• Santé - Hybrides, ADN, ARN

ADN-Cytosol

Chez les procaryotes l'ADN se balade dans la cellule puisqu'il n'y a pas de noyau, on a aussi les plasmides chez les bactéries (ADN qui codent pour des fonctions souvent non-vitales pour l'individu mais qui apportent des avantages sélectifs à l'hôte).  [...] D'ailleurs, si je me souviens bien, il y a des protéines cellulaire qui patrouille dans le cytosol pour détecter tout ADN (et le détruire) ainsi que les hybrides ADN/ARN.  [...]

formes A et Z de l'ADN

D'après ce que j'ai pu voir en cours (2008) l'ADN de type A est obtenu par déshydratation d'une hélice de type B. Cette structure n'a été observée que in vitro mais ce ne serait pas seulement un artefact. On la retrouverait dans le site actif de l'ADN polymérase, certaines spores bactériennes et des structures hybrides ADN/ARN.  [...] Pour ce qui est de l'ADN de type Z, des régions d'ADN-Z ont été mises en évidences grâce à des anticorps spécifiques (John Jackson & Inman. Gene 1989 84 221-226. ). Ce sont probablement des zones de transcription active, au passage de l'ARN polymérase l'ADN passerait d'une structure de type B à une structure de type Z.  [...]

[Biochimie] Nucléase S1

il est question en effet de nucléase S1, je me suis renseigné il est dit que cette enzyme dégrade les acides nucléiques simples brin, mais qu'elle ne peut pas détruire les hybrides ADN-ARN.  [...] Selon moi, le S1 mapping commencerait par le marquage d'une sonde d'ADN, puis on dénature pour n'avoir qu'un seul brin d'ADN, et ensuite on va l'hybrider avec une séquence d'ARNm en 5' de celle-ci, puis on utilise la nucléase S1, afin de couper les parties qui ne se sont pas hybridées.  [...]

[Biologie Moléculaire] Adn...

Apres dans ton texte on parle d'un appariment ADN-ARN, ca ne pose pas de soucis, parce que c'est un ARN complémentaire de l'ADN. Il y a juste une base qui change (se qui est assez faible par rapport à toutes les bases identique). Et les morceau d'introns non présents dans l'ARN, ne sont pas génant, car l'ADN restera simple brin à cet endroit et formera des boucles.  [...] Les hybridations ADN-ADN étaient une technique qui faisaient fureur dans les années 70-80 pour distinguer les espèces bactériennes. On prenait l'ADN de 2 bactéries et on essayait d'apparier les brins ensemble pour voir si elles étaient de la même espèce ou non, et si l'hybridation était imparfaite on étudiat les différences selon leur % d'hybridation.  [...]

Qcu

L adn chromosomal et l arn ribosomial 23s d'E.Coli ont comme poids moléculaire respectivement 2,2 109 et 1,1 106. Approximativement 0,3% de l Adn total sont hybrides avec cet Arn 23s. Donner le nombre de copies de gene de l Arn 23s que contient l adn d'E coli.  [...] Ok, donc premierement j ai remarqué que le poids moléculaire de l adn et de l arn sont tres proches. Donc ils aurons presque la meme longeur, et si j bien compris les arn vont se coller sur leurs sequences complémentaires ds l adn, mais quand j ai calculé le nombre de nucleotides de l adn j trouvé 36, et 35, donc je sais que j ai pas bien interprété le xercice, c est pour cela que j ai besoin de votre aide.  [...]

[Biologie Moléculaire] Technique d'hybridation

Tu as ton ARN, tu lui hybrides une amorce ADN (qui peut-être une sonde marquée visualisable sur Northern Blot) et à l'aide d'une ADN polymérase ARN dépendante, tu produis un ADN complémentaire de cet ARN. Donc oui tu peux appeler ça une réaction de transcription inverse je pense.  [...] Je pense qu'il pourrait s'agir de la transcription inverse cependant un détail m'intrigue. l'hybridation de la sonde d'ADN monocaténaire sur des ARNm séparés par électrophorèse. La transcription inverse s'effectue dans un tube sans que les ARN aient été séparés auparavant.  [...]

[Biologie Moléculaire] Que devient l'ARNr dans une reaction de RT

Effectivement, je n'ai pas utilisé de RNAse, ma transcriptase reverse a une petite activité RNase H (élimine les ARN des Hybrides ARN.ADN), j'utilise des oligo DT pour que ma RT soit spécifique des ARNm...alors dans mon tube de RT j'ai de l'ARN total, donc quand je depose moin cDNA sur puce, j'ai de L'ARNt, l'ARNr l'ARNm et du cDNA...alors ou sont passés mes ARNr.  [...] 1/ concernant l'échelle. effectivement j'ai une échelle différente sur mes graphes. pour l'ARN je vais jusqu'à 30 fu (unité de fluorescence) pour mes cDNA à 3 mais si je vois mon ARNr à 30 Fu je devrais le voir d'avantage à 3 Fu sauf si il a été dégradé, étant donné que pour une efficacité de 100% de ma RT, 1 brin d'ARNm est transformé en ADNc, je devrais avoir dans tous les cas, toujours moins d'ADNc que d'ARNr (80% environ des ARN).  [...]

[Biologie Moléculaire] Différence RNase A / RNase H

Est-ce que vous pouvez m'expliquer la différence entre la RNase A et la RNase H Si j'ai un peu compris la première est plus thermorésistante et les deux sont utilisées pour détruire l'ARN dans les hybrides ARN-ADN.  [...] La RNAse A est une enzyme qui va te dégrader tout les ARN présent dans ta solution. La RNAse H est une enzyme qui va spécifiquement dégrader l'ARN lorsque ce dernier est en duplex avec un brin d'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Le TNA la molécule ancestrale?

Vous oubliez qu'il y a une justification théorique à rechercher un support de l'hérédité plus simple que nos acides nucléïques actuel. on arrive pas à synthétiser chimiquement les bases de l'ADN/ARN et il est difficile de les polymériser sans catalyse enzymatique dans des conditions jugée prébiotiques.  [...] On a proposé pas mal d'alternative à l'ADN/ARN, comme le TNA ou d'autre composé aussi complexe comme des isomères de l'ARN plus facile à fabriquer (par ex. en substituant le ribose par d'autre sucre). A l'époque où le monde des protéines était à la mode dans la communauté scientifique, on a même imaginé des structures hybrides avec un squellette composé d'acide aminé où venait se greffer les bases (PNA pour peptid nucleic acid). Donc plus complexe que l'ARN/ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Hybridation ADNdb - ARNm

D'après ce que j'ai lu il est possible d'avoir hybridation ARN-ADN(matrice) entre les bases correspondantes aux exons, les introns se retrouvant en forme de boucles non hybridées à l'ARN.  [...] Oui, je vois ce que tu veux dire. Une situation où tous les introns sont hybridés au brin complémentaire d'ADN tandis que les exons sont hybridés à l'ARN.  [...]