• Santé - Groupement, Phosphate, Extrémités

Endonucléases et liaisons de l'ADN

Pour l'instant, j'ai trouvé quel type d'enzyme coupait l'adn (l'endonucléase, qui appartient à la famille des hydrolases) ainsi que la localisation de la coupure sur l'ADN (au niveau des liaisons phosphodiester situées entre le groupement phosphate et les carbones aux extrémités du désoxyribose).  [...] Du coup je voulais savoir si ce que j'avais trouvé était juste et, si oui, comment une endo-nucléase pouvait annuler l'estérisation.   [...]

[Biochimie] nucléase

Si tu coupes avec deux enzymes différentes, les extrémités générées ne seront pas complémentaires l'une à l'autre puisque les enzymes vont couper différemment (le site de restriction n'est pas le même et le type de coupure non plus).  [...] Le moyen couramment utilisé en labo est de virer le groupement phosphate des extrémités 5' générées après coupure. Pourquoi ne voudrais-tu pas que ça se réassocie. exemple, tu veux exprimer une protéine dans une bactérie pour l'étudier. tu insères le gène codant pour ta protéine dans un plasmide d'expression bactérien qui contient donc une cassette de clonage.  [...]

Manipulation des acides nucléiques

Enfin, la polynucléotide kinase est une enzyme capable de phosphoryler des extrémités 5' libres, ou préalablement déphosphorylées via l'action d'une phosphatase.  [...] Tu sais que les kinases permettent de fixer un groupement phosphate en présence d' ATP = A dénosine T ri P hosphate = pppA. Dans cette molécule d'ATP* (*. signifiant radioactif), le phosphate pris et ajouté en 5'OH est celui situé en position gamma (position la plus externe) de la molécule d'ATP*.  [...]

ADN brin codant????

Tu veux une reproduction d'une photo, donc la photo est le brin codant (identique à ce que tu veux obtenir) mais tu ne peux pas obtenir la reproduction directement à paritr de cette photo, c'est le brin non transcrit. Pour reproduire la photo, il faut transcrire le négatif (brin transcrit = brin non codant).   [...] Le brin codant est effectivement 5'-3', même in vivo. (Si tu as un OH à l'extrémité = 3'. Groupement phosphate = 5'.).  [...]

Extrémités 3' et 5'

Une extrémité contenant le groupement phosphate avec deux fonctions acides libres. c'est l'extrémité 5'P, et une seconde extrémité contenant un OH libre en 3', sur l'ose. c'est l'extrémité 3'OH. Pour simplifier on écrit 5' et 3'.  [...] Et puis je pense qu'Il ne faut pas trop mélanger les choses, on est d'accord, aussi bien la réplication et la traduction se font dans le même sens, et c'est bien ce même sens dans lequel le ribosome va avancer sur le ARNm, ce sens pour le matérialisé. il correspond au sens allons de l'extrémité contenant un groupement phosphate avec deux fonction acides libres, vers une extrémité contenant un OH libre en 3' sur l'ose.  [...]

sens de la croissance d'ADN et d'ARN

J'aimerais savoir pourquoi la polymérisation d'ADN (et ARN) se fait à l'extrémité 3' plutôt que 5'. Est-ce que c'est parce qu'à 3' on trouve le groupement hydroxyle et comme la polymérisation se fait par condensation (déshydratation) bah ça peut pas se faire du côté de phosphate 5' A pH = 7 le phosphate est déprotonné.  [...]

[Biochimie] ADN: pKa du groupement phosphate, acidité etc.

Deuxième question. N'oublie pas que dans l'ADN deux fonction -OH du phosphate font une liaison ester (neutre) avec les sucres. Donc au final on a qu'une seul charge négative dans notre polynucléotide sauf au niveau des extrémités ou on a deux charges négatives.  [...] et la libération des protons des groupements phosphates induit des charges négatives dans les acides nucléiques.  [...]

[Biologie Moléculaire] Extrémité 3' et 5'

Ainsi tu vois bien que pour un nucléotide donné,le nucléotide précédent est fixé au carbone 3 et le suivant se fixe au groupement phosphate du carbone 5.  [...] Donc le premier nucléotide de la séquence n'aura pas de nucléotide précédent ainsi son groupement phosphate du carbone 5 ne sera pas relié au carbone 3 d'un autre nucléotide ainsi on le nomme l'extremité 5' et inversement le nucléotide ayant le carbone 3 non engagé dans une liaison ester avec un autre nucléotide sera l'extremité 3'.  [...]

[Biologie Cellulaire] Les différentes hydrolyses de l'ATP

D'accord, merci. Et la kinase produit aussi de l'ADP aussi non Vu qu'elle enlève un groupement phosphate pour le transférer ailleurs.  [...] Les kinases en produisent dans le sens où le phosphate quitte l'ATP mais leur but n'est pas la synthèse d'ADP mais le transfert d'un groupement phosphate sur une autre molécule.  [...]

[Biologie Cellulaire] Arn

- Les nucléotides constituant l'ARN (et l'ADN) portent un groupement phosphate qui est chargé positivement et qui permet, pendant une électrophorèse, la migration vers le pôle chargé positivement de la cuve (donc la cathode..).  [...] je ne veux pas dire de bêtise mais il me semble que l'anode attire les anions et qu'elle est donc chargé positivement. Et inversement pour la cathode. Les ARN chargés négativement (groupement phosphate) migrent donc tout naturellement vers l'anode.  [...]