hydrolyse des liaisons 3'-5'.  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaisons Hydrophobes et ADN

Je savais pour les liaisons hydrogènes ( qui bien que faibles, étendues sur toute la longueur de l'ADN permettent son maintient ) mais pour les liaisons hydrophobes ( je ne sais pas se que c'est déjà.s ) et ensuite je comprends pas leurs intérêt.  [...] A partir de là tu n auras pas de mal a imaginer que l' ADN en particulier les bases comportent les cycles qui sont tres hydrophobes et interagissent entre eux par empilement. ce sont les interactions de stacking. Ces interactions, contrairement à ce qu on pense contribuent largement plus à la stabilité de l ADN db que les liaisons hydrogenes.  [...]

Dénaturation de l'adn en pH acides

Dénaturer l'ADN signifie qui tu sépares les deux brins. Il n'est pas question de cliver l'ADN lui même. Ce sont donc les liaisons hydrogènes qui cèdent. A confirmer.  [...] Je confirme, une dénaturation est la rupture des liaisons hydrogénes, donc separer les 2 brins d'ADN, la rupture de liaisons phosphodiester est une degradation.  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Dans un premier temps il faut bien qu'elle adhère de manière aléatoire à l'ADN par ces phosphates ( fixation non spécifique donc )ensuite qu'elle rompt les liaisons et enfin qu'elle se fixe ou pas à la séquence de paire de base. Sans compter sur le fait qu'elle doit dégager l'hisone de l'ADN si sa séquence spécifique est enroulée autour d'un octamère d'histones... Elle fait tout ça la protéine.  [...] Pour l'ADN, les interactions sont différentes selon la base considérée, suivant les différents groupements chimiques qu'elle possède. Elles peuvent toutes établir des liaisons hydogène mais le nombre de ces liaisons peut varier, et les atomes sont donneur ou accepteur d'hydrogène suivant les positions.  [...]

L'ADN fait danser ses atomes

Ce ne sont alors plus les mêmes atomes qui entrent dans la formation des liaisons hydrogène mais les atomes de la face opposée, appelée face Hoogsteen de la base. Les atomes auparavant impliqués dans une liaison hydrogène sont maintenant disponibles, multipliant les possibilités d' interaction de l'ADN avec de nouvelles molécules extérieures.  [...] Ces appariements, qui s'avèrent tout aussi stables, avaient d'ailleurs déjà été observés dans de l'ADN endommagé ou réalisant des liaisons particulières avec des protéines ou des ARN. La nouveauté est que ces appariements sont aussi observés dans des conditions normales où l'ADN n'interagit pas.  [...]

Biochimie : Pourquoi a-t'on besoin d'éthanol pour extraire le fructose du citron?

En fait l'ajout d'éthanol va changer/déséquilibrer la charge en électrolytes du mélange. Comme il y a moins de liaisons ioniques avec les phosphates de la molécules d'ADN, cela va changer la solvatation de l'ADN. S'ajoute par-dessus la polarité inférieur de la molécule d'éthanol qui modifie les liaisons hydrogènes et polaires du mélange, ce qui change encore la solvatation de l'ADN.  [...] .et dans ce cas, si les ions Na+ viennent se lier au charges négatives de l'ADN, je comprends que ce dernier ne puisse plus effectuer de liaisons hydrogènes avec le solvant.. Et donc, ça aurait pu fonctionner avec de l'eau aussi, mais puisque, comme vous le précisez, le moment dipolaire de l'éthanol est inférieur, alors l'ADN précipitera encore plus facilement dans ce solvant..c'est bien cela.  [...]

[Biochimie] extraction protéines membranaires à partir de tissu cérébral congelé (pour étude de co-IPP)

Merci Nicolas et LXR, donc quelle concentration de CHAPS est couramment utilisée Pour te répondre Nicolas, ma protéine est un récepteur neuronal au glutamate, donc assez gros (100 kDa)... L'ultra turrax peut-il aussi rompre les liaisons prot-prot, selon toi LXR Tu me conseilles quoi comme type de traitement alors.  [...] quelle concentration de CHAPS est couramment utilisée Pour te répondre Nicolas, ma protéine est un récepteur neuronal au glutamate, donc assez gros (100 kDa)... L'ultra turrax peut-il aussi rompre les liaisons prot-prot, selon toi LXR Tu me conseilles quoi comme type de traitement alors.  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaison phophodiester

Bonjour, je voudrais savoir par quelles activités (ADN Ligase, endonucléase, ADN polymerase I, réplicase...) les liaisons phosphodiesters des acides nucléiques et des acides désoxyribonucléiques peuvent-elles être formées.  [...] les liaisons phosphodiester (3'-5') sont les liaisons qui lient les nucléotides entre eux. Par conséquent elles vont être formées dans toutes les réactions où se déroulent ce phénomène. réplication de l'ADN, transcription de l'ARN, etc.  [...]