• Santé - Liaison, Protéine, ADN

L'influence de l'environnement sur le phénotype : besoin de conseils de méthode !

- Si le milieu est uniquement constitué de glucose, alors la bactérie consomme cette substance et la transcription du gène lacZ correspondant à la protéine impliquées dans le métabolisme du lactose est très faible.  [...] La liaison qui lie la protéine CAP avec l'ADN entraîne une déformation de la molécule d'ADN ( on observe une courbure de 80° ). Cette dernière favorise la fixation de l'ADN polymérase et donc la transcription du gène lac. Cette transcription va entrainer cette même action sur les gènes lacY et lacA de la protéine.  [...]

[Biologie Cellulaire] technique de retard sur gel et immunoprécipitation de chromatine

Le ChiP permet de déterminer la séquence d'ADN avec laquelle une protéine ou complexe protéique connu intéragit. C'est de l'IP sauf que là avec l'anticorps on fait tomber une protéine (d'ou la nécessité de connaitre son identité) qui intéragit avec, entre autre, des bouts de chromatine (préalablement digéré).  [...] Je peux te detailler le protocole mais ce que tu dois retenir c'est qu'a la fin avec la chip on obtient carrément le fragment d'adn sur lequel la protéine s'est fixé. donc non seulement il y a eu interaction mais on peut aller plus loin en t'informant précisément du site de liaison de la protéine a l'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 13

L'indication qu'elle porte le nom d'un protéine de drosophile dont elle n'est pas l'homologue (mais on l'a cru un moment, d'où le nom) est importante. On la perçoit comme une sorte de lien entre l'ADN pol et l'hélicase.  [...] si c'est pas le clamp (pcna) si c'est pas la topoisomérase et qu'elle fait le lien entre la ADN pol et l'hélicase yen en a pas 36...je vote aussi pour le protéine de liaison à l'ADN simpl brin.  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaison spécifique d'un protéine à l'ADN

Imaginons maintenant deux sites de liaison identiques en séquence pour une DNA binding proteines Y sauf qu'un site est enrichie en histone X crutant éfficacement la proteine Z.  [...] Conclusion. Oui, la proteine pouvait potentiellement lier les deux sequences mais l'éfficacité de liaison est ici régulé. La proteine se fixe donc là et pas là.  [...]

[Génétique] Programme génétique et cellules

J'ai souligné une partie de ton propos qui est erronée. attention, dire que des domaines protéiques se lient à des domaines d'ADN par complémentarité signifie que tu as une liaison entre une base azotée contenue dans un nucléotide et un acide aminé provenant d'une protéine à la manière dont cela est possible entre les bases azotées au sein de l'ADN.  [...] Je cite. Il ne faut pas perdre de vue le fait que les protéines ayant des domaines de liaison à l'ADN reconnaissent une forme. Donc, c'est une forme qui a été favorable et qui s'est maintenue.  [...]

[Biochimie] Mécanisme de réplication de l'ADN

pour que l'adn puisse se repliquer,il faut que les deux brins soient separes,la double helice est ouverte par helicase et des proteine ssb.liaison.,maintiennent l'helice deroule.  [...] la fourche de repliction est initiee pr des proteines d'initiation qui se fixent sur une sequence particuliaire ri v..l'adn helicase se lie ensuite a ce complex et ouvre la molecule d'adn.  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

je ne vois pas la différence entre les 2 on peut dire liaison sans parler de liaison covalente, mais par exemple de liaison faible (interaction est plus approprié) entre deux acides aminés distants qui induit un repliement de la protéine.  [...] A priori, s'il y a renaturation que de cette partie là, la protéine pourra lier l'ADN dans le cas où il n'y a pas d'encombrement stérique au niveau de la liaison.  [...]

La recombinaison des chromosomes : un jeu de l'amour et du hasard sous contrôle ?

L'originalité des travaux publiés aujourd'hui est que, cette fois, les chercheurs ont artificiellement associé à Spo11 un véhicule qui l'emmène casser les chromosomes et stimuler la recombinaison, même dans les régions dites froides. Il s'agit d`une partie de Gal4, protéine qui se lie normalement à des séquences spécifiques de l'ADN pour enclencher l'expression de gènes.  [...] Le tandem chimérique Gal4-Spo11stimule la formation de cassures chromosomiques près de tous les sites naturels de liaison de Gal4 à l`ADN. De plus, bien que d'autres protéines soient habituellement requises pour la formation de cassures chromosomiques, l`ajout de ce tandem dans la cellule méiotique s'est révélé ici suffisant et ne perturbe en aucun cas les événements naturels déclenchés par la protéine Spo11 seule.  [...]

[Biologie Cellulaire] Contrôle de l'apoptose : rôle de NFkB ???

Je suis en train d'étudier des ensembles expérimentaux sur l'apoptose et son contrôle. je n'ai pas très bien saisi le rôle de NFkB (Nuclear Factor kappa B). je sais qu'il y a tanslocation dans le noyau après phosphorylation de l'inhibiteur Ikb par le TNF, puis fixation sur un promoteur de l'ADN après une seconde phosphorylation, où il augmente considérablement la transcription (après liaison avec une protéine p330) de ce gène.  [...] j'avais globalement ce genre de situation, et en fait on nous proposait deux études. l'une ou NFkB semblait moduler l'apoptose, après activation par le TNF, comme dans ton exemple.   [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 4

Alors je suis une protéine bactérienne, faisant partie d'une grande famille dans laquelle on a toutes un prénom en une lettre. La première de ma lignée a été identifiée chez E. coli, et pèse à peu près 7 kDa. Certaines des molécules de ma famille possède un DNA binding domain.  [...] Les molécules de cette famille les plus exprimées possèdent un ou plusieurs sites de liaison aux acides nucléiques (ARN et ADN) appelés RNP1 et RNP2. De plus les proteines eucaryotes Y-box, y compris la protéine humaine YB-1 possèdent un pourcentage d'identité de 40% avec la représentante principale de notre famille.  [...]