• Santé - Interactions, Structures, Protéines

structure prédictive de protéine et interaction ... tout un programme!!!

La structure 3D c'est une étape qui arrive bien après, et puis il faut avoir les compétences d'un structuraliste (que tu as peut-être...) pour voir si deux structures peuvent s'associer, c'est pas facile à voir. Mais apparemment tu ne sais pas si les structures cristallo sont disponibles pour ces deux protéines, et on en est pas encore à faire des prédictions d'interactions à base de structures prédictives de protéines ( ).  [...] Si il s'avère que tu as bien affaire à une interaction extrêmement solide, ça peut parfaitement avoir un sens biologique. Le fait qu'elles soient localisées différemment dans la cellule peut être un mécanisme de régulation. Sous l'effet d'un stimulus, une des deux protéines est transportée vers l'autre, le complexe se forme et celui-ci possède une activité que les protéines séparés n'ont pas.  [...]

[Biologie Moléculaire] repliement de molécules

Déjà, il faut savoir de quelles molécules tu parles. Tu peux prendre les protéines. il existe des interactions entre les acides aminés qui leur donne des structures particulières (des schémas classiques en hélice et en feuillet (structures II) et des formes plus complexes faisant intervenir les radicaux des acides aminés (structures III et/ou IV)).  [...] Il y a un livre très bien fait, très didactique. Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis, David W. Mount, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2004. Le chapitre 8 parle de prédiction de structures secondaires pour l'ARN, le chapitre 10 - pour les protéines.  [...]

[Biochimie] Précipitation des protéines

Le NaCl aura comme effet d'abaisser les forces ioniques entre les structures des protéines. Plus tu augmente le taux en NaCl, plus tu vas fragiliser les liaisons faibles (où le NaCl va prendre sa place dù aux interactions ioniques) et donc tu vas dénaturer ta protéine et elle va perdre de sa solubilité donc précipité.  [...] Le nitrate d'argent est aussi utilisé pour doser les protéines (réduction de l'argent par les chaines latérales où on pourra fixer des antigènes dessus d'après ce que j'ai trouvé aussi).  [...]

L'ADN fait danser ses atomes

Les biochimistes, quant à eux, s'intéressent davantage à sa structure, qui permet à l'ADN toutes ses interactions avec d'autres molécules biologiques. les protéines et les ARN, dont les interactions sont nécessaires à la vie.  [...] Ces appariements, qui s'avèrent tout aussi stables, avaient d'ailleurs déjà été observés dans de l'ADN endommagé ou réalisant des liaisons particulières avec des protéines ou des ARN. La nouveauté est que ces appariements sont aussi observés dans des conditions normales où l'ADN n'interagit pas.  [...]

Définition | Renaturation - Renaturer - Renaturé | Futura Santé

La renaturation d'une protéine est le pendant du phénomène de dénaturation. lorsque le milieu contenant une protéine retourne à ses conditions normales (pH, température, etc.), la protéine dénaturée peut reprendre sa conformation initiale.  [...] En effet, dans ces conditions, les interactions entre les molécules de la protéine se rétablissent et les chaînes polypeptidiques reprennent spontanément leurs structures tridimensionnelles (structure secondaire et tertiaire).  [...]

biologie cellulaire

Pas dans la synthèse des protéines, mais dans la structure des protéines. Comme toutes les protéines se replient dans l'espace les aa. hydrophobes vont, globalement, se retrouver au centre de la pelote s'il s'agit d'une protéine globulaire car c'est la régions où les interactions avec les molécules d'eau sont minimum.  [...] Dans le cas particulier des protéines partiellement insérée dans la membrane la disposition est différente car ce sont ces aa. hydrophobes qui vont permettre l'insertion en interagissant avec les lipides membranaires (interactions dites hydrophobes).  [...]

virus et icosaèdre

*est-ce que la forme des capsides est due à des interactions spécifiques (entre protéines, liaisons chimiques,...) qui donnent des angles remarquables et donc des formes tels l'icosaèdre.  [...] Ce sont des intéractions d'énergie faible (structure quaternaire des protéines virales de la capside).  [...]

[Microbiologie] La résistance aux antibiotiques?

Ces protéines sont, pour certaines, homologues à des protéines du cytosquellette et, pour la plupart membranaires. Toutes ces protéines sont recrutées au site de division lors de la septation. Il n'y a que peu de données biochimiques et structurales sur ces molécules, et sur leurs interactions.  [...] Des questions fondamentales quant aux processus de division restent ouvertes. comment ces protéines sont-elles recrutées au site de division dans quel ordre Forment-elles un ou plusieurs complexes stables Quel est le rôle de chacune d'entre-elle Comment sont coordonnées la constriction de la membrane et la synthèse de la paroi au site de division Peut-on interférer avec la division en perturbant la fonction ou les interactions entre ces protéines.  [...]

A l'origine du cerveau : les éponges de mer !

Les voies de l'évolution sont décidément étonnantes. On imagine la stupéfaction d'un groupe de chercheurs de l'Université de Santa Barbara en Californie lorsqu'ils ont découvert que le génome des éponges de mer possédait un nombre important de composantes en commun avec celles intervenant dans le fonctionnement des synapses humaines.   [...] La seconde surprise, bien plus étonnante, est que la structure des protéines des éponges suggère de probables interactions entre elles, très similaires à celles qui se produisent dans les protéines intervenant au niveau des synapses humaines et même celles des souris.  [...]

pourquoi les protéines dénaturée sont dégradées

et ce repliement est essentiel au fonctionnement de la protéine. Il y a un système de contrôle qui vérifie le bon repliement de la protéine glycosylée. Si elle est mal repliée, le système de contrôle empêche son adressage aux structures suivantes (je vais pas détailler).  [...] L'adoption de la structure fonctionnelle d'une protéine nécessite l'intervention d'autres protéines, dites chaperonnes. Sans parler de coagulation, une protéine dénaturée par rupture des interactions faibles ne pourra, de toute façon, adopter instantanément sa conformation initiale.  [...]