• Santé - Informations, Structure, Protéine

[Biochimie] Carte de Ramachandran

J'aimerai savoir comment analyser une carte de Ramachandran.   [...] C'est à dire quelles en sont les informations que je peux en tirer sur la structure d'une protéine.  [...]

[Biochimie] conversion fasta/PDB

juste pour preciser. Vous ne pouvez pas convertir un fichier fasta en fichier pdb. Les informations ne sont pas du tout les mêmes. Le fichier fasta vous donne pour chaque identifiant une séquence linéaire de nucléotides ou d'AA. Les fichiers pdb renseignent essentiellement, pour une protéine donnée, sur la position de chaque atome dans la structure de cette protéine.  [...] Si vous avez juste la séquence et pas l'identifiant du gène/de la protéine en question, vous pouvez faire une recherche avancée sur le site de la PDB ( http.//www.rcsb.org/pdb/search/advSearch.do ) en copiant la séquence dans le champ adéquat. Un blast ira chercher les fichiers PDB qui correspondent à votre séquence.  [...]

[Biochimie] Protéine hydrophile ou hydrophobe ?

Disposes tu d'informations sur la structure tertiaire de ta protéine connais tu sa localisation dans la cellule ou dans l'organisme quelle est cette protéine.  [...] Je connais les structures secondaires et tertiaire aussi mais... je ne vois pas non plus quoi en déduire. la structure tertiaire t'aide énormément, ici on voit que l'on a a faire a une protéine globulaire donc très certainement hydrophile en surface et hydrophobe en son coeur.  [...]

[débat] Point de vue des biologistes : la vie, une structure dissipative ? - Page 3

Le concept de finalité apparaît alors comme une vue tronquée et subjective sur les boucles de rétroactions qui permettent aux organismes vivants de préserver et enrichir leur information-structure ou néguentropie. Du physique au sociologique en passant pas le biologique.  [...] -Autrement dit un processus de sélection naturelle va agir sur le long terme pour ne laisser subsister que les boules blanches qui préservent leur informations structure plus longtemps.  [...]

L'origine absolue du code génétique

c'est celui des ateliers d'Airbus. On ne peut, pour justifier de telles invraisemblances, invoquer gratuitement que les molécules impliquées possédaient une individualité et une intelligence d'ingénieur afin de créer la première cellule. L'architecture hautement intelligente de la cellule(structure, stockage d'informations, exploitation des informations, système enzymatique, concept de transcription, de traduction, etc.  [...] L'architecture hautement intelligente de la cellule(structure, stockage d'informations, exploitation des informations, système enzymatique, concept de transcription, de traduction, etc.) est porteur d'intentionnalité et d'intellectualité.  [...]

levure s. POMBE

la molécule d'ADN composite obtenue (vecteur + gène d'intérêt) est ensuite introduite dans une cellule hôte(levure S. Pombe PK90b), qui exécute les instructions qui lui sont fournies par le gène d'intérêt, et réalise les modifications post-traductionnelles dans l'objectif de fabriquer la protéine recherchée(l'hormone peptidique ).  [...] Sauf qu'a mon avis avoir la sequence de la proteine est totalement inutile dans ce cas precis. De plus avec les informations données dans le texte il est impossible de savoir de quelle proteine on parle (en plus rien ne dit que ca n'est pas un expl fictif juste pour les besoins de l'exercice).  [...]

Petite énigme à vous soumettre...

Le premier test va donc être un traitement informatique pour supprimer les doublons parmi les 20.000 structures, et sélectionner les molécules susceptibles de se lier à la protéine. Il existe des programmes informatiques permettant ce genre de travail.  [...] Le coût, j'en conviens, est important, car la méthode demande des concentrations de ligand importantes (ratio de 1 protéine pour 300 ligands par exemple...). mais elle est utilisée. Si la méthode RMN te rebute, et que tu préfères des techniques plus simples de caractérisation de Kd et de Ki (par des tests in vitro ), j'ai envie de dire que ces tests restent insatisfaisants, car ne reflètant pas d'informations très poussées sur l'intéraction protéine-ligand, comme une cartographie des groupements mis en jeu dans le ligand, par exemple.  [...]

maladie de crohn que faire?

On ne pas confirmer ce que vous avez par internet. Il faut faire confiance à votre médecin traitant. Le médecin est aussi la meilleure personne à qui poser toutes vos questions.   [...] Dirige toi plutot vers ce type de structure car lire des informations sur internet n'est pas forcément la meilleure solution et il existe beaucoup de fausses informations sur cette maladie.  [...]

Western Blot et coomassie

Avec le bleu on a deux informations. la taille et la quantité. Par contre si vous avez un problème technique qui fait que vous produisez une protéine de taille identique a celle attendue mais pas celle attendue, vous ne le saurez jamais.  [...] Le western blot utilise pour révéler la protéine des anticorps spécifiques. On a donc deux (meme trois) informations. la taille, la quantité et la qualité. si vous détectez votre protéine vous êtes sur que c'est bien elle, pas d'usurpation possible. C'est une information de spécificité.  [...]

Antiseptiques, désinfectants

Concernant l'eau distillée elle n'a (théoriquement) pas de minéraux et est composée (de molécule H2O, ions H3O+ et HO- seulement) contrairement à l'eau du robinet... ce qui limite significativement les réactions possible et donc supprime la précipitation (dans la majrité des cas).   [...] Il s'agit d'un détergent ionique assez puissant et qui attaque en profondeur. C'est un très bon désinfectant (qui détruit les membranes des bactéries) nous en utilisons souvent au laboratoire.   [...]