• Santé - Glucides, Acides aminés, Configuration

Origine de la vie : l'apparition des premiers glucides se clarifie

L'équipe de Paul Clarke, de l'université de York, a recréé un procédé qui aurait pu donner naissance aux premiers glucides (les sucres) dans le monde prébiotique. Les réactions sont complexes mais il apparaît que la synthèse de glucides biologiques serait liée à la présence d' acides aminés présentant une configuration particulière.  [...] Ce diagramme résume la principale découverte faite en essayant d'expliquer l'origine des sucres sur Terre. Les esters d'acides aminés (de configuration L) catalysent la formation d'énantiomères (des molécules isomères qui sont l'image l'une de l'autre) de configuration D.  [...]

Bientôt de nouveaux antibiotiques grâce à la découverte d'enzymes bactériennes ?

Appelée épimérisation, cette transformation enzymatique entraîne le changement de configuration de certains acides aminés de la configuration L (configuration normale au sein des peptides ) vers la configuration D, qui est en principe inactive. Les chercheurs ont découvert comment cette enzyme fonctionne.  [...] Elle arrache un atome d' hydrogène au carbone alpha (le premier) des acides aminés pour en donner un nouveau. Il s'agit d'un mécanisme inédit dans le vivant.  [...]

preuve d'1 vie extraterrestre

En quoi la découverte ds une météorite d'acides aminés chiraux, ts de configuration D, serait la preuve d'1 vie extraterrestre.  [...] Les acides aminés utilisés dans les protéines par les organismes sont dans leur quasi-totalité sous la forme L-aa. les D-aa sont utilisés plus rarement, comme chez les bactéries lors de la synthèse de la paroi (D-Alanine par exemple) ou peuvent être détectés chez les Mammifères (D-Asp dans le cerveau par exemple).  [...]

[Biochimie] Transamination et desamination

je ne comprend pas pourquoi certains acides aminés sont transaminés tandis que d'autres sont désaminés c'est à cause de leur configuration.  [...] Euh... non je n'ai toujours pas compris. Pour les AA qui peuvent être désaminés ou trans aminés c'est en fonction de la disponibilité en aminotransférase et/ ou en phosphate de pyrridoxal.  [...]

[Biochimie] Construire Une Protéine par chance

Comment puis-je calculer la probabilité q'une protéine quelconque se forme par chance si on a mis tous les 500 acides aminés q'on connait dans la nature dans un mélange sachant que seulement 140 parmi ces acides aminés sont présents dans les protéines et aussi sachant que chaque acide aminé peut être soit L ou D et on doit seulement avoir la configuration L.  [...] C'est ça le problème on ne sait pas si justement ils existaient 2 acides aminés ou plusieurs acides aminés dès le début de vie ce qui rend tous les théories justement des hypothèses on ne peut pas les confirmer.  [...]

[Biochimie] les effet des rayon UV

En se basant sur ce postula, et en sachant que les protéines ainsi que les lipides sont atteints, on peut dire que les hormones seront vraisemblablement touchées. De plus les acides aminés comportent parmi eux certaines configuration moléculaire dites en cycle (comme les a.  [...] a aromatiques) ou la proline, mais également des doubles liaisons comme l'arginine ou l'histidine. Ces configurations permettent de donner la caractéristique aux protéines d'absorber dans l'UV, à 290 nm.  [...]

enzyme et fonctions???

Cela est dû à deux choses. présence d'un site de reconnaissance (spécificité de substrat), et d'un site catalytique (spécificité d'action). La séquence du gène donne la séquence d'acides aminés, qui donne la configuration de la protéine dans l'espace, qui lui donne sa fonction.  [...] il y a énormément de kinases qui ont des dizaines de substrats, par exemple Akt, AMPK, des enzymes métaboliques comme la SCD1. Pour les fonctions, je pense en premier lieu a l'OGT qui a une activité glycolyse transférase et une activité protéolytique, la PKM2 qui est une pyruvate kinase mais qui a des fonctions épigénétiques, etc.   [...]

[Biologie Moléculaire] [biologie moleculaire] Le code génétique

Il y a eu un choix à ce niveau. on a 22 acides aminés, un codon de 3 bases, et 4 bases. Rien n'empèche d'imaginer que ça aurait pu être différent, et rien n'est moins sûr que la configuration terrestre soit optimale. Elle l'est juste pour les codons de 3 bases à condition d'avoir 22 aa et 4 bases différentes.  [...] De plus si un organisme se mettait à utiliser des acides aminés complètement atypiques (et donc non disponibles dans l'envirronement) cela signifierait utiliser une machinerie enzymatique supplémentaires pour les produires (et une dépense énergétique de plus).  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

parler de structure peut s'entendre a plusieurs niveau. séquence en acides aminés, structure dite secondaire, complexe comportant plusieurs sous unités. Conformation s'applique plus a un état de configuration de la molécule.  [...] En plus de ça, les poches catalytiques affichent (peut-être pas toujours) des acides aminés impliqués dans la sélectivité des substrats reconnu (par sélectivité stérique, sélectivité de charge,...) un peu comme un récepteur. Ici intervient donc la nécessité d'une renaturation plus globale de la protéine pour étudier un phénomène différent. l'activité enzymatique.  [...]

Origine de la vie et première cellule

Je ne vois pas en quoi mon objection résulterait d'une mauvaise compréhension. D'une part il est évident que les acides aminés ne peuvent s'enchaîner que par des liaisons peptides, comme tu les décrit (il n'y a donc aucun miracle). Quant à la conformation spatiale elle résulte en partie de mécanismes strictement spontanés, donc déterministes (en particulier l'essentiel de la structure secondaire et une partie de la structure tertiaire) le tout aidé au final par d'autres protéines auxiliaires dont le rôle est de faciliter l'acquisition d'une configuration spatiale correcte.  [...] Pour les molécules plus complexes, (des acides aminés au protéines par exemple), l'un des problèmes majeurs de l'apparition de la vie est de type l'Suf ou la poule.  [...]