• Santé - Génome, ARN, Séquence

[Biologie Moléculaire] micro ARN, ARN anti-sens et ARN interférent

Je ne suis pas très calée sur l'ARN antisens, en revanche ARN interférent c'est un terme global qui désigne les siRNAs, les micro-RNAs, les longs ARNs doubles brins clivés en siRNAs etc... tous les ARNs entrant dans la voie dite ARN interférence c'est-à-dire faisant intervenir le complexe de silencing RISC, et qui conduisent soit à la dégradtion d'un ARNm cible ou à l'inhibition de sa traduction.  [...] Ils peuvent être endogènes, c'est le cas des micro-ARNs dont les précurseurs sont transcrits à partir du génôme. les siRNAs proviennent le plus souvent de séquence d'ARN double brin introduites de manière exogène même s'il a été montré chez la drosophile notamment l'existence de siRNAs endogènes produits à partir de transposons (éléments mobiles du génôme).  [...]

[Biologie Moléculaire] repliement de molécules

En fait, mon sujet est un sujet d'informatique (C++), et nous pouvons choisir nos sujets. Le prof a suggéré, entre autres, dans le domaine de la bio-informatique, le repliement des molécules, sans rien précisé d'autres. Donc la biologie ici n'est qu'un support à l'info.   [...] Il y a un livre très bien fait, très didactique. Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis, David W. Mount, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2004. Le chapitre 8 parle de prédiction de structures secondaires pour l'ARN, le chapitre 10 - pour les protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène Chevauchant ça veux dire quoi ?

Une autre particularité du génome procaryote, est le nombre relativement réduit de séquence non-codante. Déjà, il faut prendre ce terme avec des pincettes car il peut contenir des gènes que l'on n'a pas encore formellement identifié. Ensuite, ces séquences non-codantes, peuvent également correspondre à des séquences impliquées dans la régulation génique.  [...] Pour récapituler. dans le génome procaryote, on n'a pas encore trouvé de cas où la séquence codante était interrompue par une séquence non-codante (les introns). Mais à l'intérieur d'ARN polycistroniques, il y a des séquences qui ne codent rien entre les séquences codantes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Code génétique

vous mélangez un peu tout... Chaque cellule comporte dans son noyau le même génome (mêmes chromosomes d'ADN avec la même séquence). Mais dans chaque cellule, seuls certains gènes s'expriment (selon le type cellulaire). Les gènes eucaryotes sont quasi exclusivement composés d'introns (qui sont épissés des ARNs messagers immatures) et d'exons qui sont conservés dans les ARNs messagers matures, et ce, après la transcription en ARN des gènes qui s'expriment.  [...] Un gène est par définition une séquence d'ADN qui code pour une protéine (seulement 5% du génome environ). Pour le reste, il y a des séquences non codantes, d'autres qui sont transcrites mais non traduites (ARN non codants pour des processus de régulation), etc,  [...]

Vaccins antigrippaux : la génétique inverse et les cultures cellulaires | Dossier

Une autre méthode, utilisant le même type de système, est basée sur la transcription in vivo des vRNA par l'ARN polymerase I (pol I) cellulaire. il y a production intracellulaire des complexes RNP. Dans ce système, l'ADNc codant pour les vRNA est inséré entre les séquences promoteur et terminale de pol I.  [...] un plasmide pour la transcription des huit ARN viraux. chacune des huit unités de transcription comprend le promoteur d'origine humaine de pol I, l'ADNc de polarité négative codant un segment du génome viral, et la séquence terminator de pol I d'origine murine.  [...]

Vaccination contre le Sida : pourquoi est-ce un échec ? | Dossier

Au-delà de cet aspect, le virus du Sida est en plus très variable. En réalité, la transcriptase inverse, l' enzyme permettant de créer un brin d' ADN à intégrer dans le génome à partir de l' ARN viral, commet régulièrement des erreurs. La séquence du virus s'en trouve altérée, et de ce fait, il n'exprime pas toujours les mêmes protéines à la surface.  [...] Après études de patients, il s'est avéré que 20 % des personnes séropositives présentaient dans leur sang les traces d' anticorps surpuissants contre le VIH. En effet, le virus mute à une très haute fréquence, si bien qu'il existe de très nombreux variants au sein d'un même patient.   [...]

[Génétique] Dynamique des éléments transposables ( transposons) !

Pour ceux sans LTR. sequence capable de se reproduire dans le genome en faisant transcription en ARNm puis traduction cytoplasmique en trois proteines et ces trois proteines vont s'attacher a l'ARNm, celui ci repasse dans le noyeau et la une des proteines coupe l'ADN a un endroit precis une autre (reverse transcriptase ) fait passer l'ARN en ADN et la troisieme (integrase) integre cet ADN dans le genome.  [...] Pour ceux avec LTR. et ben je comprend pas le mecanisme de reproduction dans le genome.J'ai note que c'etait pareil que pour les transposons sans LTR sauf qu'il n'y avait pas de passage en ARN mais ca me semble tres bizarre... comment coder de proteines si il n'y a pas de passage en ARN.  [...]

Est-ce que tous les gènes codent des protéines

C'est la définition la plus large, mais il faut noter que certains virus (qui, il faut rappeler, ne sont pas des entités vivantes) ont un génome purement ARN. On peut donc généraliser la définition d'un gène à une séquence nucléotidique susceptible d'être transcrit (toutes les cellules n'expriment pas tous leurs gènes).  [...] Depuis une quinzaine d'années, en complément de l'étude toujours plus poussée du génome humain, on est passé au recensement et à l'étude du transcriptome humain, c'est-à-dire la part des séquences d'ADN qui est effectivement transcrite en brins d'ARN. Pour donner un ordre de grandeur, On a recensé environ 207.  [...]

Séquençage du génome du virus de la pneumonie atypique

Une équipe de chercheurs Canadiens a publié samedi dernier, la séquence complète du coronavirus suspecté d'être responsable de l'épidémie atypique qui sévit actuellement dans le monde. Le séquençage du génome du virus devrait permettre le développement de nouveaux tests de diagnostic ainsi que la mise au point d'un éventuel vaccin.  [...] La séquence confirme les résultats antérieurs sur l'origine du virus. Une boucle d' ARN à l'extrémité 3' du génome rapproche ce virus du virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV), qui touche principalement les dindes et les poulets. Certaines séquences d' ADN présentent des similarités avec le coronavirus de bovin ou avec le coronavirus causant des hépatites chez la souris.  [...]

Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

000 gènes destinés à être traduits en protéines. Le reste, disait-on, ne serait que des vestiges des gènes ancestraux ou même des séquences muettes, soi-disant voués à diluer les potentielles mutations acquises par le génome au cours de l' évolution. Pourtant, de plus en plus, les chercheurs découvrent que les zones non codantes sont aussi d'une importance capitale.  [...] Pour comprendre la suite, revenons au mécanisme du gene silencing. De petits ARN ( miRNA ), d'une vingtaine de nucléotides, codés par le génome ont pour cibles les ARN messagers possédant la séquence complémentaire, pour les dégrader ou en inhiber l'expression.  [...]