• Santé - Hybridation, Sonde, Fragment, Enzyme, Restriction

[Biologie Moléculaire] test de paternité

Mes cours de biologie moléculaire sur le sujet étant enfouis dans les tréfonds de mon cerveau, quelqu'un pourrait-il me rappeler la différence (s'il y en a une) entre micro et minisatellite.   [...] Bonsoir. Si hybridation avec la sonde se fait avec fragment clivée par l'enzyme de restriction, au moment de la détection, la position des traits indiquera que le père ou la mère ( selon le brin avec lequel la sonde s'est hybridé) à donné ce chromosome a l'enfant.  [...]

[Génétique] Dm sur la myopathie de Duchenne

2) les bandes ne sont pas le chromosome X mais un fragment du gène considéré. Les 2 allèles ont des séquences différentes, donc les enzymes de restriction coupent en des endroits différents, donc les fragments obtenus n'ont pas la même taille.  [...] Tu dois parler de fragments et non d'allèles (les enzymes de restriction ne reconnaissent pas les allèles, elles coupent en un endroit précis de la molécule d'ADN quand elles reconnaissent une petite séquence spécifique de désoxynucléotides, chaque enzyme ayant sa propre séquence).  [...]

[Biologie Moléculaire] Rflp

La technique southern, tu recherche une séquence spécifique, tu utilise une sonde complémentaire (marquée), si tu as ta sequence dans le fragment que tu possède, il y aura hybridation de la sonde.  [...] D'accord merci donc si je comprend bien la technique du southern blot ne demande pas forcément de cliver les brins par une enzyme de restriction. La sonde peut hybrider directement les brins d'adn dans ce cas.  [...]

[Génétique] SMEAR qui es tu??

sin0n j'ai une autre question concernant la technique d'hybridation est qu'il faut tjs utiliser une sonde pour trouver le fragment que l'on cherche.  [...] En biologie moléculaire, le terme smear désigne la multitude de bandes observées sur gel d'agarose lorsque par exemple ton ARN est très dégradé, un ADN génomique a été digéré par une enzyme à forte fréquence de coupure, que ta PCR est vraiment très foireuse, etc.  [...]

[Microbiologie] Hybridation

Coucou tous le monde, au fait je vais faire de l'hybridation avec une sonde 16s et une sonde d'un gene de résistance,pour voir si le gene est chromosomique ou non, (puisque le 16s est du chromosome),pour la digestion donc j'ai utilisé l'enzyme. Iceu-1 (qui coupe l'adn) mais lors de la migration.  [...] Homing endonucleases do not have stringently-defined recognition sequences in the way that restriction enzymes do. That is, single base changes do not abolish cleavage but reduce its efficiency to variable extents. The precise boundary of required bases is generally not known.  [...]

[Microbiologie] hybridation moléculaire

je veux savoir également comment je pourrais discuté les résultats de cette hybridation moléculaire (ADN-ADN)afin de montrer la localisation chromosomique de gene de resistance bla lut.(la figure ci-joint).la premiere photo c'est un profil électrophorèse en champ pulsé (PFGE) de l'ADN de la souche Pseudomonas luteola digeré avec l'enzyme I-CeuI.  [...] la photo B,c'est l'hybridation des fragments avec une sonde spécifique d'un gène de résistance,et la photo C c'est l'hybridation avec une sonde 16s.les rèsultats de cette analyse a montrè que la sonde bla lut,specifique de gene a été hybridé avec un fragment de taille entre 700kb-800kb et il a hybridé aussi avec la sonde 16s,et pourcela les resultats suggere que le gene est chromosomique.  [...]

[Biologie Moléculaire] absence d'hybridation southern : interpretation?

Sinon a moins d'un probleme purement technique je ne vois pas pourquoi ta sonde s'hybride pas. Mais peut etre qu'en précisant un peu le but exact du tp on aurait plus de piste.  [...] - typiquement l'absence de signal pourrait indiquer qu'il y a eut un rearrangement chromosomique et que la partie correspondante a ta sonde a disparu. Ou plus simplement une délétion de la région concernée.  [...]

[Génétique] marche sur chromosome

On utilise donc des banques d'ADN. La banque d'ADN, c'est de l'ADN double brin digéré en fragments irréguliers par une enzyme de restriction. Mais les fragments sont mélangés, ils ne sont plus dans l'ordre initial.  [...] En pratique, tu sais quelle est la couleur du marqueur des bords. On cherche donc à faire apparaître un site, par hybridation (et reconnaissance par fluorescence par exemple). Si ce site n'a pas été coupé par une enzyme de restriction, il doit apparaître 10 fois (puisque tu as 10 banques).  [...]

Expériences en génétique…

Piwi parlait probablement des tecnhiques de northern ou southern blot, qui te permet d'identifier un fragment contenant ton gel d'interet apres hybridation de la sonde radioactive.  [...] J'ai donc un peu repondu de travers à la question en expliquant comment recuperer un gène introduit dans une bactérie grace à un plasmide. Dans ce cas là, comme on connait le plasmide, il n'y a pas à chercher à identifier le gène. On connait la taille du fragment de restriction, c'est tres simple.  [...]

[Biologie Moléculaire] hybridation moléculaire

ou chromosome) dans le génome des souches d'une bacterie enterique l'ADN des souches a été digéré avec l'enzyme I-CeuI, et une électrophorèse en champ pulsé a été lieu(figure A) ensuite une hybridation avec une sonde marquée spécifique du gène bal1(figure B ) et une sonde du gène de l'ARN ribosomal 16S (figure C).  [...] je veux faire une interprétation des résultats des deux hybridation pour les 5 souche(P1,P2...) (pour la souche LT2 et BD sont des souche de reference).  [...]