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Du génome de la souris à celui de l'homme

Le séquençage du génome de la souris, complété récemment, va probablement apporter son lot de révolutions scientifiques. Avec ses 2,5 milliards de nucléotides, il est 14% plus petit que le génome humain. L'homme et la souris ( Mus musculus ) possèdent 99% de gènes homologues (c'est-à-dire identiques ou proches).  [...] La comparaison du génome de la souris et celui de l'homme devrait permettre de grandes avancées dans la compréhension des maladies génétiques humaines. En effet la souris possède de nombreux outils génétiques qui permettent d'éliminer individuellement les gènes.  [...]

Un vaccin contre le cancer du col de l'utérus

Aux Etats-Unis, au contraire, entre 50 et 60 millions de frottis sont pratiqués chaque année, révélant des anomalies du col de l'utérus qui, le plus souvent, ne deviennent pas cancéreuses, mais exigent toutefois une surveillance attentive et entraînent des interventions chirurgicales.   [...] Puisque le cancer du col de l'utérus est provoqué par la présence des papillomavirus transmis sexuellement, un vaccin préventif pourrait sauver la vie de beaucoup de femmes qui manquent de soins médicaux et permettrait de réaliser des économies de l'ordre de plusieurs milliards de dollars par an aux Etats-Unis.   [...]

Des souris et des hommes !

Les perspectives scientifiques de l'utilisation du modèle de la souris sont très prometteuses. Certaines des études sont notamment réalisées par mutagénèse. la souris est mutée génétiquement en fonction de gènes que l'on veut étudier pour que sa descendance soit analysée ou observée par la suite.  [...] Des résultats qui permettent d'entrevoir les conséquences que pourraient avoir des mutations du même type chez l'Homme, de comprendre plus précisément l'origine et le cours de maladies génétiques et de développer de nouvelles thérapies. Parmi les autres avantages qu'offre la souris, citons sa reproduction rapide, sa taille réduite ou encore la connaissance de son génome, le deuxième génome de mammifère à avoir été décodé après celui de l'Homme.  [...]

[Génétique] Génome humain proche du rat ou de la souris?

L'homme est beaucoup plus proche du primate, mais l'ethique (ainsi que le prix et la vitesse de reproduction il faut dire) limite fortement leur utilisation. C'est pourquoi on se contente la plupart du temps, de travailler sur ces petits rongeurs.  [...] On n'a pas 90% d'homologie avec une espèce. Il y a tant de % de similitude ou d'identité entre des séquences. L'homologie signifie que les espèces proviennent d'un même ancêtre commun. Donc, on est homologue ou on ne l'est pas, mais on ne l'est pas à un pourcentage donné.   [...]

Chine : naissance de souris ayant des parents de même sexe

Notez que dans le cas des souris bipaternelles, la méthode est un peu plus compliquée. Les cellules haploïdes contenant l' ADN d'un parent masculin ont subi la suppression de sept régions clés de leur génome. Elles ont ensuite été injectées, avec le sperme d'un autre mâle, dans un ovule dont le noyau avait été retiré avant d'être transplanté dans une souris mère porteuse.  [...] Evidemment, la question se pose de savoir si une telle technique pourrait être utilisée chez l'Homme. Il est clair qu'en l'état actuel des choses la réponse est non, puisque pour y arriver les chercheurs ont dû faire appel à la transgenèse et manipuler ainsi le génome des souris pour les rendre compatibles, chose difficilement envisageable chez l'Homme.  [...]

La vache est séquencée !

Il aura fallu six ans de travail à une équipe internationale de 300 personnes mais c'est fait. le génome de la vache est séquencé. Au passage, on apprend que ce sympathique animal est plus proche de nous que la souris (ce qui surprend le biologiste). Ce décodage nous renseigne également sur l'évolution des mammifères, les conséquences génétiques de la sélection par l'homme et sur les possibilités d'améliorations à venir.  [...] La première surprise est la ressemblance avec le génome humain. Nos propres gènes sont en effet plus proches de ceux de la vache que de ceux des rongeurs (souris et rats notamment). Or, dans la lignée qui a conduit à l'être humain, le dernier ancêtre commun ( DAC ) avec les rongeurs est plus récent que le DAC avec les ongulés (dont font partie les vaches), et que l'on situe vers 95 millions d'années dans le passé.  [...]

Les cas très graves de grippe s'expliqueraient par la génétique

Pour tester cette hypothèse, ils ont séquencé le génome entier d'une enfant de sept ans ayant contracté une forme très sévère de grippe (souche A(H1N1)) nécessitant son hospitalisation en service de réanimation pédiatrique en janvier 2011 à l'âge de deux ans et demi.  [...] Cette analyse couplée à celle du génome de ses parents a permis de mettre en évidence que la petite fille avait hérité un allèle muté du gène codant pour le facteur de régulation IRF7 de chacun de ses deux parents. Ce dernier est un facteur de transcription connu pour amplifier la production d' interférons en réponse à une infection virale chez la souris et chez l'Homme.  [...]

taille du génome. - Page 2

Chez la souris, c'est 35% et si on fait le calcul, les transposons expliquent quasiment à eux seuls la différence de taille de génome par rapport à l'homme.  [...] mais on peut retourner la question. dans le cas où certaines fonctions utiles à l'hôte sont accomplies par le parasite (ou plutôt symbionte dans ce cas), on peut considérer que les gènes du parasite sont une partie de génome de l'hôte délocalisé. C'est le cas chez l'homme, qui héberge des bactéries dans son tube digestif, et donc on devrait peut-être considérer le génome de ces bactéries comme une partie du génome de l'homme.  [...]

CRISPR-Cas9 : les ciseaux génétiques sont-ils dangereux ?

Plus précisément, comme nous le décrivions dans l'article ci-dessous, les chercheurs ont essayé de corriger une mutation chez des souris en utilisant CRISPR. Ensuite, ils ont recherché des modifications dans tout le génome de deux souris traitées avec CRISPR et les ont comparés à celui d'une souris témoin.  [...] En plus de soulever des questions éthiques sur la modification du génome, les ciseaux moléculaires n'apparaissent pas totalement sûrs. En mai 2017, une étude montrait que des souris ainsi modifiées portaient des centaines de mutations inattendues.  [...]

[Divers] Quels tests statistiques pour ce jeu de données?

Je travaille sur un projet de transcriptome chez la souris. Le travail consiste à comparer les profiles d'expression de tous les gènes dans 3 conditions (individus).  [...] Pour chaqu'une de ces conditions (témoin, souris mutant, et souris double mutant) j'utilise 5 individus pour en extraire les RNA totaux, synthétiser les cDNA marquées et les hybrider ensuite sur des lames Oligochip contenant tout le génome de la souris.  [...]